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案例报告
.2012年1月13日;90(1):69-75。
doi:10.1016/j.ajhg.2011.11.013。 Epub 2011年12月22日。

外显子序列确定RIPK4为Bartsocas-Papas综合征位点

附属公司
案例报告

外显子序列确定RIPK4为Bartsocas-Papas综合征位点

凯伦·米歇尔等。 美国人类遗传学杂志. .

摘要

翼状胬肉综合征是一种复杂的先天性疾病,包括多种不同的临床状况,其特征是多个皮肤网影响弯曲表面,通常伴有颅面畸形。在严重的形式中,如常染色体隐性遗传Bartsocas-Papas综合征,早期致死是常见的,使致病突变的鉴定变得复杂。通过对一个血缘家族的外显子进行测序,我们确定了RIPK4外显子7中的纯合子突变c.1127C>a,该突变导致无义突变p.Ser376X引入编码的锚蛋白重复相关激酶,该蛋白对角质形成细胞分化至关重要。随后,我们在RIPK4的第2外显子中发现了第二个突变(c.242T>a),导致蛋白激酶域中错义变体p.Ile81Asn。我们进一步证明,RIPK4是蛋白p63的直接转录靶点,p63是分层上皮发育的主要调节因子,在预防翼状胬肉综合征的级联分子事件中起着节点作用。

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数字

图1
图1
纯合子突变RIPK4段Underlie Bartsocas-Papas综合征(A和B)受影响儿童的临床照片,其DNA经过外显子组测序。脱发、部分睑缘粘连、导致口腔部分闭塞的口腔粘连、少并指、腘翼状胬肉以及足部和耻骨上区域之间的纤维栓系都很明显。(C) 家族的部分谱系。带阴影的符号表示受影响的子对象。(D) 序列色谱图显示纯合NM_020639.2的分离:c.1127C>A突变,导致无义改变p.S376X和受影响的表型。(E) 纯合NM_020639.2的序列色谱图:c.242T>A突变,导致错义改变p.Ile81Asn。(F) RIPK4在E18.5小鼠表皮中的表达。在基底层和基底上层观察到细胞质免疫荧光(红色),细胞核用DAPI(蓝色)复染。虚线表示基底膜的位置。比例尺代表25μm。
图2
图2
p63与基因组区域紧密结合撕裂4(A) 周围四个p63结合区(BS-1、BS-2、BS-3和BS-4)的位置RIPK4段之前通过ChIP-seq对具有p63抗体4A4和H129(蓝色峰)的人类原代角质形成细胞的分析确定,与基因组中高度保守的区域相关,这些区域在与增强子区域密切相关的正常人类表皮角质形成上皮细胞(NHEK)中富集了调控标记。使用以下缩写:H3K4 me1,单甲基化组蛋白H3赖氨酸4;H3K4-me2二甲基化组蛋白H3-赖氨酸4;H3K9-ac,乙酰化组蛋白H3-赖氨酸9;H3K27 ac,乙酰化组蛋白H3赖氨酸27。(B) 使用人类HaCaT细胞中的p63抗体H129进行的ChIP-qPCR分析证实p63与所有四个结合位点特异性结合,但与阴性对照肌红蛋白外显子2无特异性结合(对照[Ctr])(p=0.0079)。(C) 使用p63抗体H129进行的ChIP-qPCR分析证实了p63与保守结合位点BS-3和BS-4的特异性结合,但与E18.5小鼠表皮中的阴性对照肌红蛋白外显子2(Ctr)没有特异性结合(p=0.03曼恩;惠特尼U试验)。B和C中的误差条表示平均值的标准误差。
图3
图3
p63反式激活RIPK4段(A) 荧光素酶报告子分析表明,野生型ΔNp63α通过位于56kbRIPK4段(p=0.03,Mann-Whitney U试验)。(B和C)siRNA敲除Trp63蛋白在小鼠原代角质形成细胞中Trp63蛋白水平(p=0.02)导致裂土4水平(p=0.02)。对野生型和过度表达ΔNp63α小鼠表皮的(D和E)qPCR分析表明Trp63蛋白转录本增加了约2.6倍Krt5(Krt5)-tTA/pTRE-ΔNp63α双转基因小鼠与野生型同窝小鼠的比较(p=0.05)导致裂缝4ΔNp63α过度表达小鼠的转录物与野生型同窝小鼠相比。尽管裂土4表达水平未达到显著性阈值,皮尔逊相关系数表明Trp63型裂缝4在里面Krt5(Krt5)-tTA/pTRE-ΔNp63α双转基因小鼠和野生型小鼠表现显著(p=0.02)。对这些数据的回归分析证实Trp63蛋白裂土4表达水平(r2=0.49;p=0.02)(图S5)。误差条表示平均值的标准误差。

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