国际结晶学联合会\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标生物
结晶学
国际标准编号:1399-0047

大分子配位和实验数据的沉积和释放指南

生物大分子委员会最近的讨论证实,支持修改关于沉积和释放大分子坐标和实验数据的现有准则。

因此,IUCr采纳了Baker&Saenger的建议[Baker&Saenger(1999),《水晶学报》。D类55,2–3],稍作修改。我们认识到,首要动机是确保数据得到保存,并将其免费提供给科学界。我们还意识到,有一种强烈的感觉,即在特殊情况下,数据发布后的某些延迟可能是有理由的。贝克和塞恩格的文章对这些道德问题进行了广泛的探讨。

对已发表声明的修改涉及以下几点。

()也就是说,结构系数振幅的处理方式与坐标相同。也就是说,可以要求从发布之日起最多延迟六个月,但通常应在相关文章发布之日提供。

(b)对ID代码的发布进行修改,以显示相关PDB或NDB条目代码。

修改后的建议全文如下。

建议

1.存款

所有在单个原子位置水平上描述大分子三维结构的出版物必须同时在适当的数据库(PDB或NDB)中沉积原子坐标和结构因子振幅。对于仅报告链迹的低分辨率结构,会报告一组Cα位置和结构系数振幅可能就足够了。

2.ID代码的发布

在提供相关PDB或NDB条目代码之前,文章不应最终被期刊接受出版。这些条目代码应该在文本和摘要(或文章标题信息)中引用,以便抽象服务访问它们。作为最终验收过程的一部分,还敦促日记账检查是否确实保存了适当的数据。

3.发布

作者应在出版日期后立即发布原子参数和结构因子振幅。这应该是正常的做法。然而,他们可以要求延迟六个月发布原子参数数据和结构因子振幅。

4.其他方面

IUCr承认公共资助研究的结果应公开的原则。虽然这是不同国家的资助机构的事情,但IUCr鼓励晶体学家向公共领域的资助机构施加压力,要求其坚持沉积原子参数和结构因子振幅,并要求在出版时发布。IUCr还敦促晶体学家利用他们的影响力,确保所有发表有关大分子三维结构文章的期刊都需要沉积原子参数和结构因子振幅。

脚注

信函应发送至澳大利亚新南威尔士州悉尼大学生物化学系生物大分子委员会主席Mitchell Guss,电子邮件:m.guss@biochem.usyd.edu.au。