2018
内政部:10.1038/s41467-018-06176-3
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单细胞分辨率下小鼠胰腺发育的谱系动力学

摘要: 器官发生需要多个细胞谱系的复杂相互作用,这些细胞谱系随着时间的推移协调其扩展、分化和成熟。在这里,我们使用单细胞RNA测序、免疫荧光、原位杂交和遗传谱系追踪相结合的方法,对小鼠胰腺上皮和间充质室在发育过程中的细胞类型进行了分析。我们确定了以前未被充分认识的发育中间充质的细胞异质性,并重建了其功能… 显示更多

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“…y轴表示与每个单独条形码相关的UMI(唯一分子标识符)的计数。B、 C对可用10X基因组样本的映射读取(B)和检测基因(C)进行统计分析。 Dt-SNE分析鉴定了胰腺上皮细胞和非胰腺谱系细胞。发布的数据来自(GEO:GSE101099;Byrnes等人,). E(D)中不同谱系标记基因的表达模式。 对10X基因组数据的Ft‐SNE分析确定了E14.5胰腺中的四个胰腺细胞组。发布的数据来自(GEO:GSE101099;Byrnes等人,). (F)中不同组标记基因的G表达模式。 HHeat maps显示了从10X基因组学数据中确定的组富集基因的表达。…”
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“…y轴表示与每个条形码相关联的UMI(唯一分子标识符)的计数。B、 C对可用10X基因组样本的映射读取(B)和检测基因(C)进行统计分析。 Dt-SNE分析鉴定了胰腺上皮细胞和非胰腺谱系细胞。发布的数据来自(GEO:GSE101099;Byrnes等人,). E(D)中不同谱系标记基因的表达模式。 对10X基因组数据的Ft‐SNE分析确定了E14.5胰腺中的四个胰腺细胞组。发布的数据来自(GEO:GSE101099;Byrnes等人,). (F)中不同组标记基因的G表达模式。 HHeat maps显示了从10X基因组学数据中确定的组富集基因的表达。…”
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“……公布的数据来自(GEO:GSE101099;Byrnes等人,).E(D)中不同谱系标记基因的表达模式。 对10X基因组数据的Ft‐SNE分析确定了E14.5胰腺中的四个胰腺细胞组。发布的数据来自(GEO:GSE101099;Byrnes等人,). (F)中不同组标记基因的G表达模式。 HHeat maps显示了从10X基因组学数据中确定的组富集基因的表达。每列代表一个细胞,每行代表一个基因。…”
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“……过去几年,单细胞RNA测序(scRNA-seq)通过多个小组破译胰腺器官发生过程中的细胞谱系动力学,增强了我们对发育过程中胰腺谱系轨迹的理解。综上所述,这些研究表明,看似等效的胚胎胰腺祖细胞包含以前未被认识到的细胞异质性,包括由Fev表达定义的新中间EP群体(Byrnes等人,)表达Myt1的EP细胞子集偏向于β细胞命运(Liu等人,)和以SLC38A5表达为标志的α细胞的祖细胞(Stanescu等人,).…”
章节:胰腺器官发生的单细胞转录组学分析提及
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