通过两步法获得了H2O缓冲液中木糖异构酶的一致SANS图谱。首先,使用数据合并工具(ATSAS 3.1.0)生成了七个蛋白质浓度为0.95–2.4 mg/mL的样本的一致批数据集,并应用了离群值和错误过滤器。随后,将所得曲线与两个样品在6.8 mg/mL下测得的s>0.4 nm-1的数据合并。所有数据均为独立测量值,且在贡献的散射剖面集中,没有任何单个测量值出现多次。缓冲液为50 mM Tris,pH 7.5,100 mM NaCl。CRYSON和Pepsi-SANS拟合的木糖异构酶原子模型是PDB ID 1MNZ四聚体,使用PyMol添加N末端Met,并去除小分子结晶剂。自定义WAXSiS型计算(使用中子散射因子和Gromacs软件)使用相同的坐标,并为MD计算添加显式水和适当数量的离子。
datcombine的数据输入可在相关的zip文件中下载,其中还包括未提取的6列格式数据和分辨率数据。模型拟合按顺序显示(从上到下):CRYSON、Pepsi-SAN和自定义WAXSiS(具有中子散射因子)。
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