• 版本:
  • 12
字符串字符串
STRING蛋白相互作用网络
节点:
网络节点代表蛋白质
剪接亚型或翻译后修饰被折叠,即每个节点代表由单个蛋白质编码基因位点产生的所有蛋白质。
节点颜色
彩色节点:
查询蛋白和第一层相互作用体
白色节点:
交互器的第二个shell
节点内容
空节点:
未知3D结构的蛋白质
填充节点:
已知或预测3D结构
边缘:
边缘代表蛋白质关联
关联是指特定的和有意义的,即蛋白质共同贡献共同的功能;这并不一定意味着它们在物理上相互绑定。
已知交互
来自精选数据库
实验测定的
预测的交互
基因邻域
基因融合
基因共现
其他
文本挖掘
共同表达
蛋白质同源性
您的意见:
邻里关系
基因融合
冷却
共同表达
实验
数据库
文本挖掘
[同源]
得分
DVU_2680型黄酮多辛;一些氧化还原酶的低电位电子供体;属于黄曲霉毒素家族。(148 aa)    
预计功能合作伙伴:
poR公司
丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶;通过与GP:1770208的相似性识别;与HMM PF00037蛋白家族匹配;与蛋白家族HMM PF01558匹配;与HMM PF01855蛋白家族相匹配。
  
  
 0.708
立方厘米B
细胞色素c型生物发生蛋白CcmB。
      
 0.704
拖把
醛氧化还原酶;通过与SP:Q46509的相似性识别;与蛋白家族HMM PF00111匹配;与蛋白家族HMM PF01315匹配;与蛋白家族HMM PF01799匹配;与HMM PF02738蛋白家族相匹配。
     
 0.508
孔A
丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶,α亚基;通过与GP:43498的相似性识别;与蛋白家族HMM PF01558匹配;与HMM PF01855蛋白家族相匹配。
  
  
 0.505
波兰
DNA聚合酶I;通过与SP的相似性识别:P00582;与蛋白家族HMM PF00476相匹配;与蛋白家族HMM PF01367匹配;与HMM PF02739蛋白家族匹配;与HMM TIGR00593蛋白家族相匹配。
      
 0.469
普塔
脯氨酸脱氢酶/δ-1-吡咯烷-5-羧酸脱氢酶;将脯氨酸氧化为谷氨酸,用作碳源和氮源;属于醛脱氢酶家族。在N端区段;属于脯氨酸脱氢酶家族。
  
 
 0.461
DVU_1220型
通过与HMM PF00037蛋白家族的匹配进行鉴定;与蛋白质家族HMM PF00881匹配。
  
  
 0.448
DVU_2679型
感觉盒组氨酸激酶/反应调节剂;通过与HMM PF00072蛋白家族的匹配鉴定;与蛋白家族HMM PF00512匹配;与HMM PF02518蛋白家族相匹配;与蛋白质家族HMM TIGR00229匹配。
  
 
 0.428
您当前的有机体:
希尔登堡普通脱硫弧菌
NCBI分类Id:882
其他名称:D.vulgaris str.Hildenborough,Desulfovibrio vulgarias(菌株Hildenborough),Desulsovibrio vigaris ATCC 29579,Desulvovibrio vegaris str.Hildenborough和Desulfovirio vulgaries subsp。普通脱硫弧菌(Hildenborough株)。普通型ATCC 29579,普通型脱硫弧菌亚种。希尔登堡街vulgaris str.Hildenborough
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