PROSITE文件PDOC00988型[对于PROSITE条目PS01285]

凝血因子5/8 C型结构域（FA58C）特征和图谱

凝血因子V和VIII含有重复两次的C末端，约150个氨基酸的结构域，称为F5/8 C型、FA58C或C1/C2样结构域。已注意到C1/C2之间的远距离序列相似性因子V和VIII的结构域以及盘状蛋白，其包含磷脂结合凝集素家族和其他与黏附有关的蛋白质相互作用[1].

在凝血因子V和VIII中，重复域构成更大的功能域，促进与阴离子磷脂的结合血小板和内皮细胞的表面[2]. 的C末端域凝血因子VIII的第二个FA58C重复序列（C2）显示为负责磷脂酰丝氨酸结合，对活动至关重要[三,4].

FA58C畴的晶体结构已经解决[5]（请参见<PDB：1CZS公司>). 它展示了一个扭曲的果冻卷β-桶图案，包括八股反向平行的股线排列成两个β片。的下部β-桶的特点是碱性残留物占优势三个相邻的突出环在脂质结合中起关键作用。这个真菌半乳糖氧化酶的半乳糖结合域具有结构与FA58C相似。这三个相邻的环在已预测将酶固定在植物细胞壁上的区域。这个可能表示循环区域的公共绑定角色。

在其他细胞外和膜中也检测到类似的结构域蛋白质[6,7,8]具体如下：

• 母乳脂肪球EGF因子8（MFGM），在乳汁中表达和精子。它可能与磷脂结合有关。它包含2个EGF-like重复序列后接2份FA58C。
• 神经毛蛋白（A5抗原），一种钙非依赖性细胞粘附分子在某些神经元回路形成过程中发挥作用。序列包含2个CUB域（请参阅<PDOC00908文件>、2个FA58C域和1个MAM域（请参见<PDOC00604型>).
• 蚕蛾血细胞素，一种参与自卫的体液凝集素机制。它由2个FA58C结构域组成，一个C型凝集素结构域（参见<PDOC00537型>)，2个VWFC域（请参见<PDOC00928型>)和CTCK（参见<PDOC00912型>).
• 具有羧肽酶活性的转录抑制因子人类AEBP1这可能与调节成骨细胞。AEBP1包含FA58C的单个副本。鼠标AEBP1较短在其N末端，并且缺少部分FA58C域。
• 牛Sco-spondin，由年的副分泌器官分泌并参与调节神经元聚集。它包含至少2个类EGF域、1个FA58C域和3个LDLRA域。
• 中隔连接和血液所需的果蝇神经氨酸酶IV-神经屏障的形成和功能。与神经氨酸酶I-α相比和III-α，由6个LamG结构域和3个EGF-样重复序列组成，神经氨酸酶IV中的N末端LamG被FA58C结构域取代。
• 哺乳动物接触蛋白相关蛋白（CASPR），涉及蛋白质相互作用。
• 哺乳动物酪氨酸蛋白激酶受体EDDR1（CAK、DDR1、TRKE等）和NTRK3（TKT或TYRO10），它们都包含FA58C域的一个副本。
• 秀丽隐杆线虫假定酪氨酸蛋白激酶G01D9.2、F11D5.3和C25F6.4。

FA58C在大多数蛋白质中包含两个保守的半胱氨酸，它们连接二硫键作用域的末端[9,10,11]. 另一种二硫化物键位于MFGM中第二个FA58C结构域的C端附近[11].

+------------------------------------------------------------------------+|                                                               +-+      ||                                                               | |      |CxPLGxxxQITASxxxxxRLxxxxWxxxxWXXXxxxQGxxxxxxxxxxxxGNxxxxxxxxxRxPxcLRxExGC**************                          ************

“C”：涉及二硫键的保守半胱氨酸。“c”：半胱氨酸参与MFGM中的二硫键。“x”：任何氨基酸。“*”：图案的位置。大写字母：保守残基。

我们为FA58C开发了两种模式。第一个位于中间第二个覆盖C末端。我们还开发了一个跨整个领域的配置文件。该配置文件还可以识别真菌半乳糖氧化酶和一些细菌透明质酸酶和唾液酸酶包含与FA58C结构域相关的保守区域的蛋白质家族[1].