Identification of a family of cAMP response element-binding protein coactivators by genome-scale functional analysis in mammalian cells

doi:10.1073/pnas.1932773100

.2003年10月14日；100(21):12147-52.

doi:10.1073/pnas.1932773100。 Epub 2003年9月23日。

哺乳动物细胞中cAMP反应元件结合蛋白共激活因子家族的基因组功能分析

附属公司

PMID： 14506290
预防性维修识别码： PMC218727型
内政部： 10.1073/第1932733100页

哺乳动物细胞基因组尺度功能分析鉴定cAMP反应元件结合蛋白辅活化子家族

瓦迪姆·奥尔根科等。美国国家科学院程序. 2003.

.2003年10月14日；100(21):12147-52.

doi:10.1073/pnas.1932773100。 Epub 2003年9月23日。

附属

¹诺华生物医学研究所功能基因组学系，地址：100 Technology Square，Cambridge，MA 02139，USA。

PMID： 14506290
预防性维修识别码： PMC218727型
内政部： 10.1073/pnas.1932773100

摘要

本报告描述了一种系统测定哺乳动物细胞基因功能的无偏见方法。共测试了20704个预测的人类全长cDNA，以诱导IL-8启动子。许多基因，包括细胞因子、受体、适配器、激酶和转录因子的基因，都通过已知的调控位点诱导IL-8启动子。还鉴定了通过AP-1和未识别的cAMP反应元件（CRE）样位点之间的协同作用发挥作用的蛋白质。一种被称为调节cAMP反应元件结合蛋白（CREB）传感器（TORC1）的蛋白质被鉴定为通过变异CRE和一致CRE位点激活表达。TORC1能有效诱导已知CREB1靶基因，结合CREB1，并通过有效的转录激活域激活表达。果蝇TORC基因也被鉴定出。因此，TORCs代表了一个高度保守的CREB共激活因子家族，可以控制CRE介导的反应的效力和特异性。

PubMed免责声明

数字

**图1。**
阵列全长cDNA的高通量筛选。(A类)带有特定InterPro注释的cDNA的百分比。(B类)转染10%最活跃的cDNA后pIL-8-Luc的折叠诱导。(C类)初级（IL-8_1）和验证性IL-8-Luc（IL-8_2）测定、CRE-Luc和血清反应元件-Luc报告基因测定中cDNA的折叠诱导（以颜色显示）。(天)用IL-1β处理HeLa细胞，或用空载体（CMV）转染，或用relA或MAP3K11构建物转染(x个轴），单独或与图例中所示的第二个构件组合。转染48小时后培养基中分泌的IL-8蛋白水平显示出来。

**图2。**
TORC1通过CRE样位点激活IL-8启动子。(A类)如图所示，用MAP3K11、relA或TORC1转染C/EBPβ（δC/EBP）、核因子-κB（δNF-κB）、AP-1（δAP-1）或类CRE（δCRE-like）位点突变的IL-8启动子构建物。萤火虫Luc级别显示为任意单位（AU）。(B类)类CRE和一致性CRE报告员被转染了关键中显示的激活物。pTAL-Luc包含与CRE载体相同的启动子，没有任何响应元件。Luc值在归一化后显示为AU。(C类)CREB1的一个显性突变体KCREB，但不是IkBα，阻止了TORC1的诱导。pIL-8-Luc报告子与载体（CMV）或TORC1（如关键字所示）和抑制剂（如x个轴。(天)pIL-8-Luc与δ59或空载体（CMV）共转染，如密钥中所示，与各种激活剂共转染x个轴。(E类)pAP-1（PMA）-Luc被转染对照载体或δ59，如密钥中所示，细胞被PMA处理或转染MAP3K11，如x个轴。

