A diverse range of gene products are effectors of the type I interferon antiviral response

doi:10.1038/nature09907

.2011年4月28日；472(7344):481-5.

doi:10.1038/nature09907。 Epub 2011年4月10日。

多种基因产物是I型干扰素抗病毒反应的效应器

约翰·肖金斯¹, 山姆·J·威尔逊, 玛丽莲·帕尼斯, 玛丽·Y·墨菲, 克里斯托弗·琼斯, 保尔·贝尼亚兹, 查尔斯·米·赖斯

附属机构

采购管理信息： 21478870
PMCID公司：项目经理3409588
内政部： 10.1038/性质09907

多种基因产物是I型干扰素抗病毒反应的效应器

约翰·肖金斯等。自然. 2011.

.2011年4月28日；472(7344):481-5.

doi:10.1038/nature09907。 Epub 2011年4月10日。

作者

约翰·肖金斯¹, 山姆·J·威尔逊, 玛丽莲·帕尼斯, 玛丽·Y·墨菲, 克里斯托弗·琼斯, 保尔·贝尼亚兹, 查尔斯·米·赖斯

附属

¹美国纽约州洛克菲勒大学丙型肝炎研究中心病毒学和传染病实验室，邮编：10065。

采购管理信息： 21478870
PMCID公司：项目经理3409588
内政部： 10.1038/性质09907

勘误表in

更正：多种基因产物是I型干扰素抗病毒反应的效应器。
Schoggins JW、Wilson SJ、Panis M、Murphy MY、Jones CT、Bieniasz P、Rice CM。 Schoggins JW等人。自然。2015年9月3日；525（7567）：144。doi:10.1038/nature14554。Epub 2015年7月8日。自然。2015 采购管理信息：26153858 没有可用的摘要。

摘要

I型干扰素反应保护细胞免受病毒病原体的侵袭。介导这种防御的细胞因子是干扰素刺激基因（ISG）的产物。尽管自25多年前发现以来，已经鉴定出数百种ISG，但只有少数ISG具有抗病毒活性。对于大多数ISG产品，人们对其抗病毒潜力、靶向特异性及其作用机制知之甚少。使用过表达筛选方法，这里我们显示不同的病毒被独特的ISG群瞄准。我们发现每种病毒都易受多种抗病毒基因的影响，这些抗病毒基因共同包含一系列抑制活性。为了进行筛查，对380多个人类ISG进行了抑制几种重要人类和动物病毒复制的能力测试，包括丙型肝炎病毒、黄热病病毒、西尼罗河病毒、基孔肯亚病毒、委内瑞拉马脑炎病毒和人类免疫缺陷病毒1型。广泛作用的效应器包括IRF1、C6orf150（也称为MB21D1）、HPSE、RIG-I（也称为DDX58）、MDA5（也称为IFIH1）和IFITM3，而DDX60、IFI44L、IFI6、IFITM2、MAP3K14、MOV10、NAMPT（也称为PBEF1）、OASL、RTP4、TREX1和UNC84B（也称为SUN2）的靶向抗病毒特异性更强。成对ISG的联合表达显示出与中等剂量的I型干扰素相似的附加抗病毒作用。机械研究揭示了许多效应器的翻译抑制的共同主题。一些ISG，包括ADAR、FAM46C、LY6E和MCOLN2，增强了某些病毒的复制，突显出高度多效性I型干扰素系统的另一层复杂性。

PubMed免责声明

数字

**图1。基于FACS的抗病毒ISG识别屏幕**
a。网关兼容双顺反子慢病毒载体。b过度表达屏幕示意图，显示抑制基因与非抑制基因的假想FACS图。RFP（洋红色）和GFP（绿色）的重叠部分显示为白色。c。FACS图显示*国际单项体育联合会6*-YFV介导抑制*定子1*^−/−小谎。d。48小时HCV复制水平的分布归一化为Fluc对照。方框中显示了标准偏差（S.D.或Z分数）范围内的ISG数量。**e、。**48小时和72小时HCV复制水平的点图归一化为Fluc对照。选择的ISG用蓝色表示。黑线表示人口平均数。

**图2。识别抑制或增强病毒复制的ISG**
a。大规模ISG筛选六种病毒的点图。复制水平标准化为Fluc控制。选择的ISG用蓝色表示。黑线表示人口平均数。**b、 d。**选定ISG的确认分析。对于HIV，猕猴(*M.M.（最小值）。*)TRIM5作为对照。复制水平标准化为Fluc控制。数据由方框图和胡须图表示。丙型肝炎病毒n=8，其他病毒n=9。通过单因素方差分析确定统计显著性。(***,*P（P）*<0.001, **,*P（P）*<0.01, *,*P（P）*<0.05，ns-不显著）。c。在六个筛查中验证的抗病毒ISG流行频率。

