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PROSITE文件电话:00374[用于PROSITE条目PS00345]
Ets-域签名和配置文件


描述

禽白血病病毒E26是一种复制缺陷型逆转录病毒鸡的混合红/髓系白血病。E26病毒携带两种不同的病毒致癌基因、v-myb和v-ets。该癌基因的ets部分是必需的成红细胞增多症的诱导。V-ets和c-ets-1,其细胞祖细胞,已显示[1]成为核DNA结合蛋白。Ets-1略有不同从v-ets的羧基末端区域。在大多数物种中经测序,c-ets-1存在于替代物产生的各种亚型中剪接和差异磷酸化。

许多蛋白质与v-ets/c-ets-1具有相似区域,已找到,如下所示:

  • 已在哺乳动物、鸡、爪蟾和果蝇。
  • 人类ELF-1,一种似乎是T细胞所必需的转录因子-细胞受体介导的HIV-2基因的反式激活。
  • 哺乳动物ELK-1、ELK-3(也称为Net或SAP-2)和ELK-4(也称为作为SRF辅助蛋白1(SAP-1)),它们都与血清反应因子(SRF)。
  • 人类ERF,一种与HI元件结合的有效转录阻遏物Ets-2启动子。
  • 人类ERG。
  • 人类ERM。
  • 哺乳动物ETV1,一种转录激活物。
  • FLI-1,一种序列特异性转录激活剂。
  • 腺病毒E1A增强子结合蛋白(E1A-F)(ETV4)(PEA3)。
  • PU.1(也称为Spi-1),一种与富含嘌呤序列结合的蛋白质,PU-box,可以作为淋巴特异性增强剂。PU.1可能是一种转录激活物,可能与巨噬细胞或B细胞的分化或激活。在小鼠中,Spi-1是一种与小鼠急性朋友型红白血病有关的癌基因。
  • Spi-B是一种结合PU-box的转录因子。
  • GA结合蛋白(GAPB)α亚单位。GAPB是一种转录因子能够与富含嘌呤的重复序列(GA重复序列)相互作用。
  • 果蝇蛋白elg-1。
  • 果蝇蛋白pokkuri(pok)(也称为yan),是一种阴性光感受器发育的调节器。
  • 果蝇蛋白点(pnt)是神经胶质细胞所必需的互动。
  • 果蝇蜕皮激素诱导蛋白74E。

所有这些蛋白质都包含一个保守结构域,即“ETS结构域”[2345]参与DNA绑定。它似乎能识别富含嘌呤的序列[5].该结构域含有约85至90个氨基酸,富含芳香族和正电荷带电残留物。它通常定位于蛋白质的C末端,除ELF-1、ELK-1、ELK-3、ELK-4和ERF外,在N末端。

我们导出了ETS域的两个签名模式。第一个是基于结构域N末端的高度保守区域,而第二个是基于域的第二个三分之一中的区域。个人资料跨越整个域。

上次更新时间:

2006年4月/模式已修订。

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技术部分

本文件涵盖的PROSITE方法(包括工具和信息):

ETS_DOMAIN_1PS00345型;Ets-域签名1(PATTERN)

ETS_DOMAIN_3PS50061标准;Ets-域配置文件(矩阵)

ETS_DOMAIN_2PS00346型;Ets-域签名2(PATTERN)


工具书类

1作者Reddy E.S.P.公司。拉奥·V.N。
标题人类c-ets-1原癌基因DNA结合活性的定位和调节。
来源《癌症研究》50:5013-5016(1990)。
公共医疗ID2165853

2作者卡里姆F.D。Urness有限公司。Thummel碳钢。克莱姆斯M.J。McKercher S.R.公司。塞拉达A。范·贝弗伦C。Maki R.A.公司。冈瑟公司。Nye J.A.公司。
标题ETS域:一种新的DNA结合基序,识别富含嘌呤的核心DNA序列。
来源《基因发展》4:1451-1453(1990)。
公共医疗ID2253872

3作者麦克劳德·K。莱普林斯D。斯特林·D·。
来源生物化学趋势。科学。17:251-256(1992).

4作者劳德特五世。尼尔·C。Duterque-Coquillaud M。勒普林斯·D·。斯特赫林D。
标题ets基因家族的进化。
来源生物化学。生物物理学。Res.Commun公司。190:8-14(1993).
公共医疗ID8422262

5作者Wasylyk B.公司。哈恩S.L。Giovane A。
标题转录因子的Ets家族。
来源欧洲生物化学杂志。211:7-18(1993).
公共医疗ID8425553

6作者王春阳。彼得尼亚克B。Ho I.-C.公司。汤普森C.B。莱顿J.M。
标题进化保守的Ets家族成员表现出不同的DNA结合特异性。
来源《实验医学杂志》175:1391-1399(1992)。
公共医疗ID1569404



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