**图3。**
TORC1诱导已知的CREB1靶基因。(A类)TNF-α处理或用MAP3K11、p65或TORC1构建物转染HeLa细胞后，在Affymetrix U95a芯片上测量mRNA水平的折叠激活。值表示两个实验的平均值。(B类)TORC1激活CAPL和PEPCK启动子中发现的CRE样序列（pCREL2-Luc）的表达。每个记者，在x个axis与TORC1共转染，并与载体转染细胞进行活化分析。(C类)转染了x个轴用forskolin（FSK）处理，用CRE-BPa联合转染，或两者兼用，如图所示。

**图4。**
TORCs是一个保守的基因家族。所示为hTORC和dTORC预测蛋白的比对。保守的氨基酸被遮住了。使用群集（clustalw）.

**图5。**
TORC蛋白是CREB1辅活化子。(A类)编码三个人类TORC基因的结构（如x个轴）转染pIL8-Luc或pCRE-Luc，如图所示。与载体转染细胞相比，显示的值是折叠诱导。(B类)在S2细胞中表达的dTORC诱导一名报告者携带*果蝇属*CREs。细胞被转染了如x个轴。(C类)hTORC1的N-末端结构域与CREB1相互作用。用所示的编码TORC1的氨基酸1–170或170–650或人类组蛋白脱乙酰化酶1（HDAC1）的FLAG标记构建物转染HEK293细胞。用Western blot检测用抗FLAG抗体分离的蛋白复合物是否存在CREB1(上部). 第一条车道显示在全细胞提取物中检测到CREB1。同样的过滤器也用抗FLAG M2抗体进行了测试(下部). (天)hTORC包含有效的转录激活域。用UAS-Luc报告质粒和全长TORC构建物或GAL4BD-TORC1（氨基酸300-650）、TORC2（氨基酸296-694）或TORC3（氨基酸335-635）融合物共同转染HEK293细胞。折叠诱导与GAL4-DNA-结合域载体pCMV-BD的转染有关。报告者也被单独编码GAL4-CREB融合蛋白（GAL4-CHEB）的质粒转染，或以PKA催化亚单位表达构建物（GAL4-CREB/PKA）作为阳性对照。

请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

甾体生成因子-1和环腺苷3'，5'-单磷酸协同激活抑制素α受体。
Ito M、Park Y、Weck J、Mayo KE、Jameson JL。 Ito M等人。摩尔内分泌。2000年1月；14(1):66-81. doi:10.1210/mend.14.1.0410。摩尔内分泌。2000 PMID：10628748
TORCs：调节CREB活性的传感器。
Conkright医学博士、Canettieri G、Screaton R、Guzman E、Miraglia L、Hogenesch JB、Montmini M。 Conkright MD等人。分子细胞。2003年8月；12(2):413-23. doi:10.1016/j.molcel.2003.08.013。分子细胞。2003 PMID：14536081
通过调节TORC蛋白的核转运激活cAMP反应元件介导的基因表达。
Bittinger MA、McWhinnie E、Meltzer J、Iourgenko V、Latario B、Liu X、Chen CH、Song C、Garza D、Labow M。 Bittinger MA等人。当前生物量。2004年12月14日；14（23）：2156-61。doi:10.1016/j.cub.2004.11.002。当前生物量。2004 PMID：15589160
cAMP反应元件结合蛋白（CREB）和激活转录因子-1（ATF-1）对转化生长因子-beta2启动子的转录调节受蛋白激酶、辅活化因子p300和CREB结合蛋白的调节。
Kingsley-Kallesen ML、Kelly D、Rizzino A。 Kingsley-Kallesen ML等人。生物化学杂志。1999年11月26日；274（48）：34020-8。doi:10.1074/jbc.274.48.34020。生物化学杂志。1999 PMID：10567368
环磷酸腺苷对生长抑素基因转录的调节。
蒙敏·M、布林德尔·P、阿里亚斯·J、费雷里·K、阿姆斯特朗·R。 Montmini M等人。新陈代谢。1996年8月；45（8补充1）:4-7。doi:10.1016/s0026-0495（96）90068-2。新陈代谢。1996 PMID：8769368 审查。

