BLAST现在提供RefSeq Select数据库,用于更快的搜索和更好的结果

RefSeq选择为人类和小鼠提供一组高质量的转录物和蛋白质序列;原核生物,RefSeq select是RefSeq上注释的蛋白质集参考和代表基因组.你现在可以在核苷酸和蛋白质上搜索这些集合爆炸服务。新的数据库是RefSeq选择rna序列RefSeq选择蛋白质(图1)。图1。新的BLAST RefSeq Select rna(顶面板)和蛋白质(底面板)数据库和结果。搜索使用了红系己糖激酶1转录本(NM_033496.3号)和蛋白质(NP_277031.1型)作为查询。蛋白质BLAST搜索仅限于梭状芽孢杆菌(分类:186801)突出原核生物匹配。

对这些更紧凑的数据库进行搜索运行得更快,搜索结果定义更明确,更容易解释。您还可以从BLAST db FTP目录用于本地BLAST安装。您还可以使用BLAST+Docker图像.

请写信给我们blast-help@ncbi.nlm.nih.gov让我们知道你对这些新数据库的看法。

 

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