PROSITE文件PDOC50106标准[对于PROSITE条目PS50106]

PDZ域配置文件

PDZ域（也称为Discs-大同源区（DHR）或GLGF）是最初由80到100个氨基酸组成的保守结构元素在果蝇肿瘤突触后密度蛋白PSD-95中鉴定抑制盘大，紧密连接蛋白ZO-1。PDZ域在来自所有真核生物的大量多样蛋白质[1,2]. 出席一些细菌中PDZ结构域的一个或两个拷贝可以解释为水平基因转移[三].

真核PDZ结构域是多功能蛋白质相互作用模块参与信号分子的聚集并发挥重要作用组织膜上蛋白质网络的作用。在许多情况下，PDZ域绑定到出现在的C末端的签名基序（[FYST]-X-[FVA]）靶蛋白。PDZ结构域还能够形成异二聚体，并且与靶蛋白内肽片段的相互作用[1,2,4]. 它有已经提出细菌PDZ结构域也具有C末端多肽绑定函数[三].

PDZ结构域是致密球状结构域，最初称为GLGFGly-Leu-Gly-Phe是其序列中相对保守的元素[1].有无PDZ畴的晶体和溶液结构的分辨率配体显示PDZ结构域包含六条β链和两条α-螺旋[5,6,7,8]. 靶蛋白的C末端基序显示为以反平行方式绑定到主体形成的凹槽PDZ结构域的α-螺旋和第二条β-链[5,8]. 绑定参与一些PDZ结构域异源二聚的位点位于与这个典型的肽结合沟相对。它是PDZ结构域约30个残基的C末端延伸，形成一个β发夹指。这个β-发夹指的第一链模拟典型的C末端肽配体，从伴侣蛋白[7,8]. 有人建议PDZ域可以绑定在非末端序列的一般方式，可能是具有β-指状结构的序列，无论它们是否在其他PDZ域[9].

一些已知含有PDZ结构域的蛋白质如下所示：

• 真核细胞膜相关鸟苷酸激酶（MAGUKs）。
• 哺乳动物淀粉样βA4前体蛋白结合家族A蛋白，与Munc18-1，an结合在突触小泡胞吐中的推测功能突触囊泡细胞外排机制的基本组成部分。
• 哺乳动物神经元型一氧化氮合酶（nNOS）。
• 白细胞介素-16，PDZ蛋白家族唯一已知的分泌成员。
• 脊椎动物LIM激酶（LIMK），显示丝氨酸/苏氨酸特异性体外髓鞘碱性蛋白和组蛋白的磷酸化。
• 果蝇和脊椎动物蓬乱（Dsh和Dvl），蛋白质发挥Wg/Wnt信号从细胞表面传导到原子核。
• 果蝇InaD，一种组装光感受器支架蛋白膜上通过其5个PDZ结构域的多信号转导蛋白。
• 枯草芽孢杆菌IV期芽孢B蛋白（spOIVB）。
• 细菌gspC蛋白，通过II型分泌参与蛋白质输出系统。
• 细菌周质丝氨酸蛋白酶高温需求A（htrA）和尾特异性蛋白酶（tsp）。
• 大肠杆菌和流感嗜血杆菌假想蛋白YaeL，可能与细胞质膜有关。

开发的配置文件覆盖了最小PDZ域，因此缺少大约30个C末端残基（形成PDZ-PDZ中涉及的β指交互）。