查看所有类似文章

引用人

人类和珊瑚中的胰岛素信号和药理学。
Murthy MHS、Jasbi P、Lowe W、Kumar L、Olaosebikan M、Roger L、Yang J、Lewinski N、Daniels N、Cowen L、Klein-Seetharaman J。 Murthy MHS等人。同行杂志2024年1月31日；12:e16804。doi:10.7717/peerj.16804。eCollection 2024年。同行杂志，2024年。 PMID：38313028 免费PMC文章。
持续的PKA激活将NaV1.5重新分配到成年大鼠心室肌细胞的细胞表面。
Bernas T、Seo J、Wilson ZT、Tan BH、Deschenes I、Carter C、Liu J、Tseng GN。 Bernas T等人。《Gen Physiol杂志》。2024年2月5日；156（2）：e202313436。doi:10.1085/jgp.202313436。Epub 2024年1月16日。《Gen Physiol杂志》。2024 PMID：38226948 免费PMC文章。
CRTC-1转录域是COMPASS复合物介导秀丽线虫寿命所必需的。
Silva-García CG、Láscarez-Lagunas LI、Papsdorf K、Heintz C、Prabhakar a、Morrow CS、Pajuelo Torres L、Sharma a、Liu J、Colaiácovo议员、Brunet a、Mair WB。 Silva-García CG等人。自然老化。2023年11月；3(11):1358-1371. doi:10.1038/s43587-023-00517-8。Epub 2023年11月9日。自然老化。2023 PMID：37946042 免费PMC文章。
CRTC2通过CREB-Smad2/3途径激活糖尿病肾病的上皮-间质转化。
李毅，张毅，施赫，刘X，李Z，张J，王X，王伟，童X。 Li Y等人。《分子医学》，2023年10月26日；29(1):146. doi:10.1186/s10020-023-00744-0。《分子医学》，2023年。 PMID：37884902 免费PMC文章。
抑制炎症和脂质积聚的新见解JAZF1公司.
陈伟、钟毅、袁毅、朱敏、胡伟、刘恩、邢D。陈伟等。基因疾病。2022年12月2日；10(6):2457-2469. doi:10.1016/j.gendis.2022.10.029。eCollection 2023年11月。基因疾病。2022 PMID：37554201 免费PMC文章。审查。

查看所有“被引用”文章

工具书类

1. Lander，E.S.、Linton，L.M.、Birren，B.、Nusbaum，C.、Zody，M.C.、Baldwin，J.、Devon，K.、Dewar，K.，Doyle，M.、FitzHugh，W.等人（2001）《自然》409、860–921。-公共医学
1. Venter，J.C.、Adams，M.D.、Myers，E.W.、Li，P.W.、Mural，R.J.、Sutton，G.G.、Smith，H.O.、Yandell，M.、Evans，C.A.、Holt，R.A.等人（2001）《科学》291、1304–1351。-公共医学
1. Waterston，R.H.、Lindblad-Toh，K.、Birney，E.、Rogers，J.、Abril，J.F.、Agarwal，P.、Agalwala，R.、Ainscow，R.，Alexandersson，M.、An，P.等人（2002）《自然》420、520–562。-公共医学
1. Okazaki，Y.、Furuno，M.、Kasukawa，T.、Adachi，J.、Bono，H.、Kondo，S.、Nikaido，I.、Osato，N.、Saito，R.、Suzuki，H.等人（2002）《自然》420、563–573。-公共医学
1. Strausberg，R.L.，Feingold，E.A.，Grouse，L.H.，Derge，J.G.，Klausner，R.D.，Collins，F.S.，Wagner，L.，Shenmen，C.M.，Schuler，G.D.，Altschul，S.F.等人（2002）。国家。阿卡德。科学。美国99，16899–16903。-项目管理咨询公司-公共医学

