Prediction of the tissue-specificity of selective estrogen receptor modulators by using a single biochemical method

doi:10.1073/pnas.0710802105

.2008年5月20日；105(20):7171-6.

doi:10.1073/pnas.071080205。 Epub 2008年5月12日。

用单一生化方法预测选择性雌激素受体调节剂的组织特异性

苏茜·Y·戴¹, 迈克尔·查尔默斯, 约翰·布鲁宁, 凯利·S·布拉姆雷特, 哈罗德·奥斯本, 查尔扎德·蒙罗塞·拉菲扎德, 罗伯特·巴尔, 王勇（音）, 王敏敏, 托马斯·P·伯里斯, 杰弗里·A·道奇, 帕特里克·R·格里芬

附属机构

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PMCID公司：项目经理2438222
内政部： 10.1073/pnas.071080205

用单一生化方法预测选择性雌激素受体调节剂的组织特异性

苏茜·Y·戴等。美国国家科学院院刊. 2008.

.2008年5月20日；105(20):7171-6.

doi:10.1073/pnas.071080205。 Epub 2008年5月12日。

作者

苏茜·Y·戴¹, 迈克尔·查尔默斯, 约翰·布鲁宁, 凯利·S·布拉姆雷特, 哈罗德·奥斯本, Chahrzad Montrose Rafizadeh公司, 罗伯特·巴尔, 王勇（音）, 王敏敏, 托马斯·P·伯里斯, 杰弗里·A·道奇, 帕特里克·R·格里芬

附属

¹美国佛罗里达州朱庇特斯克里普斯研究所分子治疗学系，邮编：33458。

采购管理信息： 18474858
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内政部： 10.1073/pnas.071080205

摘要

在这里，我们证明了单个生化分析能够预测一系列选择性雌激素受体调节剂（SERM）的组织选择性药理学。我们描述了一种基于氢/氘交换（HDX）质谱探测的受体-甘氨酸复合物动力学的雌激素受体（ER）调节剂分类方法。差分HDX图谱结合聚类和判别分析有效预测了大多数（但不是所有）受试病例的组织选择功能。我们证明，受体-甘氨酸复合体的动力学分析有助于根据结构动力学将ER调节剂组合成不同的组。重要的是，我们能够区分相同化学类型的ER配体中的微小结构变化。此外，HDX揭示了配体结合囊内不同的稳定区域，这些区域可能有助于独立于螺旋12定位的化合物的不同药理学表型。总之，HDX提供了一种灵敏、快速的方法来分类与其药理特征相关的雌激素受体调节剂。

PubMed免责声明

利益冲突声明

作者声明没有利益冲突。

数字

**图1。**
已知化合物的聚类分析。化合物的名称显示在条形图的上方，用于聚类分析的肽区域显示在条形视图的右侧。这些肽的氘掺入差异被视为自变量，在聚类分析中，每个化合物被视为因变量。该颜色表示在不存在和存在该化合物的情况下每个肽的氘水平的差异。4-羟基三苯氧胺缩写为4-OH-Tam。

**图2。**
ER和HDX配置文件。(*A–C*). 在雌二醇（PDB ID:1ERE）、4-羟基三苯氧胺（PDB ID:3ERT）和雷洛昔芬（PDB ID：1ERR）的ER晶体结构上覆盖HDX轮廓。(D类和E类). 用LY156681和LY117018将HDX剖面覆盖在ER晶体结构上。颜色图例显示了氘掺入量减去*全息图*ER来自*阿波罗*ER。晶体结构中呈白色的区域属于胃蛋白酶消化后未检测到的肽，或由于共溶问题而无法在HDX实验中准确测量的肽。

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