PROSITE徽标

PROSITE文件PDOC00908文件[对于PROSITE条目PS01180]
CUB域配置文件


描述

CUB域[1,2]是约110的胞外结构域残留物存在于功能多样的,主要是发育中的调节蛋白。几乎所有的CUB结构域都含有四个保守的半胱氨酸可能形成两个二硫键(C1-C2、C3-C4)。的结构CUB结构域被预测为β-桶,类似于免疫球蛋白。

已发现含有CUB结构域的蛋白质如下所示。

  • 哺乳动物补体子成分C1s/C1r。C1q、C1s和C1r构成钙依赖络合物C1,是经典的第一组分补体系统的途径。这两种蛋白质都包含两个CUB结构域,一个EGF-like结构域、两个CCP结构域和一个胰蛋白酶家族丝氨酸蛋白酶域(请参见<PDOC00124型>).
  • 仓鼠丝氨酸蛋白酶Casp。Casp是一种调节性和降解I型和IV型胶原和纤维连接蛋白的催化链钙的存在。它显示了与C1相同的模块化架构和C1r。
  • Ra反应因子(RARF)的哺乳动物补体激活成分。这种蛋白质,也称为P100,是一种蛋白酶,可以分解C4补码的组成部分。它显示了与C1相同的模块化架构和C1r。
  • 脊椎动物肠肽酶(EC3.4.21.9),一种II型膜蛋白肠道刷状缘,激活胰蛋白酶原。它位于催化轻链和多域重链中的最小值2个LDL受体样结构域,一个MAM结构域(参见<PDOC00604型>),SRCR域(请参见<PDOC00348公司>)和CUB域。
  • 脊椎动物骨形态发生蛋白1(BMP-1),一种诱导表达金属内肽酶的软骨和骨形成活动。BMP-1的果蝇同源物是背腹模式Tolloid蛋白,这是正常的背部发育所必需的。紫色海胆是一种同源蛋白,叫做SuBMP。所有这些分子都具有锌金属蛋白酶结构域(参见<PDOC00129型>)和不同数量的CUB(在小鼠BMP-1和Tolloid中最多5个)和EGF-like域。
  • 海胆囊胚蛋白BP10和SpAN。这两种蛋白质都由2个CUB结构域、一个EGF-like结构域和一个锌金属蛋白酶结构域。
  • 秀丽隐杆线虫假想蛋白F42A10.8和R151.5。两者都有蛋白质由CUB结构域、EGF样结构域和锌组成-金属蛋白酶结构域。
  • 神经毛蛋白(A5抗原),一种钙非依赖性细胞粘附分子在某些神经元回路形成过程中发挥作用。序列包含2个CUB域,2个FA58C域(请参阅<PDOC00988型>)和MAM域(请参见<电话:00604>).
  • 海胆纤维蛋白I和III。这些蛋白质形成顶端细胞外基质的组成部分。这两种蛋白质包含CUB域,后跟可变数量的类EGF域和C-末端亲和素样结构域(参见<PDOC00499型>).
  • 哺乳动物透明质酸结合蛋白TSG-6(或PS4),一种血清和生长因子诱导蛋白可能参与细胞-细胞和细胞-基质炎症和肿瘤发生过程中的相互作用。TSG-6包含一个“链接”域后接CUB域。
  • 哺乳动物精子黏附素(参见<PDOC00758号>)由CUB域组成。
  • 爪蟾胚胎蛋白UVS.2,在背前期表达发展。它包含2个CUB域。

对于CUB域的敏感检测,我们开发了一个配置文件跨越整个域。

通过电子邮件联系专家:

博克·P。

上次更新时间:

2001年12月/修改了配置文件。

-------------------------------------------------------------------------------


技术部分

本文件涵盖的PROSITE方法(包括工具和信息):

联邦商业银行PS01180型;CUB域配置文件(矩阵)


工具书类

1作者博克P。贝克曼G。
标题CUB域。发育调节蛋白中广泛存在的模块。
来源分子生物学杂志。231:539-545(1993).
公共医疗ID8510165

2作者博克·P。
标题补体成分C1r/C1s、骨形态发生蛋白1和非洲爪蟾发育调节蛋白UVS.2具有共同的重复序列。
来源FEBS信函。282:9-12(1991).
公共医疗ID2026272



PROSITE的版权归SIB瑞士生物信息研究所所有根据知识共享署名-NonCommercial-NoDerivatives发布(CC BY-NC-ND 4.0)许可,参见prosite_license.html.

其他

以原始PROSITE文档格式查看条目
以原始文本格式查看条目(无链接)