MeSH术语

行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动

物质

行动
行动
行动
行动
行动
行动

关联数据

行动
- 在PubMed中搜索
- 核苷酸搜索
行动
- 在PubMed中搜索
- 核苷酸搜索
行动
- 在PubMed中搜索
- 核苷酸搜索

LinkOut-更多资源

[1] Lander，E.S.、Linton，L.M.、Birren，B.、Nusbaum，C.、Zody，M.C.、Baldwin，J.、Devon，K.、Dewar，K.，Doyle，M.、FitzHugh，W.等人（2001）《自然》409、860–921。-公共医学

[2] Lander，E.S.、Linton，L.M.、Birren，B.、Nusbaum，C.、Zody，M.C.、Baldwin，J.、Devon，K.、Dewar，K.，Doyle，M.、FitzHugh，W.等人（2001）《自然》409、860–921。-公共医学

[3] Venter，J.C.、Adams，M.D.、Myers，E.W.、Li，P.W.、Mural，R.J.、Sutton，G.G.、Smith，H.O.、Yandell，M.、Evans，C.A.、Holt，R.A.等人（2001）《科学》291、1304–1351。-公共医学

[4] Venter，J.C.、Adams，M.D.、Myers，E.W.、Li，P.W.、Mural，R.J.、Sutton，G.G.、Smith，H.O.、Yandell，M.、Evans，C.A.、Holt，R.A.等人（2001）《科学》291、1304–1351。-公共医学

[5] Waterston，R.H.、Lindblad-Toh，K.、Birney，E.、Rogers，J.、Abril，J.F.、Agarwal，P.、Agalwala，R.、Ainscow，R.，Alexandersson，M.、An，P.等人（2002）《自然》420、520–562。-公共医学

[6] Waterston，R.H.、Lindblad-Toh，K.、Birney，E.、Rogers，J.、Abril，J.F.、Agarwal，P.、Agalwala，R.、Ainscow，R.，Alexandersson，M.、An，P.等人（2002）《自然》420、520–562。-公共医学

[7] Okazaki，Y.、Furuno，M.、Kasukawa，T.、Adachi，J.、Bono，H.、Kondo，S.、Nikaido，I.、Osato，N.、Saito，R.、Suzuki，H.等人（2002）《自然》420、563–573。-公共医学

[8] Okazaki，Y.、Furuno，M.、Kasukawa，T.、Adachi，J.、Bono，H.、Kondo，S.、Nikaido，I.、Osato，N.、Saito，R.、Suzuki，H.等人（2002）《自然》420、563–573。-公共医学

[9] Strausberg，R.L.，Feingold，E.A.，Grouse，L.H.，Derge，J.G.，Klausner，R.D.，Collins，F.S.，Wagner，L.，Shenmen，C.M.，Schuler，G.D.，Altschul，S.F.等人（2002）。国家。阿卡德。科学。美国99，16899–16903。-项目管理咨询公司-公共医学

[10] Strausberg，R.L.，Feingold，E.A.，Grouse，L.H.，Derge，J.G.，Klausner，R.D.，Collins，F.S.，Wagner，L.，Shenmen，C.M.，Schuler，G.D.，Altschul，S.F.等人（2002）。国家。阿卡德。科学。美国99，16899–16903。-项目管理咨询公司-公共医学

将引文保存到文件

电子邮件引文

添加到集合

添加到我的书目

您保存的搜索

为外部引文管理软件创建文件

您的RSS源

哺乳动物细胞中cAMP反应元件结合蛋白共激活因子家族的基因组功能分析

附属

哺乳动物细胞基因组尺度功能分析鉴定cAMP反应元件结合蛋白辅活化子家族

作者

附属

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

MeSH术语

物质

关联数据

LinkOut-更多资源

全文源

其他文献来源

分子生物学数据库

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

MeSH术语

物质

关联数据

相关信息

LinkOut-更多资源

全文源

其他文献来源

分子生物学数据库