2014
内政部:10.1021/jm5013006
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优化的蛋白激酶Cθ(PKCθ)抑制剂在小鼠关节炎模型中仅显示出中等的抗炎效果

摘要: 我们之前证明,用三嗪酮1选择性抑制蛋白激酶Cθ(PKCθ)可在小鼠关节炎模型中剂量依赖性地减少爪子肿胀。1,2然而,疗效需要高浓度,因此仅提供最小的安全窗口。在此,我们描述了一种提供更安全化合物的策略,该策略基于这样的假设,即优化效力,配合良好的口服药代动力学(PK)特性,可以在减少暴露的情况下实现体内疗效,结果… 显示更多

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“…虽然Asp463存在于ATP结合位点的间隙中,但其他标记位点位于结合囊的入口。图中显示,每个探针标记的氨基酸残基位于PKCα的不同表面区域,这得到了X射线晶体学数据(PDB ID:4RA4)的支持具有竞争性抑制剂)。由于二氮嗪产生的卡宾物种在不到纳秒的时间内与相邻分子(包括水)迅速反应,这些交联氨基酸残基在辐照前应与光探针中的二氮嗪基团直接接触……”
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“…虽然Asp463存在于ATP结合位点的间隙中,但其他标记位点位于结合囊的入口。图中显示,每个探针标记的氨基酸残基位于PKCα的不同表面区域,这得到了X射线晶体学数据(PDB ID:4RA4)的支持使用竞争抑制剂)。由于二氮嗪产生的卡宾物种在不到纳秒的时间内与相邻分子(包括水)迅速反应,这些交联氨基酸残基在辐照前应与光探针中的二氮嗪基团直接接触……”
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“…图示了探针1(蓝色)和2(红色)标记的PKCα氨基酸(PDB ID:4RA4)用两个探针标记Lys352(紫色)。…”
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“……人类PKCα激酶结构域的晶体结构已被解析(pdb:4RA4)23,但与氨基酸617-633相对应的环除外。使用蛋白质局部优化程序(PLOP)建立了包含该缺失环的结构模型24与结合到非水解ATP类似物(pdb:3O7L)的人类蛋白激酶A(PKA)晶体结构的同源性25,这是一个短的最小化(最陡下降)……”
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“……C末端尾部是PKC中变化最大的区域。它本质上是以孤立形式无序的(22)并且在PKC催化域的晶体结构中具有高度的静态和/或动态无序(23)(24)(25)(26)(27)(28)(29)(30)(31)(32)V5的三个保守区域是NFD基序、转向基序(TM)和疏水基序(HM)(图……”
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