PROSITE文件PDOC00382公司[对于PROSITE条目PS50023]

LIM zinc-binding域签名和配置文件

最近[1,2]许多蛋白质被发现含有一个保守的约60个氨基酸残基的富含半胱氨酸的结构域。这些蛋白质是：

• 秀丽隐杆线虫mec-3；分化所需的蛋白质线虫中的六个触觉受体神经元。
• 秀丽隐杆线虫lin-11；不对称性所需的蛋白质外阴母细胞的分裂。
• 脊椎动物胰岛素基因增强子结合蛋白isl-1。Isl-1与1结合胰岛素基因的两个顺式蛋白结合域。
• 脊椎动物同源盒蛋白lim-1、lim-2（lim-5）和lim3。
• 脊椎动物lmx-1，通过结合扁平元件；β-细胞特异性转录增强因子胰岛素基因。
• 哺乳动物LH-2，一种参与淋巴和神经细胞发育过程中细胞分化的控制类型。
• 果蝇蛋白质适体，正常发育所需机翼和吊带想象盘。
• 脊椎动物蛋白激酶LIMK-1和LIMK-2。
• 哺乳动物菱形蛋白。菱形蛋白1（RBTN1或TTG-1）和菱形蛋白2（RBTN2或TTG-2）是约160个氨基酸的蛋白质，其基因被破坏T细胞白血病的染色体易位。
• 哺乳动物和鸟类富含半胱氨酸的蛋白质（CRP），一种192氨基酸蛋白质未知函数的。似乎与zyxin相互作用。
• 哺乳动物富含半胱氨酸的肠蛋白（CRIP），是一种小蛋白似乎在锌吸收中起作用，并可能作为细胞内锌转运蛋白。
• 脊椎动物paxillin，一种细胞骨架焦点粘附蛋白。
• 小鼠睾丸素。不应将小鼠睾丸素与大鼠睾丸素混淆巯基蛋白酶同源物（参见<PDOC00126型>).
• 向日葵花粉特异性蛋白SF3。
• 鸡肉zyxin。Zyxin是一种低丰度粘附斑块蛋白，具有与CRP相互作用。
• 参与产孢的酵母蛋白LRG1[4].
• 酵母rho型GTPase激活蛋白RGA1/DBM1。
• 秀丽隐杆线虫同源盒蛋白ceh-14。
• 秀丽隐杆线虫同源盒蛋白unc-97。
• 酵母假想蛋白YKR090w。
• 秀丽隐杆线虫假想蛋白C28H8.6。

这些蛋白质通常有一个结构域的两个串联拷贝，称为LIM（Lin-11 Isl-1 Mec-3），位于其N终端段。Zyxin和paxillin是例外情况是它们分别包含三个和四个LIM域他们的C末端。在适生性中，isl-1、LH-2、lin-11、lim-1至lim-3，lmx-1、ceh-14和mec-3有一个同源盒结构域，约50到95个氨基酸LIM域后的酸。

在LIM结构域中，有七个保守的半胱氨酸残基和一个组氨酸。这些保守残基后面的排列是C-x（2）-C-x（16,23）-H-x（2。LIM域结合两个锌离子[5]. LIM不结合DNA，相反，它似乎起到了蛋白质相互作用的界面。我们开发了一种跨越LIM域的前半部分。