描述
病毒感染诱导I型干扰素（IFN-α和干扰素-β）基因。诱导是由于转录激活干扰素基因。干扰素调节因子I（IRF-1）是一种转录因子导致这种激活的因素。IRF-1受上游监管顺式元件，称为干扰素一致序列（ICS）在I型干扰素和干扰素诱导的MHC I类基因的启动子中。干扰素调节因子2（IRF-2）是一种也与ICS相互作用的蛋白质，但不起催化剂作用；相反，它抑制了特定情况下的IRF-1[1].
这些蛋白质共享约100个氨基酸的高度保守的N末端结构域参与DNA结合并含有五种保守的色氨酸。这个结构域被称为“色氨酸五肽重复序列”或“色氨酸簇”，也存在于：
- 干扰素一致序列结合蛋白（ICSBP）[2]，转录因子主要在淋巴组织中表达并由IFN-γ诱导也绑定到ICS。
- 转录调节因子ISGF3γ亚基[三]. ISGF3负责干扰素-α应答基因的初始刺激。它承认并与体内的干扰素刺激反应元件（ISRE）结合靶基因的调控序列。
- 干扰素调节因子3（IRF-3）。
- 与干扰素结合的干扰素调节因子4（IRF-4）-MHC I类启动子的受激反应元件（ISRE）。
- 干扰素调节因子5（IRF-5）。
- 干扰素调节因子6（IRF-6）。
- 干扰素调节因子7（IRF-7）。
- γ疱疹病毒vIRF-1、-2和-3，与IRF家族的细胞转录因子[4]. vIRF-1和vIRF-2与DNA结合的特异性与细胞IRF相同，表明如果vIRF是DNA结合蛋白，它们的结合有一个模式与蜂窝式IRF不同。vIRF-3能否与DNA结合与细胞IRF具有相同的特异性尚不清楚。
IRF色氨酸五重复DNA结合域具有α/β包含三个α-螺旋（α1-α3）簇的体系结构一侧由混合四股β-板（β1-β4）构成（参见<PDB：1IF1号机组>). 它形成了一个螺旋转螺旋图案，与ISRE共识相结合在目标启动子中发现的序列。三种色氨酸残基接触通过识别GAAA序列的DNA[5].
作为此域的签名，我们选择了从五种保守色氨酸中排名第二至第四。我们还开发了覆盖整个IRF色氨酸五重复序列DNA结合的图谱域。
上次更新：2010年8月/修订文本；配置文件已添加。
-------------------------------------------------------------------------------
技术部分
本文件涵盖的PROSITE方法（包括工具和信息）：
工具书类
| 1 | 作者 | 谷口T。 |
| 标题 | 干扰素-β基因的调控：顺式元素和反式因子的结构和功能。 |
| 来源 | 《干扰素研究杂志》9:633-640（1989）。 |
| 公共医疗ID | 2691585 |
| 2 | 作者 | 滴水器P.H。恩尼斯特D.L。格里森有限公司。马克W.-H。马克·M.S。列维B.-Z。弗拉纳根J.R。阿佩拉E。Ozato K。 |
| 标题 | 一种干扰素γ调节蛋白，结合主要组织相容性复合体I类基因的干扰素诱导增强子元件。 |
| 来源 | 程序。国家。阿卡德。科学。美国87:3743-3747（1990）。 |
| 公共医疗ID | 2111015 |
| 三 | 作者 | Veals S.A.公司。迅达C。伦纳德D。傅X.-Y。埃伯索尔德·R。小达内尔J.E。利维·D.E。 |
| 标题 | α-干扰素应答转录因子的亚单位与干扰素调节因子和DNA结合蛋白的Myb家族有关。 |
| 来源 | 分子细胞。生物学12:3315-3324（1992）。 |
| 公共医疗ID | 1630447 |
| 4 | 作者 | 卢比约娃B。Pitha下午。 |
| 标题 | 一种新的人类疱疹病毒8编码蛋白vIRF-3的特征，该蛋白显示与病毒和细胞干扰素调节因子的同源性。 |
| 来源 | J.维罗尔。74:8194-8201(2000). |
| 公共医疗ID | 10933732 |
| 5 | 作者 | Escalante C.R.公司。叶杰（Yie J.）。塔诺斯D。阿加瓦尔A.K。 |
| 标题 | 带有结合DNA的IRF-1结构揭示了干扰素调节的决定因素。 |
| 来源 | 《自然》391:103-106（1998）。 |
| 公共医疗ID | 9422515 |
| 内政部 | 10.1038/34224 |
版权
PROSITE的版权归SIB瑞士生物信息研究所所有根据知识共享署名-NonCommercial-NoDerivatives发布（CC BY-NC-ND 4.0）许可，参见prosite_license.html.
其他
以原始PROSITE文档格式查看条目
以原始文本格式查看条目（无链接）
