PROSITE文件PDOC00038型[对于PROSITE条目PS50888]

Myc型，基本螺旋-环-螺旋（bHLH）域剖面

许多真核蛋白可能是作为转录因子的序列特异性DNA结合蛋白，它们共享一个保守的结构域具有40至50个氨基酸残基。已经提出了[1]这个域是由两个由可变长度连接区连接的双亲螺旋形成这可能会形成一个循环。这个“螺旋-环-螺旋”（HLH）结构域介导蛋白质二聚体，并在下列蛋白质中发现[2，三]. 大多数这些蛋白质中有大约15个氨基酸残基的额外碱性区域与HLH结构域相邻并与DNA特异性结合。他们是被称为碱性螺旋环螺旋蛋白（bHLH），分为两类组：A类（普遍存在）和B类（组织特异性）。委员会成员核心序列“CANNTG”上的bHLH家族绑定变体，也称为E-box图案。HLH结构域介导的同二聚体或异二聚体是独立于DNA结合，但对DNA结合是必要的，因为两个基本区域是DNA结合活性所必需的。缺乏基本结构域的HLH蛋白（Emc，Id）因形成异二聚体而起负调节作用，但无法结合DNA。毛发相关蛋白（haird，E（spl），deadpan）也抑制转录，尽管它们可以结合DNA。这个的蛋白质亚家族通过其C端子图案WRPW。

• 细胞致癌基因myc家族[4]，目前已知包含四个成员：c-myc、N-myc、L-myc和B-myc。myc基因是被认为在细胞分化和增殖中起作用。
• 参与肌肉发生（肌肉细胞的诱导）的蛋白质。在哺乳动物中MyoD1（Myf-3）、myogenin（Myf-4）、Myf-5和Myf-6（Mrf4或herculin），in鸟类CMD1（QMF-1），爪蟾MyoD和MF25，秀丽隐杆线虫CeMyoD和果蝇（nau）。
• 脊椎动物蛋白质结合各种特定DNA序列（“E盒”）免疫球蛋白链增强剂：E2A或ITF-1（E12/pan-2和E47/pan-1），ITF-2（tcf4）、TFE3和TFEB。
• 脊椎动物神经源性分化因子1起分化作用神经发生过程中的因素。
• 脊椎动物MAX蛋白，一种形成序列的转录调节器-具有myc或mad的特异性DNA结合蛋白复合物。
• 脊椎动物最大相互作用蛋白1（MXI1蛋白），作为转录阻遏物并可能拮抗myc转录活性通过竞争max。
• 作为转录激活剂的bHLH/PAS超家族的蛋白质。在哺乳动物中，AH受体核转运体（ARNT）、专一同源物（SIM1和SIM2）、缺氧诱导因子1α（HIF1A）、AH受体（AHR）、神经元pas结构域蛋白（NPAS1和NPAS2）、内皮pas结构域蛋白1（EPAS1）、小鼠ARNT2和人类BMAL1。在果蝇中，专一性（SIM），AH受体核转运体（ARNT），无气管蛋白质（TRH）和类似蛋白质（SIMA）。
• 哺乳动物转录因子HES通过作用抑制转录在两种类型的DNA序列上，E盒和N盒。
• 作为转录物的哺乳动物MAD蛋白（最大二聚体）阻遏物，可能通过竞争来对抗myc转录活性最大值。
• 哺乳动物上游刺激因子1和2（USF1和USF2），结合在多种病毒和细胞启动子。
• 人lyl-1蛋白；通过染色体易位参与T-细胞白血病。
• 人转录因子AP-4。
• 激活E盒的小鼠螺旋-环-螺旋蛋白MATH-1和MATH-2-与E47协作的依赖性转录。
• 哺乳动物干细胞蛋白（SCL）（也称为tal1），一种可能在造血分化中起重要作用。SCL参与，由染色体易位，干细胞白血病。
• 哺乳动物蛋白质Id1至Id4[5]. Id（DNA结合抑制剂）蛋白质缺乏基本的DNA结合域，但能够形成异二聚体其他HLH蛋白，从而抑制与DNA的结合。
• 参与感觉的果蝇鳄外（emc）蛋白通过拮抗乙酰胆碱酯酶的神经原活性形成器官模式-斯库特情结。Emc是哺乳动物Id蛋白的同源物。
• 人类甾醇调节元件结合蛋白1（SREBP-1），a与固醇调节元件1结合的转录激活物（SRE-1）发现于LDLR基因的侧翼区域和其他基因中。
• 果蝇（AS-C）复合蛋白T3（l'sc）、T4（scute）、，T5（achaete）和T8（asense）。AS-C蛋白参与外周神经系统神经元前体的测定以及中枢神经系统。
• achaete-scute蛋白的哺乳动物同源物MASH-1和MASH-2蛋白质。
• 果蝇无张力蛋白（ato），参与神经发生。
• 果蝇无子（da）蛋白，对神经发生至关重要和性别决定。
• 果蝇死盘（dpn），一种与功能有关的毛状蛋白质神经元分化。
• 果蝇（dei）蛋白，在表皮细胞分化为肌肉。
• 果蝇毛（h）蛋白，一种调节胚胎分割和成虫鬃毛图案。
• 果蝇分裂蛋白E（spl）增强子，即毛状蛋白在神经发生期间活跃。也作为转录抑制因子。
• 果蝇扭曲（twi）蛋白，参与胚胎中的胚层。
• 玉米花青素调节蛋白R-S和LC。
• 酵母着丝粒结合蛋白1（CPF1或CBF1）。这种蛋白质参与了染色体分离。它与高度保守的DNA序列结合，在着丝粒和几个启动子中发现。
• 酵母INO2和INO4蛋白质。
• 酵母磷酸系统阳性调节蛋白PHO4相互作用几个酸性磷酸酶基因的上游激活序列。
• Y介导的ADH2所需的酵母富含丝氨酸的蛋白质TYE7表达式。
• 粗糙脉孢菌nuc-1，一种激活磷获取的结构基因。
• 参与性别分化的裂殖酵母蛋白esc1过程。

螺旋-环-螺旋域的示意图如下所示：

xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx--------------------xxxxxxxxxx两亲螺旋1回路两亲螺旋2

我们开发的剖面包括螺旋-环-螺旋二聚结构域和基本区域。