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PSICO公司

swMATH ID: 10910
软件作者: 路德维希·克里帕尔;佩德罗·巴拉奥纳
描述: PSICO:用约束编程和优化求解蛋白质结构。在本文中,我们提出PSICO(使用约束编程和优化处理结构信息)作为一种基于约束的方法,用于确定与从核磁共振(NMR)数据中获得的距离约束兼容的蛋白质结构。我们将我们提出的算法与基于模拟退火的现有商业应用程序DYANA(“NMR应用程序的动态算法”)的性能进行了比较。在含有二聚体蛋白脱硫多辛实验数据的测试案例中,与DYANA大约10小时的计算时间相比,本文提出的方法在不到10分钟的时间内提供了类似的结果。虽然结果的质量仍然可以提高,但这表明CP技术可以大大减少计算时间,这是一个主要优点,因为结构核磁共振技术通常需要多次结构计算。
主页: http://link.springer.com/article/10.1023%2FA%3A102057763762
关键词: 约束编程;优化;蛋白质结构;生物信息学
相关软件: 椰子;全球实验室;BARON公司;国际实验室;国际博协;InC公司++;JGlopt实验室;并入PT_90;UniCalc公司;卢鲁帕;牛顿;数字;COPRIN公司;RealPaver公司;GLOPT公司;更大的
引用于: 9文件

4篇连载文章中引用

2 约束条件
1 比特币
1 AI通信
1 全球优化杂志

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