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.2006年10月；24(10):1285-92.
doi:10.1038/nbt1240。 Epub 2006年9月10日。

基于概率的高通量蛋白质磷酸化分析和位点定位方法

肖恩·博索利尔 1, 朱迪特·维伦, 斯科特·盖伯, 约翰·拉什, 史蒂文·普·吉吉
附属公司

基于概率的高通量蛋白质磷酸化分析和位点定位方法

肖恩·博索利尔等。 天然生物技术. 2006年10月.

摘要

当试图通过纳米级反相液相色谱/串联质谱（LC-MS/MS）识别大量蛋白质磷酸化位点时，数据分析和解释仍然是主要的后勤挑战（在线补充图1）。在本报告中，我们解决了通常只能通过费力的手动验证才能解决的挑战，包括数据集错误、数据集敏感性和磷酸化位点定位。我们提供了一个大规模的磷酸化数据集，其错误率由目标-恢复方法确定，我们演示了一种通过有效分散不正确的肽谱匹配（PSM）来最大化数据集敏感性的方法，并且我们提出了一个基于概率的评分，即Ascore，根据MS/MS光谱中确定位点离子的存在和强度，测量正确磷酸化位点定位的概率。我们以全自动的方式将我们的方法应用于诺卡唑阻断的HeLa细胞裂解液，我们从491个蛋白质中鉴定出1761个非冗余磷酸化位点，肽假阳性率为1.3%。

PubMed免责声明

中的注释

  • 自动磷酸化位点定位。
    Jensen开。 Jensen开。 国家生物技术。2006年10月；24(10):1226-7. doi:10.1038/nbt1006-1226。 国家生物技术。2006 采购管理信息：17033659 没有可用的摘要。

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