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比较研究
.2004年11月16日;101(46):16268-73.
doi:10.1073/pnas.0407359101。 Epub 2004年11月8日。

人CD3-epsilon/delta二聚体与UCHT1单链抗体片段复合物的晶体结构

附属机构
比较研究

人CD3-epsilon/delta二聚体与UCHT1单链抗体片段复合物的晶体结构

凯利·阿内特等。 美国国家科学院院刊. .

摘要

α/βT细胞受体复合物通过一组构成相关的信号分子,包括CD3-epsilon/gama和CD3-epsilon/delta,传输来自MHC/肽抗原的信号。我们报告了人CD3-ε/δ外结构域异二聚体与UCHT1抗体单链片段之间的复合物的1.9-A分辨率的晶体结构。CD3-epsilon/delta和CD3-epsilon/gama在Ig-fold外结构域之间共享一个保守的界面,两条G链平行排列。与CD3-γ相比,CD3-δ具有更高的电负性表面和更紧密的Ig折叠;因此,这两个CD3异二聚体具有明显不同的分子表面。UCHT1抗体在与二聚体界面相对的CD3-ε的酸性区域附近结合,阻止该区域与TCR直接相互作用。这种免疫显性表位可能是TCR/CD3复合物中唯一可接触的表面,因为UCHT1和OKT3抗体的结合位点之间存在重叠。CD3-ε/δ结构的确定完成了TCR/CD3球状外结构域的设置,并提供了有关暴露CD3表面的信息。

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数字

图1。
图1。
CD3-ε/δ/UCHT1-scFv复合物的结构和CD3-ε子/δ二聚体的拓扑结构。()图示CD3-ε(红色)、CD3-δ(蓝色)、UCHT1重链可变域(绿色)和UCHT1轻链可变域的带状图(黄色)。八条CD3-ε链和七条CD3-δ链分别使用I-set和C1-set Ig折叠的标准命名法标记A-G。使用第二组数据中的弱密度或密度建模的残留物为灰色。CD3-δ在Asn-17和Asn-53(灰棒)的糖基化位点有标记,尽管在这种细菌表达的蛋白质中不存在聚糖。B股和F股之间的二硫键为橙色。(b)CD3-ε/δ二聚体围绕二聚体界面上G链配对形成的轴旋转60度。
图2。
图2。
人CD3-ε/δ和人CD3-λ/γ的比较。()CD3-ε/δ(红色/蓝色)和CD3-ε/γ(灰色)的叠加,通过叠加CD3-ε亚基产生。(b)CD3二聚体G链配对的主干和侧链细节。CD3-ε和CD3-δ之间的主链氢键显示为蓝色虚线。在CD3-γ和CD3-δ之间绝对保守的残基或在哺乳动物CD3-ε之间保守的残基被标记为**; 那些保持相似性的标记为*人CD3-γ残基差异在括号中表示。(c(c))CD3-ε/δ和CD3-ε子/γ二聚体的正静电表面电位和负静电表面电位(分别为蓝色和红色)。该视图与,分别在左侧和右侧显示CD3-δ和CD3-γ的侧视图。与具有正电表面的CD3-γ相比,CD3-ε和CD3-δ都是负电的。
图3。
图3。
CD3-ε/δ守恒的分子表面表示。哺乳动物CD3-ε分子之间保守的残基(红色)、CD3-δ和CD3-γ之间保守的残留物(绿色)以及CD3-δ分子之间保守但在CD3-γ中未发现的残基的颜色(蓝色)。()如图2所示,CD3-ε/δ的“前”面定向,使得CD3-δ和CD3-δ的C末端残基位于底部,CD3-λ和CD3-Δ亚基并排. (b)CD3-δ的侧面。(c(c))CD3的“背面”-ε/δ,如图1所示(旋转180°). (d日)CD3-ε的侧面。二聚体的前、后和CD3-δ侧具有保守的表面残基簇。二聚体的CD3-ε侧缺乏保守区域。
图4。
图4。
CD3-ε/δ和UCHT1接触残留物的分子表面。CD3-ε/δ二聚体的正静电表面电位和负静电表面电位分别以蓝色和红色显示在半透明分子表面上。CD3-ε/δ的取向如图1所示。CD3-ε和UCHT1接触残留物形成氢键或盐桥,表示为球棒模型。UCHT1轻链(黄色)和重链(绿色)仅与侧面(箭头所示)电负区域附近的CD3-ε结合,部分封闭并掩埋1789º的分子表面2.
图5。
图5。
TCR/CD3胞外结构域的保存和TCR/CT3复合物的拟议模型。()TCR和CD3组件示意图。保留区域显示为粗体面片。非协调区域和TCR可变域是苍白的。碳水化合物部分是灰色球体。(b)TCR/CD3复合体的拟议模型。其主要特点是()复合物是紧密的,因为TCR/CD3组分(α-ε-δ、β-ε-γ和α-ζ-ζ)之间的三聚体跨膜接触表明存在紧密的束,可能不比单独的TCR宽;(ii(ii))为了产生这些相互作用,CD3二聚体外结构域与它和TCR球状结构域之间的膜成一定角度;和()CD3-ε/γ和CD3-ε子/δ通过其异二聚体表面与哺乳动物中保守的不对称非糖基化TCR表面相互作用。已知结构中缺失的TCR-β和TCR-α连接肽的长度表明TCR位于CD3二聚体的“上方”。TCR和CD3TM结构域相互作用的要求、TCR膜近端表面的形状以及三种异二聚体中保守残基的位置表明,桨状CD3外结构域与膜成一定角度。TCR/CD3相互作用的化学计量和种间混杂性表明,CD3二聚体通过其异二聚体表面与TCR保守的非糖基化底部和侧面相互作用。这种相互作用模式将允许接触延伸到CD3-γ或CD3-δ两侧保守残基的小块。在一些物种中,这些侧的糖基化排除了与TCR的直接侧对结合。

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引用人

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