PIKfyve抑制剂YM201636对claudins和非小细胞癌细胞恶性潜能的影响

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与基于湿法的实验程序相比，由于存在大量疾病诊断、预后和治疗的替代方案，集成生物信息学和统计方法在更准确地识别潜在分子生物标记物方面发挥着至关重要的作用。乳腺癌（BC）是全球女性癌症相关死亡的主要原因之一。几项基于干实验室和湿实验室的研究已经确定了BC的不同组分子生物标记物。但无论是计算上还是实验上，他们都没有将结果进行如此多的比较。在这项研究中，试图通过综合生物信息学和统计方法，提出一套可能对BC诊断、预后和治疗更有效的分子生物标记物。首先，我们使用统计LIMMA方法在BC和对照样品之间鉴定了190个差异表达基因（DEG）。然后我们通过蛋白质相互作用（PPI）网络分析确定了13个DEG（AKR1C1、IRF9、OAS1、OAS3、SLCO2A1、NT5E、NQO1、ANGPT1、FN1、ATF6B、HPGD、BCL11A和TP53INP1）为关键基因（KG）。然后，我们通过GO术语和KEGG通路富集分析研究了DEGs突出KGs的发病过程。此外，我们通过KG与转录因子（TF）和微RNA的相互作用网络分析，揭示了KG的转录和转录后调节因子。包括多变量生存分析结果在内的监督学习和非监督学习都证实了所提出的KG的强大预测能力。最后，通过与最先进的替代品顶级独立受体蛋白的交叉验证，我们建议KGs引导的七种候选药物（NVP-BHG712、Nilotinib、GSK2126458、YM201636、TG-02、CX-5461、AP-24534）与其他已发表药物相比，在计算上更有效。因此，我们的发现可能对乳腺癌的诊断、预后和治疗起到至关重要的作用。

磷酰肌醇在许多生物活动中起着重要作用，对整个细胞功能至关重要。由于其复杂的化学结构、定位和低丰度，磷脂酰肌醇领域当前的挑战包括准确测量和识别特定变体，特别是带有酰基链的变体。研究人员正在大力开发创新技术和方法，以应对这些挑战，并提高我们对磷脂酰肌醇信号传导对细胞生物学影响的理解。本文概述了磷酸肌醇研究的最新进展，包括质谱法、脂质生物传感器和使用荧光传感器的实时活性测定。这些方法已被证明有助于全面探索磷脂酰肌醇的细胞分布和动力学，并阐明了这些脂质在人类健康和包括癌症在内的各种病理过程中日益重要的意义。为了说明磷脂酰肌醇信号转导在疾病中的重要性，该观点还强调了一个名为磷脂酰肌糖醇5-磷酸4-激酶（PI5P4Ks）的脂激酶家族的作用，该家族最近成为癌症治疗的激动人心的治疗靶点。对磷脂酰肌醇信号传导的不断探索不仅加深了我们对细胞生物学的理解，而且为癌症治疗的新干预措施带来了希望。