Npy4r(神经肽Y受体Y4)-大鼠基因组数据库

给我们发个消息



基因:Npy4r(神经肽Y受体Y4)褐家鼠
分析
符号: Npy4r公司
姓名: 神经肽Y受体Y4
RGD ID: 61864
描述: 激活胰腺多肽受体活性和肽结合活性。预计参与G蛋白偶联受体信号通路。预测作用于神经肽信号通路的上游或内部。预计位于膜中。预测在神经元投射和质膜中具有活性。与包括NPY4R(神经肽Y受体Y4)在内的几个人类基因同源;与17-β-雌二醇的相互作用;17-雌二醇3-苯甲酸酯;3,3',4,4',5-五氯联苯。
类型: 蛋白质编码
RefSeq状态: 临时的
以前称为: 神经肽Y受体4型;NPY4-R;胰多肽受体1;PP1;Ppyr1型
RGD正交测井
人类
鼠标
灰鼠
倭黑猩猩
清管器
联盟Orthologs
更多信息 更多信息。。。
最新装配: mRatBN7.2-mRatBN7.2组件
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J浏览美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
GRCr8级169,474,051 - 9,475,307 (-)美国国立生物技术信息中心GRCr8级
额定BN7.2169,467,801 - 9,469,057 (-)美国国立生物技术信息中心额定BN7.2额定BN7.2
mRatBN7.2信号群169,467,801 - 9,469,057 (-)合奏mRatBN7.2信号群
UTH_Rnor_SHR_Utx169,481,156 - 9,482,412 (-)美国国立生物技术信息中心雷诺_SHRUTH_Rnor_SHR_Utx
通用技术规范_SHRPS_BbbUtx_1.01610,625,865 - 10,627,121 (-)美国国立生物技术信息中心雷诺_SHRSPUTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0
UTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0169,476,211 - 9,477,467 (-)美国国立生物技术信息中心雷诺_WKYUTH_R标准_WKY_Bbb_1.0
雷诺_6.01610,489,450 - 10,490,706 (-)美国国立生物技术信息中心6.0卢比雷诺_6.0第6轮6.0卢比
Rnor_6.0乐团1610,489,450 - 10,490,706 (-)合奏6.0卢比第6轮6.0卢比
雷诺_5.0168,808,683 - 8,809,939 (-)美国国立生物技术信息中心5.0卢比雷诺_5.0第5轮5.0卢比
RGSC_v3.4169,787,170 - 9,788,426 (-)美国国立生物技术信息中心RGSC3.4标准RGSC_v3.4第4轮RGSC3.4标准
RGSC_v3.1169,787,167 - 9,788,424 (-)美国国立生物技术信息中心
塞莱拉165,747,166 - 5,748,422 (+)美国国立生物技术信息中心塞莱拉
细胞遗传学图16第15页美国国立生物技术信息中心
J浏览: 在基因组浏览器(JBrowse)中查看区域
模型


精神分裂症(ISO)

基因化学相互作用注释单击以查看注释详细视图

生物过程

蜂窝组件
薄膜(ISO)
神经元投射(国际律师协会)
质膜(国际律师协会)

分子功能
神经肽结合(国际律师协会)
胰腺多肽受体活性(国际律师协会、国际开发协会、国际标准化组织)
肽结合(进口)
肽类激素结合(ISO)
肽YY受体活性(ISO)

工具书类

参考资料-策划
# 参考文献标题 参考文献引用
1 基因本体联盟内基于系统发育的功能注释传播。 Gaudet P等。,简要生物信息。2011年9月;12(5):449-62. doi:10.1093/bib/bbr042。Epub 2011年8月27日。
2 来自GOA人类基因数据的大鼠ISS GO注释——2006年8月 GO财团的GOA数据
三。 克隆的大鼠胰腺多肽受体与同源受体有着深刻的差异。 伦德尔一世等。,美国国家科学院院刊1996年5月14日;93(10):5111-5.
4 MGI小鼠基因数据中的大鼠ISS GO注释——2006年8月 GO财团的MGD数据
5 LocusLink和RefSeq数据的电子传输 2002年7月26日,NCBI大鼠LocusLink和RefSeq合并数据
6 GOA管道 RGD自动化数据管道
7 化学-基因相互作用的数据导入 用于基因-化学相互作用的RGD自动导入管道
8 编码人和大鼠胰腺多肽受体cDNA的克隆和功能表达。 Yan H等人。,美国国家科学院院刊1996年5月14日;93(10):4661-5.
PubMed的其他参考文献
PMID:7493937  PMID:7592911  PMID:8641440  PMID:9210181  PMID:10698177  PMID:16950545  PMID:35453028 


