roo蛋白（巨大脱硫弧菌）-STRING相互作用网络

节点：

网络节点代表蛋白质

剪接亚型或翻译后修饰被折叠，即每个节点代表由单个蛋白质编码基因位点产生的所有蛋白质。

节点颜色

彩色节点：
查询蛋白和第一层相互作用体

白色节点：
交互器的第二个shell

节点内容

空节点：
未知3D结构的蛋白质

填充节点：
已知或预测3D结构

边缘：

边缘代表蛋白质关联

关联是指特定的和有意义的，即蛋白质共同贡献共同的功能；这并不一定意味着它们在物理上相互绑定。

已知交互

来自精选数据库

实验测定的

预测的交互

基因邻域

基因融合

基因共现

其他

文本挖掘

共同表达

蛋白质同源性

您的意见：

邻里关系

基因融合

冷却

共同表达

实验

数据库

文本挖掘

[同源]

得分

鲁奥

推测链A，链B，红血球氧化还原酶；催化一个氧分子四电子还原为两个水分子。（402 aa）

预计功能合作伙伴：

第个

0.932

DGI_2117号

0.893

DGI_1167

0.843

hcp公司

0.798

DGI_2097

0.796

国家实验室

0.744

DGI_2220型

0.708

数字减影器

0.694

DGI_1241

0.688

poR公司

0.671

您当前的有机体：

巨大脱硫弧菌

NCBI分类Id：1121448
其他名称：D.gigas DSM 1382=ATCC 19364，Desulfovibrio gigas ATCC 19364

将网络发送到Cytoscape

导出当前网络：

…作为位图图像：

下载

文件格式为“PNG”：可移植网络图形

…作为高分辨率位图：

下载

相同的PNG格式，但分辨率更高

…作为矢量图形：

下载

SVG：可缩放矢量图形-可以在Illustrator、CorelDraw、Dia等中打开和编辑

…作为简短的表格文本输出：

下载

TSV：制表符分隔值-可以在Excel和Cytoscape中打开（仅列出单向边：A-B）

…作为表格文本输出：

下载

TSV：制表符分隔值-可以在Excel中打开（列出倒数边：A-B、B-A）

…作为XML摘要：

下载

结构化XML交互数据，根据“PSI-MI”数据标准

…蛋白质节点度数：

下载

网络中蛋白质的节点度（给定当前分界）

…网络坐标：

下载

描述网络中节点坐标和颜色的平面文件格式

…蛋白质序列：

下载

MFA：多fasta格式-包含网络中的氨基酸序列

…蛋白质注释：

下载

一个以tab分隔的文件，描述网络中蛋白质的名称、域和描述

…功能注释：

下载

一个以tab分隔的文件，其中包含网络中所有已知的protien功能术语

以表格形式浏览交互：

节点1	节点2	节点1加入	节点2加入	节点1注释	节点2注释	分数
DGI_1167	DGI_2097	DGI_1167	DGI_2097	假定的红血红素样蛋白；属于rubredoxin家族。	推测亚硝酸盐和亚硫酸盐还原酶4Fe-4S区域。	0.935
DGI_1167	DGI_2117号	DGI_1167型	DGI_2117号	假定的红血红素样蛋白；属于rubredoxin家族。	推测FAD依赖的吡啶核苷酸二硫氧化还原酶。	0.870
DGI_1167	数字减影器	DGI_1167	DGI_3485型	假定的红血红素样蛋白；属于rubredoxin家族。	脱硫多辛。	0.664
DGI_1167	hcp公司	DGI_1167	DGI_1496	假定的红血红素样蛋白；属于rubredoxin家族。	假定羟胺还原酶；催化羟胺还原形成NH（3）和H（2）O。	0.611
DGI_1167	国家实验室	DGI_1167	DGI_3082	假定的红血红素样蛋白；属于rubredoxin家族。	推测的超氧化物歧化酶。	0.664
DGI_1167	poR公司	DGI_1167	DGI_0996	推定的红细胞介素样蛋白；属于rubredoxin家族。	推测丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶；属于丙酮酸：铁氧还蛋白/黄烷氧还蛋白氧化还原酶家族。	0.591
DGI_1167	鲁奥	DGI_1167	DGI_1622	假定的红血红素样蛋白；属于rubredoxin家族。	推测链A，链B，红血球氧化还原酶；催化一个氧分子四电子还原为两个水分子。	0.843
DGI_1241	poR公司	DGI_1241	DGI_0996	推测GGDEF域蛋白。	推测丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶；属于丙酮酸：铁氧还蛋白/黄烷氧还蛋白氧化还原酶家族。	0.632
DGI_1241型	鲁奥	DGI_1241	DGI_1622	推测GGDEF域蛋白。	推定链A，链B，红曲霉毒素氧氧化还原酶；催化一个氧分子四电子还原为两个水分子。	0.688
DGI_2097	DGI_1167	DGI_2097	DGI_1167	推测亚硝酸盐和亚硫酸盐还原酶4Fe-4S区域。	假定的红血红素样蛋白；属于rubredoxin家族。	0.935
DGI_2097	DGI_2117号	DGI_2097型	DGI_2117号	推测亚硝酸盐和亚硫酸盐还原酶4Fe-4S区域。	推测FAD依赖的吡啶核苷酸二硫氧化还原酶。	0.939
DGI_2097	hcp公司	DGI_2097	DGI_1496	推测亚硝酸盐和亚硫酸盐还原酶4Fe-4S区域。	假定羟胺还原酶；催化羟胺还原形成NH（3）和H（2）O。	0.848
DGI_2097型	第个	DGI_2097	DGI_1624	推测亚硝酸盐和亚硫酸盐还原酶4Fe-4S区域。	假定链A rubredoxin。	0.935
DGI_2097	roo公司	DGI_2097	DGI_1622	推测亚硝酸盐和亚硫酸盐还原酶4Fe-4S区域。	推测链A，链B，红血球氧化还原酶；催化一个氧分子四电子还原为两个水分子。	0.796
DGI_2117号	DGI_1167	DGI_2117号	DGI_1167	推测性FAD依赖性吡啶核苷酸二硫化物氧化还原酶。	假定的红血红素样蛋白；属于rubredoxin家族。	0.870
DGI_2117号	DGI_2097	DGI_2117号	DGI_2097	推测FAD依赖的吡啶核苷酸二硫氧化还原酶。	推测亚硝酸盐和亚硫酸盐还原酶4Fe-4S区域。	0.939
DGI_2117号	hcp公司	DGI_2117型	DGI_1496	推测FAD依赖的吡啶核苷酸二硫氧化还原酶。	假定羟胺还原酶；催化羟胺还原形成NH（3）和H（2）O。	0.738
DGI_2117号	第个	DGI_2117号	DGI_1624	推测FAD依赖的吡啶核苷酸二硫氧化还原酶。	假定链A rubredoxin。	0.870
DGI_2117号	鲁奥	DGI_2117号	DGI_1622	推测FAD依赖的吡啶核苷酸二硫氧化还原酶。	推测链A，链B，红血球氧化还原酶；催化一个氧分子四电子还原为两个水分子。	0.893
DGI_2220型	poR公司	DGI_2220型	DGI_0996	假定甲基接受趋化性传感器。	推测丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶；属于丙酮酸：铁氧还蛋白/黄烷氧还蛋白氧化还原酶家族。	0.622