NCBI推出数据集集合这是一种新的资源,可以让您轻松地跨NCBI数据库收集数据。我们的第一个版本允许您通过用户友好的方式查找和下载所有真核生物的基因组序列和注释数据web界面.
我们的网络界面还提供了一个交互式分类树,让您可以浏览您最喜欢的生物体。我们目前正在测试NCBI实验室环境。若要试用,请输入分类名称或程序集加入,然后单击搜索结果面板中的“获取数据”按钮。
以下是搜索时的外观“猿类”:
对于细菌和病毒基因组,请使用我们的命令行界面或RESTful API.
获取基因组数据比以往更直观。您可以通过输入组件登录名、NCBI分类ID或任何税级的分类名称(科学或通用)(例如,“猿”或“乳酸杆菌”)来找到所需的数据。
默认情况下,下载的内容包括基因组fasta序列和作为zip文件在BD行李格式。您还可以包括注释数据,如gff3、gbff、转录物和蛋白质fasta序列。立即尝试NCBI数据集让我们知道你怎么想!