基因组学

比较地图数据
Npy4r公司
(褐家鼠-挪威鼠)
大鼠组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J浏览美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
GRCr8型169,474,051 - 9,475,307 (-)美国国立生物技术信息中心GRCr8级
额定BN7.2169,467,801 - 9,469,057 (-)美国国立生物技术信息中心额定BN7.2额定BN7.2
mRatBN7.2信号群169,467,801 - 9,469,057 (-)合奏mRatBN7.2信号群
UTH_Rnor_SHR_Utx169,481,156 - 9,482,412 (-)美国国立生物技术信息中心雷诺_SHRUTH_Rnor_SHR_Utx
UTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.01610,625,865 - 10,627,121 (-)美国国立生物技术信息中心雷诺_SHRSPUTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0
UTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0169,476,211 - 9,477,467 (-)美国国立生物技术信息中心雷诺_WKYUTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0
雷诺_6.01610,489,450 - 10,490,706 (-)美国国立生物技术信息中心6.0卢比雷诺_6.0第6轮6.0卢比
Rnor_6.0乐团1610,489,450 - 10,490,706 (-)合奏雷诺6.0第6轮6.0卢比
雷诺_5.0168,808,683 - 8,809,939 (-)美国国立生物技术信息中心5.0卢比雷诺_5.0rn5型雷诺5.0
RGSC_v3.4169,787,170 - 9,788,426 (-)美国国立生物技术信息中心RGSC3.4标准RGSC_v3.4第4轮RGSC3.4标准
RGSC_v3.1169,787,167 - 9,788,424 (-)美国国立生物技术信息中心
塞莱拉165,747,166 - 5,748,422 (+)美国国立生物技术信息中心塞莱拉
细胞遗传学图16第15页美国国立生物技术信息中心
净现值4R
(智人-人类)
人类装配Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J浏览美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
GRCh38型1046,461,099 - 46,470,668 (-)美国国立生物技术信息中心GRCh38型GRCh38型汞38GRCh38型
GRCh38.p14信号群1046,461,099 - 46,465,958 (-)合奏GRCh38型汞38GRCh38型
GRCh37型1047,083,457 - 47,088,320 (+)美国国立生物技术信息中心GRCh37型GRCh37型汞19GRCh37型
构建361046,503,540 - 46,508,326 (+)美国国立生物技术信息中心NCBI36标准构建36汞18NCBI36标准
构建341046,503,539 - 46,508,325美国国立生物技术信息中心
细胞遗传学图10问题11.22美国国立生物技术信息中心
CHM1_1型1047,901,251 - 47,906,033 (-)美国国立生物技术信息中心CHM1_1型
T2T-CHM13v2.0版本1047347139-47357909(-)美国国立生物技术信息中心T2T-CHM13v2.0
Npy4r公司
(小家鼠-家鼠)
鼠标组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J浏览美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
GRCm39型1433,867,603 - 33,874,376 (-)美国国立生物技术信息中心GRCm39型GRCm39型毫米39
GRCm39信号群1433,865,949 - 33,874,446 (-)合奏GRCm39信号群
GRCm38型1434,145,646 - 34,152,419 (-)美国国立生物技术信息中心GRCm38型GRCm38型毫米10GRCm38型
GRCm38.p6信号群1434,143,992 - 34,152,489 (-)合奏GRCm38型毫米10GRCm38型
MGSCv371434,958,832 - 34,965,605 (-)美国国立生物技术信息中心GRCm37型MGSCv37毫米9NCBI立方米37
MGSCv361432,973,084 - 32,981,581 (-)美国国立生物技术信息中心MGSCv36毫米8
塞莱拉1430,407,960 - 30,414,733 (-)美国国立生物技术信息中心塞莱拉
细胞遗传学图谱14B类美国国立生物技术信息中心
cM地图1420.8美国国立生物技术信息中心
Npy4r公司
(龙猫-长尾龙猫)
钦奇拉组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J浏览美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
奇兰1.0西北_0049555106,198,051 - 6,199,169 (+)美国国立生物技术信息中心奇兰1.0奇兰1.0
LOC100985913号
(Panpaniscus-倭黑猩猩/侏儒黑猩猩)
Bonobo组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J浏览美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
NHGRI_mPanPan1-v2859,498,601 - 59,505,133 (+)美国国立生物技术信息中心NHGRI_mPanPan1-v2
NHGRI _面板11059,503,918 - 59,510,353 (+)美国国立生物技术信息中心NHGRI _面板1
穆迪布鲁_PPA_v01043,769,740 - 43,776,225 (+)美国国立生物技术信息中心穆迪布鲁_PPA_v0穆迪布鲁_PPA_v0面板面板3
窗格1.11046,822,670 - 46,827,451 (+)美国国立生物技术信息中心面板1.1泛泛1.1面板面板2
净现值4R
(犬狼疮-犬)
爪形组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J浏览美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
CanFam3.1系列434816566-34820774(+)美国国立生物技术信息中心加拿大家庭3.1CanFam3.1系列canFam3频道CanFam3.1系列
狗10K_盒子_Tasha434,804,534 - 34,811,739 (+)美国国立生物技术信息中心狗10K_盒子_Tasha
ROS_Cfam_1.0型435,173,909 - 35,181,111 (+)美国国立生物技术信息中心ROS_Cfam_1.0型
ROS_Cfam_1.0乐团435,177,642 - 35,178,769 (+)合奏ROS_Cfam_1.0乐团
UNSW_扫描FamBas_1.0435,187,785 - 35,194,992 (+)美国国立生物技术信息中心UNSW_扫描FamBas_1.0
UU_Cfam_GSD_1.0435,694,368 - 35,701,559 (+)美国国立生物技术信息中心UU_Cfam_GSD_1.0
净现值4R
(Sus scrofa-猪)
清管器组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J浏览美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
Sscrofa11.1系列1488,276,340 - 88,283,720 (+)美国国立生物技术信息中心Sscrofa11.1系列Sscrofa11.1系列susScr11Sscrofa11.1系列
Sscrofa10.2系列14957600996-95768322(+)美国国立生物技术信息中心Sscrofa10.2系列Sscrofa10.2系列susScr3