**图3。抑制和增强ISG的联合作用**
a。在2基因组合中测试抗-HCV ISG（插图）。红色虚线表示最强的单基因抑制剂IRF1。**b、 d、e。**来自HCV两个基因筛查的确认分析(b)，艾滋病毒(d日)、YFV(**e（电子）**). 将数据归一化为Fluc对照。HCV的n=8，YFV的n=9，HIV的n=9。通过单因素方差分析确定统计显著性。(***,*P（P）*<0.001, **,*P（P）*<0.01, *,*P（P）*<0.05，ns-不显著）。绘制HIV-IFNα抑制曲线以进行比较。ISG为彩色编码：控制（红色）、抑制（黑色）、增强（绿色）c。干扰素β对丙型肝炎病毒的抑制作用。结果为平均值±标准差，n=3。

**图4。转化抑制作为ISG介导的抗病毒作用的常见机制**
a。用HCV亚基因组复制子RNA转染表达ISG的Huh-7细胞，并测量细胞上清液中的Gluc水平b。分别从4小时和72小时的数据推断出初级翻译抑制（左侧面板）或复制抑制（右侧面板）。结果为平均值±标准差，n=4。通过单因素方差分析确定统计显著性。(***,*P（P）*<0.001, **,*P（P）*<0.01, *,*P（P）*<0.05，不显著）**d-g型**C6orf150介导的SINV抑制*定子1*^−/−小谎。C6orf150抑制SINV-GFP复制(d日)和非GFP SINV生产(**e（电子）**). C6orf150和IRF1抑制SINV（ts6）初级翻译(**（f）**)和SINV-Fluc复制(克). 结果为平均值±标准差，n=3。

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中的注释

深入研究I型干扰素抗病毒功能的复杂性。
Touzot M、Soumelis V、Asselah T。 Touzot M等人。肝素杂志。2012年3月；56(3):726-8. doi:10.1016/j.jhep.2011.07.009。Epub 2011年7月27日。肝素杂志。2012 采购管理信息：21801700 没有可用的摘要。
大规模鉴定介导I型干扰素抗病毒反应的效应基因。
高桥K、丸泽H、千叶T。 Takahashi K等人。胃肠病学。2012年1月；142(1):178-80. doi:10.1053/j.gastro.2011.11.008。Epub 2011年11月19日。胃肠病学。2012 采购管理信息：22107719 没有可用的摘要。

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1. Knight E，Jr.，Korant BD.成纤维细胞干扰素诱导人成纤维细胞合成四种蛋白质。美国国家科学院院刊1979；76:1824–1827.-项目管理咨询公司-公共医学
1. Larner AC等。β-干扰素对人类细胞中两个基因的转录诱导。美国国家科学院院刊，1984年；81:6733–6737.-项目管理咨询公司-公共医学
1. Dupuis S等。人类STAT1缺乏症对干扰素α/β和致命病毒性疾病的反应受损。Nat Genet。2003;33:388–391。-公共医学
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补充信息参考

1. Jones CT等。使用基于荧光细胞的报告系统实时成像丙型肝炎病毒感染。国家生物技术。2010;28:167–171.-项目管理咨询公司-公共医学
1. McGee CE等人。致倦库蚊对西尼罗河病毒绿色荧光蛋白感染克隆的感染、传播和传播。媒介传播的动物疾病。2009-项目管理咨询公司-公共医学
1. Tsetsarkin K等人。基孔肯亚病毒（La Reunion分离物）的感染性克隆，用于载体能力研究。媒介传播的动物疾病。2006;6:325–337.-公共医学
1. Suthar MS、Shabman R、Madric K、Lambeth C、Heise MT。Sindbis病毒株AR86成年小鼠神经毒力决定簇的鉴定。《维罗尔杂志》。2005;79:4219–4228.-项目管理咨询公司-公共医学
1. Bick MJ等。锌指抗病毒蛋白的表达抑制了α病毒的复制。《维罗尔杂志》。2003;77:11555–11562.-项目管理咨询公司-公共医学

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[2] de Veer MJ等。使用微阵列识别的干扰素刺激基因的功能分类。白细胞生物学杂志。2001;69:912–920.-公共医学

[3] Knight E，Jr.，Korant BD.成纤维细胞干扰素诱导人成纤维细胞合成四种蛋白质。美国国家科学院院刊1979；76:1824–1827.-项目管理咨询公司-公共医学

[4] Knight E，Jr.，Korant BD.成纤维细胞干扰素诱导人成纤维细胞合成四种蛋白质。美国国家科学院院刊1979；76:1824–1827.-项目管理咨询公司-公共医学

[5] Larner AC等。β-干扰素对人类细胞中两个基因的转录诱导。美国国家科学院院刊，1984年；81:6733–6737.-项目管理咨询公司-公共医学

[6] Larner AC等。β-干扰素对人类细胞中两个基因的转录诱导。美国国家科学院院刊，1984年；81:6733–6737.-项目管理咨询公司-公共医学

[7] Dupuis S等。人类STAT1缺乏症对干扰素α/β和致命病毒性疾病的反应受损。Nat Genet。2003;33:388–391。-公共医学

[8] Dupuis S等。人类STAT1缺乏症对干扰素α/β和致命病毒性疾病的反应受损。Nat Genet。2003;33:388–391。-公共医学

[9] Keskinen P等。人类肝癌细胞抗病毒反应受损。病毒学。1999;263:364–375.-公共医学

[10] Keskinen P等。人类肝癌细胞抗病毒反应受损。病毒学。1999;263:364–375.-公共医学

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