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案例报告
.2015年12月18:6:8829。
doi:10.1038/ncomms9829。

与RAD51显性阴性突变相关的新型范科尼贫血亚型

附属公司
案例报告

与RAD51显性阴性突变相关的新型范科尼贫血亚型

纳吉姆·阿梅齐安等。 国家公社. .

摘要

范科尼贫血(Fanconi anaemia,FA)是一种遗传性疾病,对DNA交联诱导的染色体不稳定具有超敏反应,与发育异常、骨髓衰竭和癌症的强烈易感性有关。据报道,共有17个FA疾病基因,均以隐性遗传方式作用。这里我们报告了一个新的g.41022153G>a;FA样患者同源重组DNA修复基因RAD51的一个等位基因中的p.Ala293Thr(NM_002875)错义突变。这种杂合子突变导致了一种新的FA亚型“FA-R”,这似乎是由显性负突变引起的FA的第一个亚型。该患者以小头畸形和精神发育迟滞为特征,成年后没有出现典型的骨髓衰竭和儿科癌症。结合最近关于RAD51相关先天性镜像运动障碍的报道,我们的结果指出,除了DNA修复和癌症易感性外,RAD51介导的同源重组在神经发育中也发挥着重要作用。

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数字

图1
图1。先证者细胞的FA-特征性细胞表型。
()添加150和300后染色体断裂的细胞(受刺激的初级淋巴细胞)数量nM MMC,来自先证者(VU697)及其健康妹妹(VU730);P(P)值=0.0001(χ2-测试)。(b条)健康个体(LN9SV)、FANCA缺陷个体(GM6914)和先证者(VU697F_SV40)SV40转化成纤维细胞中自发和MMC诱导的染色体断裂;P(P)值=0.005(χ2-测试)。(c(c))健康个体(LN9SV)和先证者未经或经50或100治疗的SV40转化成纤维细胞的细胞周期分布72毫米MMC小时(d日——(f))先证者淋巴母细胞经DNA损伤剂治疗后的生长抑制分析。评估淋巴细胞系对MMC、喜树碱和PARP抑制剂KU58948的敏感性。VU697L为先证者淋巴母细胞系,HSC93为野生型对照,VU867L为FANCM缺陷型,VU423L为BRCA2缺陷型,而VU1354L为SLX4缺陷型。误差条表示重复三次实验的标准偏差。
图2
图2。先证者及其家人的遗传分析。
()基因组分析示意图概述。进行了两种类型的分析。(一) 隐性遗传模式(预期为FA,箭头1)和(II)显性遗传模式;从头开始突变(箭头2)。NS-I-SS:非同义、独立、拼接变体。(b条)受影响部分的全基因组序列(WGS)数据RAD51系列外显子10在综合基因组查看器(IGV)中显示先证者的杂合变异体(以绿色表示的变异),而在所有其他家族成员中观察到纯合野生型序列(左图)。相同区域和个体的桑格测序结果显示在右侧面板中(用箭头指示的变体)。(c(c))先证者淋巴母细胞(VU697L;左)和成纤维细胞(VU 697F_SV40;右)互补DNA的Sanger序列数据显示相同的变体(用箭头表示)。(d日)野生型(HSC93)和先证者(VU697L)淋巴母细胞系和野生型(EVA_SV40,FEN_SV40)及先证者永生化成纤维细胞系的全细胞提取物的Western blot分析。用微管蛋白作为负荷控制测定RAD51水平。
图3
图3。RAD51突变体的功能评估。
()诱导细胞模型分析。染色体断裂。与诱导野生型RAD51等位基因(LN9SV+WT)的细胞相比,MMC处理后诱导RAD51突变等位基因表达的细胞染色体断裂的细胞数量增加;P(P)值=0.001(χ2-测试)。NT,“无治疗”;MMC治疗48小时,50纳米MMC。(b条)CellTiter-Blue测试。与表达野生型等位基因的细胞(LN9SV+WT)或用空载体转导的野生型细胞(LN9SV+TET)相比,用MMC处理后,表达突变等位基因(LN9 SV+MUT)的细胞的存活率降低。显示了三个实验的平均值。(c(c))生长抑制试验(细胞计数)。与表达野生型RAD51等位基因的野生型细胞相比,表达突变RAD51等位基因的野型细胞对MMC敏感。误差条表示重复三次实验的标准偏差。(d日)与中的测试相同c(c)但含有喜树碱(CPT)。两个生长抑制实验均一式三份。(电子)在MMC治疗前后,多西环素诱导突变体(3-6道)和野生型RAD51(7-10道)的表达。通道1和通道2含有来自未转化LN9SV野生型细胞的提取物。以微管蛋白作为对照测定RAD51的水平。((f))回复性克隆的分析。桑格序列数据显示突变体缺失RAD51系列相邻基因单核苷酸多态性的等位基因和LOHCASC5公司DNAJC17公司(左侧面板)。这个DCHS2型第4号染色体上的变异保留在两个回复性克隆中(右侧面板)。
