描述
真核蛋白激酶[1,2,三,4,5]是属于广泛的蛋白质家族,共享一个共同的保守催化核心丝氨酸/苏氨酸和酪氨酸蛋白激酶。有许多蛋白激酶催化结构域中的保守区。我们已选择其中两个区域用于构建签名模式。第一个区域,即位于催化结构域的N末端,是一种富含甘氨酸的赖氨酸残基附近的残基延伸,如图所示参与ATP绑定。第二个区域,位于催化结构域的中心部分,包含一个保守的天冬氨酸对酶的催化活性很重要的残渣[6];我们导出了该区域的两种特征模式:一种是丝氨酸特有的/苏氨酸激酶和其他酪氨酸激酶。我们还开发了基于中的路线的纵断面[1]覆盖整个催化器域。
注:如果分析的蛋白质包含两个蛋白激酶特征它是蛋白激酶的可能性接近100%
注:在原核生物中也发现了真核型蛋白激酶比如黄色粘球菌[11]和假结核耶尔森菌。
注:上述模式自年发布以来已更新[7].
通过电子邮件联系专家:亨特·T·。
奎因·A.M。
上次更新时间:2006年4月/模式已修订。
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技术部分
本文件涵盖的PROSITE方法(包括工具和信息):
工具书类
1 | 作者 | 汉克斯S.K。亨特·T·。 |
标题 | 蛋白激酶6。真核蛋白激酶超家族:激酶(催化)结构域的结构和分类。 |
来源 | FASEB J.9:576-596(1995)。 |
公共医疗ID | 7768349 |
2 | 作者 | 亨特·T·。 |
标题 | 蛋白激酶分类。 |
来源 | 方法酶学。200:3-37(1991). |
公共医疗ID | 1835513 |
三 | 作者 | 汉克斯S.K。奎因·A.M。 |
标题 | 蛋白激酶催化域序列数据库:一级结构保守特征的鉴定和家族成员的分类。 |
来源 | 方法酶学。200:38-62(1991). |
公共医疗ID | 1956325 |
4 | 作者 | 汉克斯S.K。 |
来源 | 货币。操作。结构。《生物学》1:369-383(1991)。 |
5 | 作者 | 汉克斯S.K。奎因·A.M。亨特·T·。 |
标题 | 蛋白激酶家族:催化结构域的保守特征和推导系统发育。 |
来源 | 《科学》241:42-52(1988)。 |
公共医疗ID | 3291115 |
6 | 作者 | 奈顿D.R。郑建华。Ten Eyck L.F.公司。阿什福德V.A。Xunong N.-H.公司。泰勒S.S。索瓦茨基J.M。 |
标题 | 环磷酸腺苷依赖性蛋白激酶催化亚单位的晶体结构。 |
来源 | 《科学》253:407-414(1991)。 |
公共医疗ID | 1862342 |
8 | 作者 | 本纳·S。 |
来源 | 《自然》329:21-21(1987)。 |
9 | 作者 | 柯比R。 |
标题 | 氨基糖苷磷酸转移酶抗性基因的进化起源。 |
来源 | 《分子进化杂志》。30:489-492(1990). |
公共医疗ID | 2165531 |
10 | 作者 | 利特勒E。斯图亚特公元。奶酪M.S。 |
来源 | 《自然》358:160-162(1992)。 |
11 | 作者 | 穆诺兹·多拉多J。Inouye S.公司。Inouye M。 |
来源 | 细胞67:995-106(1991)。 |
版权
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