描述
“同源盒”是由60个氨基酸组成的蛋白质结构域[1,2,三,4,5]第一个在一些果蝇同源异型和分段蛋白中鉴定。它后来发现在许多其他动物中保存得非常好,包括脊椎动物。该结构域通过螺旋转螺旋型结合DNA结构。一些含有同源盒结构域的蛋白质发挥着在发展中发挥重要作用。已知这些蛋白质中的大多数是序列特异性DNA结合转录因子。同源框域具有也发现与酵母交配型区域非常相似蛋白质。这些是序列特异性DNA结合蛋白,起着主控作用通过控制细胞基因表达实现酵母分化的开关特定类型的时尚。
同源框结构域的示意图如下所示。这个螺旋-回转-螺旋区域由符号“H”(表示螺旋)和“t”(表示旋转)。
xxxxxxxxxxxxXXXxxxxxxxxxxx HHHHH tttHHHH2HHHH-xxxxxxxxx| | | | | | |1 10 20 30 40 50 60
我们开发的检测同源盒序列的模式是24个残基长跨越同源盒域的位置34到57。
注:含有同源盒结构域的蛋白质可以在根据它们的序列特征,分为不同的亚科。我们有开发了触角保守元素的特定模式,雕刻成对的家庭。
通过电子邮件联系专家:布尔格林T.R。
上次更新时间:2006年4月/修改了图案。
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技术部分
本文件涵盖的PROSITE方法(包括工具和信息):
工具书类
1 | 作者 | Gehring W.J.公司。 |
来源 | (In)《家庭基因指南》,Duboule D.编辑,第1-10页,牛津大学出版社,牛津,(1994)。 |
2 | 作者 | 布尔格林T.R。 |
来源 | (In)《家庭基因指南》,Duboule D.编辑,第25-72页,牛津大学出版社,牛津,(1994)。 |
三 | 作者 | Gehring W.J.公司。 |
来源 | 生物化学趋势。科学。17:277-280(1992). |
5 | 作者 | 斯科菲尔德P.N。 |
来源 | 《神经科学趋势》。10:3-6(1987). |
版权
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