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β-内酰胺类抗生素的核心来源于某些微生物初级代谢的氨基酸。β-产乳酸菌,包括棒状链霉菌,通过赖氨酸的分解代谢分两步合成氨基酸α-氨基己二酸的前体。第二个反应是由NAD催化哌啶-6-羧酸盐(或其开链形式的α-氨基己二酸半醛)氧化为α-氨基己二酸+-依赖性酶哌啶-6-羧酸脱氢酶(P6CDH)。该结构研究侧重于配体结合和催化,展示了P6CDH的结构棒状链球菌以载脂蛋白形式并与辅因子NAD复合+产物α-氨基己二酸和底物类似物吡啶酸。P6CDH采用普通的醛脱氢酶折叠,由NAD结合域、催化域和齐聚域组成。产品在氧阴离子孔中结合,靠近催化残渣Cys299。在二元复合物中,包括烟酰胺核苷在内的整个辅因子都观察到清晰的密度。北美+以延伸构象结合,其烟酰胺环与产物羧酸基团的结合位点重叠,这意味着辅因子的构象可能在催化过程中发生变化。底物类似物的结合位点与产物的结合位点重叠,表明底物的环状形式哌啶-6-羧酸盐可能被酶接受为底物。根据这些结果讨论了催化机理和各个残基的作用。

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