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泛素样超家族

根目录：	SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别：	α和β蛋白（a+b）[ 53931] (376)
折叠：	β-抓（泛素样）[ 54235] (14)
超级家族:	类泛素[ 54236] (8)
家庭：	泛素相关[ 54237] (38)
	UBX域[ 54250] (5)
	GABARAP类[ 54253] (3)
	FERM的第一个域[54256个] (6)
	Ras结合域，RBD[ 54263]（13）
	BM-002类[ 75362] (3)
	类似APG12[ 142972]
	DIX域[ 159926]

超级家庭统计

	基因组(632)	Uniprot 2018_03基因组	PDB链（SCOP1.75)
域	49,260	132,153	156
蛋白质	41,531	112,843	155

功能注释

一般类别	概述
详细类别	概述

文档：SCOP域超家族的功能注释

酶委员会（EC）

(显示详细信息)

	EC术语	FDR（全部）	SDEO水平	注释（直接或继承）
酶委员会（EC）	作用于肽键（肽水解酶）	零点零零零零零零零零零零零零零五六零九	信息最少	直接
酶委员会（EC）	作用于酯键	0.0102	信息最少	继承
酶委员会（EC）	氧化还原酶类	1	信息最少	继承
酶委员会（EC）	ω肽酶	0	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	蛋白质-氨基酸/苏氨酸激酶	0.000000000004359	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	磷酸单酯水解酶	0.0000000004443	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	以醇基为辅基的磷酸转移酶	0.00003067	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	代表CH-CH捐赠者小组	0.00289	信息量适中	继承
酶委员会（EC）	非特异性蛋白酪氨酸激酶	0.0000000000001949	信息	直接
酶委员会（EC）	蛋白质酪氨酸磷酸酶	0.00000366	信息	直接
酶委员会（EC）	磷脂酰肌醇-4-磷酸3-激酶	0	高度信息化	直接
酶委员会（EC）	磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶	0	高度信息化	直接
酶委员会（EC）	磷脂酰肌醇3-激酶	0.000000000612	高度信息化	直接

文档：SCOP域的EC注释

疾病本体（DO）

(显示详细信息)

	DO术语	FDR（全部）	SDDO级别	注释（直接或继承）
疾病本体（DO）	细胞型癌	0.5555	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	恶性胶质瘤	0.5741	信息	继承

文档：SCOP域的DO注释

人类表型（HP）

(显示详细信息)

	HP术语	FDR（全部）	SDHP水平	注释（直接或继承）
继承模式（MI）	体细胞突变	0.0004828	信息	直接
表型异常（PA）	头部异常	0.4308	信息最少	继承
表型异常（PA）	肿瘤	0.1412	信息量适中	继承
表型异常（PA）	呼吸系统异常	0.3727	信息量适中	继承
表型异常（PA）	口腔形态异常	1	信息量适中	继承
表型异常（PA）	上呼吸道异常	0.2448	信息	继承
表型异常（PA）	牙列异常	0.3721	信息	继承
表型异常（PA）	肺形态异常	0.5888	信息	继承
表型异常（PA）	气管支气管形态异常	0.2198	高度信息化	继承

文档：SCOP域的HP注释

小鼠表型（MP）

(显示详细信息)

	MP术语	FDR（全部）	SDMP级别	注释（直接或继承）
哺乳动物表型（MP）	胚胎表型	0.2532	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	肿瘤	0.5116	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	胚胎外组织形态异常	0.0224	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	错构瘤发病率增加	0.000801	高度信息化	直接

文档：SCOP域的MP注释

蠕虫表型（WP）

(显示详细信息)

