示例
从中选择所有分类群 UniProt分类 选择？ 分类单元 发件人< http://sparql.uniprot.org/分类法 > 哪里 { ? 分类单元a up：分类单元。 } 从中选择所有细菌分类群及其学名 UniProt分类 选择？ 分类单元？ 名称 哪里 { ? 分类单元a up：分类单元。 ? 分类单元向上：科学名称？ 名称。 #Taxon子类是物化的，不要使用rdfs:subClassOf+ ? 分类单元rdfs:subClassOf分类单元：2。 } 选择所有UniProt条目及其有机体和氨基酸序列（包括异构体） 大肠杆菌K12 及其所有菌株 选择？ 蛋白质？ 生物体？ 亚型？ 序列 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质。 ? 蛋白质向上：生物体？ 有机体。 #Taxon子类是物化的，不要使用rdfs:subClassOf+ ? 生物rdfs：分类单元亚类：83333。 ? 蛋白质向上：序列？ 亚型。 ? 异型rdf：价值？ 顺序。 } 用键选择UniProt条目 记忆的 “A4_HUMAN” 选择？ 蛋白质 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质。 ? 蛋白质向上：助记符“A4_HUMAN” } 使用UniProt交叉引用选择UniProt到PDB条目的映射 PDB公司 数据库 选择？ 蛋白质？ 数据库 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质。 ? 蛋白质rdfs：请参阅另外？ 数据库。 ? db-up：数据库< http://purl.uniprot.org/database/PDB > } 选择该类别的外部数据库的所有交叉引用 “3D结构数据库” 使用关键字分类的UniProt条目的数量 ‘丙酮生物合成（KW-0005）’ 选择DISTINCT？ 链接 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质。 ? 蛋白质向上：分类关键字：5。 ? 蛋白质rdfs：参见？ 链接。 ? 链接：数据库？ 数据库。 ? db-up：类别“3D结构数据库” } 选择审查过的UniProt条目（Swiss-Prot）及其推荐的蛋白质名称，其首选基因名称包含文本“DNA” 选择？ 蛋白质？ 名称 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质。 ? 蛋白质向上：审查属实。 ? 蛋白质up：推荐名称？ 推荐。 ? 推荐使用：fullName？ 名称。 ? 蛋白质向上：由编码？ 基因。 ? gene skos：prefLabel？ 文本。 过滤器包含（？文本，“DNA”） } 选择已知与疾病有关的所有人类UniProt条目的首选基因名称和疾病注释 选择？ 姓名？ 文本 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质。 ? 蛋白质up：生物体分类单元：9606。 ? 蛋白质向上：由编码？ 基因。 ? gene skos：prefLabel？ 姓名。 ? 蛋白质向上：注释？ 注释。 ? 注释：Disease_annotation。 ? 注释rdfs：注释？ 文本 } 选择具有导致“功能丧失”的序列变量的所有人类UniProt条目 选择？ 蛋白质？ 文本 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质。 ? 蛋白质向上：生物分类单元：9606。 ? 蛋白质向上：注释？ 注释。 ? 注释a up：Natural_Variant_annotation。 ? 注释rdfs：注释？ 文本。 过滤器（包含（？文本，“功能丧失”） } 选择所有具有导致酪氨酸到苯丙氨酸替换的序列变体的人类UniProt条目 选择？ 蛋白质？ 注释？ 开始吗？ 文本 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质； up：生物分类单元：9606； 向上：注释？ 注释。 ? 注释a up：Natural_Variant_annotation； rdfs：评论？ 文本； 向上：替代？ 替代； 向上：范围/法尔多：开始 [faldo：位置？开始； 法尔多：参考？ 序列]。 ? 序列rdf：值？ 值。 BIND（substr（？value，？begin，1）as？ 原件）。 过滤器（？原始=“Y”&&？替换=“F”）。 } 选择所有带注释跨膜区域的UniProt条目以及规范序列上区域的开始和结束坐标 选择？ 蛋白质？ 开始吗？ 结束 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质。 ? 蛋白质向上：注释？ 注释。 ? 注释a up：Transmemble_annotation。 ? 向上注释：范围？ 范围。 ? 范围faldo:begin/faldo:position？ 开始。 ? 范围faldo:end/faldo:position？ 结束 } 选择2010年11月30日集成的所有UniProt条目 选择？ 蛋白质 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质。 ? 蛋白质向上：创建于“2010-11-30”^^xsd:date } 2013年1月9日是否整合了任何UniProt条目 提问 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质。 ? 蛋白质向上：创建于‘2013-01-09’^^xsd:date } 从所有人类UniProt条目中构建“HumanProtein”类型的新三联体 施工 { ? 蛋白质a up：人类蛋白质。 } 哪里 { ? 蛋白质a up：蛋白质。 ? 蛋白质up:9606 } 选择与EMBL CDS条目AA089367.1相关的所有三元组： 描述< http://purl.uniprot.org/embl-cds/AAO89367.1 > 更多示例