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PROSITE文件PDOC51841公司[对于PROSITE条目PS51841]
Lamin-tail(LTD)域配置文件


描述

中间丝(IFs)是后生动物的主要结构元素细胞。它们构建了两个不同的系统:一个位于连接到内膜,是连接细胞间的细胞质位于质膜上的与外核结合的复合物膜。在这两种情况下,假设它们的主要功能是机械应力吸收器和整体集成装置细胞骨架。在细胞核中,IF系统由层粘连蛋白组装而成,层粘连蛋白以及越来越多的相关跨膜和染色质结合蛋白构成核膜。尽管如此IF蛋白的多样性,它们都具有相似的结构平面图,具有长的中心α-螺旋“杆”域(参见<PDOC00198型>)那就是两侧为称为“头部”的非α螺旋N端和C端端结构域“尾部”。层粘连蛋白表现出高度保守的球状C末端具有免疫球蛋白(Ig)折叠的层尾结构域(LTD)(参见<PDOC50835型>). 无脊椎动物细胞质IFs与核层粘连蛋白,还包含一个C末端尾部结构域,与有限公司[1,2,].

与LTD同源的结构域已在几个未标记的来自不同细菌和两个古生菌的蛋白质,甲烷八叠球菌和盐杆菌。在几种细菌蛋白质中,LTD与金属β-内酰胺酶的膜相关水解酶协同发生,突触janin和钙调神经磷酸酶超家族。在其他分泌或周质细菌蛋白,LTD与寡糖结合结构域或在单一蛋白质。这些关联表明将蛋白质系在膜或膜相关蛋白上的原核LTD结构。与细菌同源物相比,所有动物的LTD都非常接近相关且包含在具有定型结构的蛋白质中。这个动物LTD的前体可能是通过水平基因获得的真核生物进化相对较晚的细菌转移冠组。在这次收购之后,一个线圈域从先前存在的中间纤维卷绕线圈有限公司的N终端[2].

LTD结构域可能参与蛋白质和DNA结合[4].

Th LTD域采用s型Ig样折叠(参见<PDB:国际财务报告准则>). 它包括由9条反平行β链组成的两层三明治,以希腊键拓扑结构排列在两个β板中。其中一张有五条β链而另一个有四个。9股中的7股出现在经典中Ig折叠拓扑[4,5].

一些已知含有LTD结构域的蛋白质如下所示:

  • 动物核层粘连蛋白与层粘连相关蛋白一起维持细胞核形状,并为染色体和复制DNA。
  • 绿屈菜Chloflexus aurantiacus Chlo1887。
  • 秀丽隐杆线虫中间丝蛋白ifc-2[6].
  • 秀丽隐杆线虫中间丝蛋白ifd-1。

我们开发的配置文件涵盖了整个LTD领域。

上次更新时间:

2017年8月/第一个条目。

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技术部分

本文件涵盖的PROSITE方法(包括工具和信息):

有限公司PS51841型;Lamin-tail(LTD)域配置文件(矩阵)


工具书类

1作者Herrmann H。贝尔·H。Kreplak L.公司。斯特列尔科夫股份有限公司。Aebi U.公司。
标题中间丝:从细胞结构到纳米力学。
来源自然修订版分子细胞生物学。8:562-573(2007).
公共医疗ID17551517
内政部10.1038/编号2197

2作者曼斯B.J。阿南塔拉曼五世。阿拉文属。Koonin E.V.公司。
标题比较基因组学,核膜和核孔复合体的进化和起源。
来源细胞周期3:1612-1637(2004)。
公共医疗ID15611647
内政部10.4161/cc.3.12.1345

作者韦伯·K·。雷默D。Dodemont H。
标题层粘连蛋白/中间丝蛋白家族进化的方面:无脊椎动物中间丝蛋白的当前分析。
来源生物化学。社会事务处理。19:1021-1023(1991).
公共医疗ID1794458

4作者克里姆一世。奥斯特伦德C。吉尔金B。库普里J。霍森洛普P。莫农J.-P。博恩·G。库瓦林J.-C。沃曼·H·J。Zinn-Justin S。
标题层粘连蛋白A/C C末端结构域的Ig样结构,在肌营养不良、心肌病和部分脂肪营养不良中突变。
来源结构10:811-823(2002)。
公共医疗ID12057196

5作者阮J。徐C。卞C。拉姆·R。王建平。卡尼亚J。最小J。臧J。
标题人层粘连B1的线圈2B片段和球状尾结构域的晶体结构。
来源FEBS信函。586:314-318(2012).
公共医疗ID22265972
内政部2016年10月10日/j.febslet.2012.01.007

6作者Huesken K。维森法特T。亚伯拉罕·C·。Windoffer R公司。博辛格·O。鲁贝R.E。
标题秀丽隐杆线虫肠管的维护:中间丝蛋白IFC-2的作用。
来源差异76:881-896(2008)。
公共医疗ID18452552
内政部10.1111/j.14332-0436.2008.00264.x



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