精原干细胞(SSCs)是最重要的干细胞之一,具有自我更新、分化、转分化和去分化潜能,因此在生殖和再生医学中具有重要应用。它们可以跨代传递遗传和表观遗传信息,这突出了正确建立和维护表观遗传标记的重要性。需要精确的转录和转录后调控来支持精子发生每一步特定基因的高度协调表达。越来越多的证据表明,非编码RNA(ncRNAs),包括长非编码RNAs(lncRNA)和环状RNA(circRNA),在控制男性生殖细胞的基因表达和命运决定中发挥着重要作用。这些ncRNA分子具有独特的特性和生物学功能,它们独立或协同调节SSC的增殖、凋亡和分化。在这篇综述中,我们总结了小鼠和人类SSCs的特征、生物学功能和命运,并比较了lncRNA和circRNA的特征。我们还探讨了lncRNAs和circRNAs在调节小鼠和人类SSCs中的作用和机制,这将为哺乳动物精子发生的表观遗传机制提供新的见解,并提供治疗男性不育的新方法。