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.2014年6月25日:106:191-204。
doi:10.1016/j.jprot.2014.04.028。 Epub 2014年4月24日。

脑脊液细胞外囊泡的蛋白质组分析:一个综合数据集

附属公司

脑脊液细胞外囊泡的蛋白质组分析:一个综合数据集

大卫·齐亚塞里尼等。 蛋白质组学杂志. .

摘要

细胞外小泡(EV)存在于人类脑脊液(CSF)中,但对其蛋白质组成知之甚少。本研究的目的是通过电子显微镜和高分辨率串联质谱(MS/MS)结合生物信息学对脑脊液EV的蛋白质组进行综合分析。我们报告了从两个不同的脑脊液池中通过超速离心分离的EV中鉴定出的1315个蛋白质的广泛目录,包括230个新的EV蛋白质。在1315个蛋白质中,760个在两个脑脊液池中被鉴定,其中约30%的蛋白质也在EV组分和可溶性脑脊液组分中定量富集。CSF EVs的蛋白质组富含alix和syntenin-1、热休克蛋白和tetraspanins等外体标记物,并含有较高比例的脑源性蛋白(n=373)。有趣的是,在EV组分中发现了几种已知的神经退行性疾病生物标志物,如淀粉样前体蛋白、朊蛋白和DJ-1。我们的数据集代表了脑脊液中EV蛋白质组的第一份全面清单,突出了该细胞器的生物标记潜力。对从神经系统疾病患者分离的脑脊液EV进行进一步的比较研究是有必要的。数据可通过标识符为PXD000608的ProteomeXchange获得。生物学意义在本研究中,我们分析了从人类脑脊液(CSF)混合样品中分离的细胞外囊泡的蛋白质组成。脑脊液是环绕大脑和脊髓的无色液体,对中枢神经系统的生理学、随后的机械保护、大脑血流的调节和大脑副产物的消除具有重要作用。由于脑(病理)生理学反映在脑脊液中,这种生物液是神经疾病可溶和基于囊泡的生物标记物的理想来源。在这里,我们证实了CSF中存在外泌体样细胞外囊泡,强调了其在大脑生理学中的潜在作用。这些细胞外小泡提供了丰富的候选生物标记物来源,代表大脑“液体活检”。最有趣的是,细胞外小泡参与转移有毒蛋白质,如α-突触核蛋白和β-淀粉样蛋白,被认为是神经变性向不同脑区扩散的机制之一。与此相一致,我们发现人类CSF细胞外小泡含有朊原蛋白,如淀粉样蛋白前体蛋白和朊蛋白。描述脑脊液中细胞外囊泡的蛋白质组成是理解其来源及其在中枢神经系统中的功能和建立其生物标记物潜力的第一步,也是至关重要的一步。

关键词:脑脊液;外显子;胞外小泡;质谱;神经系统疾病;蛋白质组学。

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引用人

  • 脑脊液细胞外囊泡研究的再现性建议。
    Sandau US、Magaña SM、Costa J、Nolan JP、Ikezu T、Vella LJ、Jackson HK、Moreira LR、Palacio PL、Hill AF、Quinn JF、Van Keuren-Jensen KR、McFarland TJ、Palade J、Sribnick EA、Su H、Vekrellis K、Coyle B、Yang Y、Falcón-Perez JM、Nieuwland R、Saugstad JA;国际细胞外囊泡学会脑脊液工作队。 美国Sandau等人。 《细胞外囊泡》。2024年1月;13(1):e12397。doi:10.1002/jev2.12397。 《细胞外囊泡》。2024 PMID:38158550 免费PMC文章。 审查。
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