变体

.
Npy4r中的变体
总共3种变体

区域QTL(mRatBN7.2)
以下内容QTL数量与此区域重叠。    完整报告 CSV公司 桌棋类游戏 打印机 Gviewer(Gviewer)
RGD ID(RGD ID)符号姓名LOD(检测限)P值特质次要特征Chr公司起点停止物种
1357403睡眠4血清瘦素浓度QTL 43.91血瘦素含量(VT:0005667)血清瘦素水平(CMO:0000780)1619639137老鼠
1600369Hcas8型肝癌易感性QTL 8肝脏完整性特征(VT:0010547)肝肿瘤病变数(CMO:0001068)16122477621老鼠
631830铝合金7饮酒量QTL 72.9消费行为特征(VT:0002069)乙醇饮料摄入率(CMO:0001407)16126727669老鼠
634355渲染4肾损伤易感性QTL 40.05肾血管形态特征(VT:0000530)器官损伤测量(CMO:0000677)16126727669老鼠
1582235胰岛素8胰岛素水平QTL 83.30.0063血胰岛素量(VT:0001560)计算的血清胰岛素水平(CMO:0000359)16126727669老鼠
9590151得分8血清皮质酮水平QTL 88.450.001血皮质酮含量(VT:0005345)血浆皮质酮水平(CMO:0001173)16130836262老鼠
2302380睡眠6血清瘦素浓度QTL 63.36血瘦素含量(VT:0005667)血清瘦素水平(CMO:0000780)16132139025老鼠
2307172活动4活性QTL 43.710.00023运动行为特征(VT:0001392)实验装置中进入离散空间的条目数(CMO:0000960)16133418960老鼠
1354584设计6绝望相关QTL 63.10.0067运动行为特征(VT:0001392)自愿静止所花费的时间(CMO:0001043)16139533930老鼠
2303566Bw90型体重QTL 902体重(VT:0001259)体重(CMO:000012)16139533930老鼠
631561Hcuc2型肝脏铜含量QTL 22.8肝脏铜含量(VT:0003065)肝脏总铜重量(CMO:0001507)16139533949老鼠
6903319Bw114型体重QTL 1142.70.0037体重(VT:0001259)体重(CMO:000012)16143534949老鼠
7411664Foco30公司食物消费QTL 30110.001饮食行为特征(VT:0001431)饲料转化率(CMO:0001312)16144588133老鼠
1354625设计7绝望相关QTL 73.160.016运动行为特征(VT:0001392)自愿静止所花费的时间(CMO:0001043)16144977551老鼠
1600378阿伦奇4有氧运动能力QTL 40.03运动耐力特征(VT:0002332)跑步机上的最大跑步距离(CMO:0001406)1638024580345693老鼠
2293343全球16肾小球QTL 167.4肾小球完整性特征(VT:0010546)肾硬化性肾小球计数与肾小球总计数之比(CMO:001269)1683223646053497老鼠
2312660Bw95型体重QTL 950.05腹股沟脂肪垫质量(VT:0010424)腹股沟脂肪垫重量与体重之比(CMO:001253)1683223659492508老鼠
2312663睡眠9血清瘦素浓度QTL 90.001血瘦素含量(VT:0005667)血清瘦素水平(CMO:0000780)1683223659492508老鼠