图4
图4。RAD51的生化研究。
(,左面板)RAD51净化。野生型RAD51和RAD51A293T型纯化后1μg蛋白质通过含SDS的聚丙烯酰胺凝胶电泳;M、 分子量标记。(,右侧面板)D-loop分析。测试了D-loop形成的效率,报告了联合分子形成和DNA链交换活性;箭头1表示游离寡核苷酸,箭头2表示寡核苷酸与同源超螺旋质粒之间的交换产物。(b条)ATP酶测定。野生型和RAD51的ATP酶活性A293T型在没有或存在单链DNA的情况下,使用薄层色谱法进行测量。ATP水解的量被绘制为时间的函数。误差条表示三个实验的标准误差。(c(c))EMSA dsDNA。荧光标记双链DNA分子(66bp)与指示浓度的野生型RAD51或RAD51孵育A293T型在存在ATP和Ca的情况下2+并通过天然琼脂糖凝胶电泳。(d日)定量DNA结合百分比作为蛋白质浓度的函数。误差条表示五到七个实验的标准误差。(电子)EMSA ssDNA。荧光标记单链DNA分子(66nt)与指示浓度的野生型RAD51或RAD51孵育A293T型在存在ATP和Ca的情况下2+并通过天然聚丙烯酰胺凝胶进行电泳。((f))扫描力显微镜(SFM)。野生型人类RAD51在双链DNA上形成的丝状结构的SFM图像mM KCl(i)和突变RAD51A293T型(ii)。在30℃条件下双链DNA上形成核蛋白丝的例子mM KCl通过野生型(iii)和突变型(iv)RAD51。所有图像均为1.5×1.5μm和高度用0–3范围内的颜色表示nm,红色到黄色,如比例尺所示。()EMSA。EMSA在含有指示浓度的野生型和突变型RAD51的反应混合物中评估了双标记DNA结合。(小时)EMSA检测到的作为RAD51功能的未结合DNA和蛋白质-DNA复合物百分比的量化A293T型蛋白质浓度。
图5
图5。RAD51与人类疾病的关系。
()人类、小鼠和酵母RAD51蛋白的ClustalW比对证明了突变aa的保守性(箭头)。此外,还显示了L1和L2对DNA结合很重要,以及Walker A和Walker B区域,它们与核苷酸结合有关;突变就在L2环的旁边。(b条)晶体结构沃氏甲烷球菌RADA(MvRadA,古RAD51同源物)已与ATP模拟AMPPNP(PDB 2F1H)和ADP(PDB 3FYH)复合求解,为功能相关的RAD51形式提供了最大的结构洞察力。AMPPNP-一种非水解ATP类似物结合的RAD51二聚体以表面表示形式显示,每个RAD51单体的颜色不同。这表明先证者突变周围的基序(品红色)位于二聚体界面(顶部)。MvRadA中与Ala293等价的残基是甘氨酸(红色),尽管周围的基序高度保守(插入序列比对)。MvRadA核苷酸结合状态的特写视图(右)显示,当与AMPPNP结合时,高亲和力ssDNA-结合状态-包含先证者突变的基序形成一个小的α-螺旋。该螺旋与结合核苷酸和Walker A框(绿色)相互作用。该区域还邻近与ssDNA结合的L2环(L2环末端的球体显示晶体中的无序区域)。相反,当与ADP-低ssDNA-结合状态结合时,先证者的突变基序已从核苷酸和Walker a框转移,并从α-螺旋转变为部分无序环,与AMPPNP状态相比,L2环中出现额外的无序。突变在蛋白质中的位置支持突变影响RAD51蛋白质动力学的观点。(c(c))动画显示RAD51变化对临床表型的不同影响。显性阴性突变可导致FA样疾病,RAD51的单倍体不足(即低水平)可导致神经系统疾病,而肿瘤中异常的RAD51表达水平与治疗反应有关。

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引用人

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