结构查看器iCn3D 2.15.0,具有新的渲染、注释和对齐功能

 iCn3D2.15.0现已在NCBI网站上发布GitHub上的版本。若要使用更新的web应用程序,请从分子模型数据库(MMDB),打开结构摘要页面,然后单击分子图形中的“全功能3D查看器”按钮。例如,您可以检索包含术语的结构SARS-COV-2型,单击感兴趣的结构,然后单击“全功能3D查看器。“您也可以打开iCn3D并使用“文件”菜单例如,通过ID检索结构6个月或从本地计算机打开结构文件。spike_port(峰值保护)图1。iCn3D显示SARS-COV-2棘突蛋白的结构(6个月)通过保守残基的自定义着色和其他冠状病毒棘突蛋白的多重序列比对。2.15.0中提供的一些新功能包括将自定义颜色应用于特定残基或链的能力,以及添加多条路线作为轨迹的能力

A类带实况示例的图库现在包括SARS-CoV-2相关结构,如图1中显示的尖峰蛋白,展示了可以使用iCn3D查看和分析结构的多种方法。这个iCn3D Web API文档描述了如何在您自己的网页中使用iCn3D结构查看器。请参阅MMDB新闻页面以获取iCn3D中可用新功能的更详细列表以及一些有用的示例。

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