2312666胰岛素16胰岛素水平QTL 160.01血胰岛素量(VT:0001560)血清胰岛素水平(CMO:0000358)1683223659492508老鼠
2312669Stl23标准血清甘油三酯水平QTL 230.01血甘油三酯量(VT:0002644)血清甘油三酯水平(CMO:0000360)1683223659492508老鼠
2301406儿童39肾质量QTL 390.002肾肿块(VT:0002707)双肾湿重与体重之比(CMO:0000340)16285170915884239老鼠
130013324兰特肾功能QTL 243.64血肌酐量(VT:0005328)肌酐清除率(CMO:0000765)16338015021361552老鼠
2306902Bp339页血压QTL 3390.01动脉血压特征(VT:2000000)收缩压(CMO:0000004)16338015043025077老鼠
737825铝13饮酒量QTL 134.5消费行为特征(VT:0002069)乙醇饮料摄入率(CMO:0001407)16422760916039848老鼠
70183BpQTL集群13血压QTL聚类133.654动脉血压特征(VT:2000000)舒张压(CMO:0000005)16422760943025077老鼠
70183BpQTL集群13血压QTL聚类133.654动脉血压特征(VT:2000000)收缩压(CMO:0000004)16422760943025077老鼠
70183BpQTL集群13血压QTL聚类133.654动脉血压特征(VT:2000000)平均动脉血压(CMO:0000009)16422760943025077老鼠
737819Hcas4型肝癌易感性QTL 44.43肝脏完整性特征(VT:0010547)单个肝肿瘤病变体积(CMO:0001078)16422760946975965老鼠
61405尼多姆6非胰岛素依赖型糖尿病QTL 63.660.001血糖量(VT:0000188)血糖水平(CMO:000042)16422760948972724老鼠
61338第23页血压QTL 234.3动脉血压特征(VT:2000000)收缩压(CMO:0000004)16422760949227609老鼠
737826铝11饮酒量QTL 113.2消费行为特征(VT:0002069)乙醇饮料摄入率(CMO:0001407)16422760960252231老鼠
61372第40页血压QTL 402.2血压特征(VT:0000183)收缩压(CMO:0000004)16422773017696785老鼠

区域中的标记
2006年3月1日 
老鼠组件Chr公司位置(股)来源J浏览
额定BN7.2169,468,017 - 9,468,749 (+)MAPPER公司额定BN7.2
雷诺_6.01610,489,667 - 10,490,398美国国立生物技术信息中心6.0卢比
雷诺_5.0168,808,900 - 8,809,631UniSTS大学5.0卢比
RGSC_v3.4169,787,387 - 9,788,118UniSTS大学RGSC3.4标准
塞莱拉165,747,474 - 5,748,205UniSTS大学
细胞遗传学图16第16页UniSTS大学


表达式


RNA-SEQ表达
高:>1000 TPM值  中等:11至1000 TPM之间
低:0.5至10 TPM之间  低于截止线:<0.5 TPM

胃肠系统的消化部分 循环系统 内分泌系统 外分泌系统 溶血性软脑膜系统 肝胆系统 神经系统 肾系统 生殖系统 呼吸系统
中等
6 15 8 1 8 28 11
截止线以下 4 19 16 6 16 62 21 12

