精神疾病的遗传因素已经明确确立,全基因组关联研究现在提供了风险基因和与风险相关的遗传变异的位置。然而,这些基因和变异导致精神疾病的机制大多尚不明确。这在一定程度上是因为非同义蛋白编码的改变不能解释大多数与复杂遗传性状相关的变异。基于此,预测这些变体正在引起基因表达变化,包括选择性剪接的变化。影响选择性剪接的遗传改变已被确定为孟德尔病的危险因素;然而,目前关于选择性剪接在复杂性状中的作用的研究很少。这部分源于难以预测剪接中遗传变异的作用。典型剪接位点序列、剪接连接附近的核苷酸、外显子和内含子剪接调控序列的改变会影响剪接位点的选择。最近的研究已经确定脑组织中选择性剪接转录物的全球变化,其中一些与剪接反式因子水平的改变相关。疾病相关变异体也被发现影响顺式剪接调控序列并改变选择性剪接转录物的比率。本文综述了这些发现,以及研究精神疾病中选择性剪接的现有数据集和资源。识别和理解导致选择性剪接的风险变体对于理解风险机制以及为新的治疗方案铺平道路至关重要。