	WP术语	FDR（全部）	SDWP水平	注释（直接或继承）
蠕虫表型（WP）	细胞形态变异	0.0003729	信息最少	直接
蠕虫表型（WP）	生物代谢过程变体	0.001275	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	细胞生理变异	0.006513	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	细胞发育变异体	0.01635	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	生物行为变异体	0.3739	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	蛋白质相互作用变体	0.00004565	信息量适中	直接
蠕虫表型（WP）	肌肉细胞生理变异	0.0002359	信息	直接
蠕虫表型（WP）	上皮系统发育变异	0.1823	信息	继承
蠕虫表型（WP）	体肌营养不良	0.0000001518	高度信息化	直接
蠕虫表型（WP）	原肠胚变体	0.000139	高度信息化	直接
蠕虫表型（WP）	电池极性变化	0.0005498	高度信息化	直接
蠕虫表型（WP）	上皮发育变异	0.006089	高度信息化	继承
蠕虫表型（WP）	细胞数量减少	0.2244	高度信息化	继承

文档：SCOP域的WP注释

酵母表型（YP）

(显示详细信息)

	YP术语	FDR（全部）	SDYP级别	注释（直接或继承）
酵母表型（YP）	新陈代谢和生长	0.1854	信息最少	继承
酵母表型（YP）	蛋白质/肽积累	0.0001303	高度信息化	直接
酵母表型（YP）	性周期	0.02105	高度信息化	继承

文档：SCOP域的YP注释

斑马鱼解剖学（ZA）

(显示详细信息) 文档：SCOP域的ZA注释

爪蟾解剖学（XA）

(显示详细信息)

	XA术语	FDR（全部）	SDXA级别	注释（直接或继承）
爪蟾非原子实体（XAN）	头	0.0009265	信息最少	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	神经系统	0.00166	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	空泡复合器官	0.2455	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	脑	0.0002655	信息量适中	直接

文档：SCOP域的XA注释

拟南芥植物本体（AP）

(显示详细信息)

	AP术语	FDR（全部）	SDAP级别	注释（直接或继承）
植物非原子实体（PAN）	花粉管细胞	0.0000007609	信息	直接
植物非原子实体（PAN）	配子	0.0005298	信息	直接
工厂结构开发阶段（PDE）	花粉发育期	0.000003323	信息量适中	直接

文档：SCOP域的AP注释

酶委员会（EC）

(显示详细信息)

	EC术语	FDR（全部）	SDEC级	注释（直接或继承）
酶委员会（EC）	转移含磷基团	0.0000000001648	信息最少	直接
酶委员会（EC）	水解酶类	0.0000000008392	信息最少	直接
酶委员会（EC）	氧化还原酶类	1	信息最少	继承
酶委员会（EC）	氨酰转移酶类	0	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	作用于肽键（肽酶）	2.574e-16	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	蛋白质-氨基酸/苏氨酸激酶	0.0000000002786	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	磷酸单酯水解酶	0.000000002276	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	以醇基为受体的磷酸转移酶	0.0000004051	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	ω肽酶	0	信息	直接
酶委员会（EC）	蛋白质酪氨酸磷酸酶	0.000001851	信息	直接
酶委员会（EC）	蛋白质酪氨酸激酶	0.000008754	信息	直接
酶委员会（EC）	以NAD（+）或NADP（+）为受体	0.00005231	信息	直接
酶委员会（EC）	磷酸二酯水解酶	0.003827	信息	继承
酶委员会（EC）	非特异性蛋白酪氨酸激酶	0.000000000001552	高度信息化	直接
酶委员会（EC）	磷酰肌醇磷脂酶C	0.00000001195	高度信息化	直接

文档：SCOP域的EC注释

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内部数据库链接

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浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质不同的结构域组合，包括泛素样结构域。

检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一种超家族或家族如何被限制在某些生命王国的直接印象。

探索域发生网络，其中节点表示基因组，边缘是包含感兴趣超家族的域架构（基因组之间共享）。

有160个隐马尔可夫模型代表泛素样超家族。关于如何构建模型的信息，以及显示疏水性,匹配发射概率和插入/删除概率可以检查。

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