新版本的IgBLAST(1.16.0)在这里!
增加了在区域末端3'延伸J基因排列的能力(图1)。 这允许您查看由于序列相似性较低而不包括的未对齐基。
新版本的IgBLAST(1.15.0)在这里!
支持标准对齐格式和AIRR格式中的新框架区域4(FWR4)注释功能。 将之前的“-pennive”参数重命名为-V_penalty,以与其他IgBLAST惩罚选项保持一致。 恢复域注释(即FWR/CDR)的恒定内部BLAST搜索参数,以便此过程不受用户提供的参数的影响。 修正了某些小鼠VK和大鼠VH生殖系基因的FWR/CDR注释。
IgBLAST 1.9.0版本包括AIRR重排报告
NCBI的新版本:IgBLAST 1.7.0和Sequence Viewer 3.21
IgBLAST 1.7.0版本
指定在匹配V、D和J基因时是否允许VDJ连接处重叠核苷酸。 设置自定义J基因不匹配惩罚 在子区域表中报告CDR3启动和停止位置 使用排列长度而不是百分比身份作为击球得分相同的击球的决胜分,提高了V、D、J基因分配的准确性。