顺序


参考序列帐户Id: ENSRNOT00000083105号ENSRNOP00000069607公司
类型: 编码
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源
mRatBN7.2信号群169467801-9469057(-)合奏
Rnor_6.0乐团1610,489,450 - 10,490,706 (-)合奏
参考序列帐户Id: NM_031581号NP_113769号
参考序列状态: 临时的
类型: 编码
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源
GRCr8级169,474,051 - 9,475,307 (-)美国国立生物技术信息中心
额定BN7.2169,467,801 - 9,469,057 (-)美国国立生物技术信息中心
雷诺_6.01610,489,450 - 10,490,706 (-)美国国立生物技术信息中心
雷诺_5.0168,808,683 - 8,809,939 (-)美国国立生物技术信息中心
RGSC_v3.4169,787,170 - 9,788,426 (-)RGD公司
塞莱拉165,747,166 - 5,748,422 (+)RGD公司
顺序:
参考序列科目Id: NP_113769号NM_031581号
-UniProtKB: 问题62892(UniProtKB/Swiss-Prot)数量63447(UniProtKB/瑞士Prot)A6KFT0型(UniProtKB/TrEMBL)
-顺序:
参考序列帐户Id: ENSRNOP00000069607公司ENSRNOT00000083105号
蛋白质结构
姓名 建模者 蛋白质Id AA系列 蛋白质结构
AF-Q63447-F1-型号v2 字母折叠 问题63447 1-375 查看蛋白质结构

转录组

eQTL公司   查看Phenogen
WGCNA公司   查看Phenogen
组织/菌株表达   在Phenogen查看


其他信息

数据库 帐户Id 来源
AGR基因 RGD:61864 AgrOrtholog公司
BioCyc基因 G2FUF-12071型 生物周期
集合基因 ENSRNOG00000061026号 乐团、ENTREZGENE、UniProtKB/Swiss-Prot
  ENSRNOG00055010727公司 UniProtKB/Swiss-Prot公司
  ENSRNOG00060014726公司 UniProtKB/Swiss-Prot公司
  ENSRNOG00065016316号 UniProtKB/Swiss-Prot公司
合奏成绩单 ENSRNOT00000083105号 ENTREZGENE公司
  ENSRNOT00000083105.2号 UniProtKB/Swiss-Prot公司
  ENSRNOT00055018135号 UniProtKB/Swiss-Prot公司
  ENSRNOT00060025160标准 UniProtKB/Swiss-Prot公司
  ENSRNOT00065027160号 UniProtKB/Swiss-Prot公司
通用3D-CATH 视紫红质7螺旋跨膜蛋白 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
InterPro公司 GPCR_霍普森 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  GPCR_霍普森_7TM UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  NPY4_rcpt公司 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  净现值(_R) UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
KEGG报告 注册号:29471 UniProtKB/Swiss-Prot公司
NCBI基因 29471 中心基因
黑豹 神经肽Y受体 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  4型相关神经肽Y受体 UniProtKB/TrEMBL、UniProtKB/Swiss-Prot
Pfam公司 7tm_1型 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
PhenoGen公司 Npy4r公司 PhenoGen公司
打印 GPCRHODOPSN公司 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  NR肽Y4R UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  NRPEPTIDEYR公司 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
PROSITE公司 G_保护_接收_F1_1 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  G_保护_接收_F1_2 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
费率GTEx ENSRNOG00000061026号 费率GTEx
  ENSRNOG00055010727公司 费率GTEx
  ENSRNOG00060014726公司 费率GTEx
  ENSRNOG00065016316号 额定GTEx
超级家庭-SCOP 家族A G蛋白偶联受体样 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
UniProt公司 A6KFT0型 ENTREZGENE,UniProtKB/TrEMBL公司
  NPY4R_额定值 UniProtKB/Swiss-Prot公司
  第62892号 中心基因
  问题63447 ENTREZGENE公司
UniProt次要 问题62892 UniProtKB/Swiss-Prot公司


命名历史
日期 当前符号 当前名称 上一个符号 曾用名 描述 参考 状态
2013-04-04 Npy4r公司 神经肽Y受体Y4 Ppyr1型 胰多肽受体1 更新命名以反映人类和鼠标命名 1299863 经核准的
2002-06-10 Ppyr1型 胰多肽受体1     名称已更新 70584 经核准的

RGD管理说明
票据类型 注释 参考
基因同源性 75%氨基酸序列与人类同源物的同源性 729496