调整您的脚本:FTP站点上BLAST数据库的新排列和命名!

作为我们宣布,的新默认数据库版本爆炸+数据库版本5。为了完成到新版本的转换,我们将修改BLAST上的目录结构和命名约定FTP数据库目录。我们希望在以下方面做出改变2020年2月4日.

下面是我们将要更改的内容的列表:

  1. blastdb目录底部的所有数据库(/爆破/db/)将是dbV5版本。
  2. 版本5数据库将不再将“_v5”作为存档或数据库名称的一部分。
  3. 我们将把dbV4数据库移动到v4子目录(/blast/db/v4/)。
  4. 现在遗留的dbV4数据库归档文件的名称中将包含“_v4”(例如,nr_v4.00.tar.gz);我们不会重命名存档中的文件。
  5. 我们将不再更新dbV4数据库。
  6. 我们将冻结云目录(/爆炸/数据库/云/)2020年1月13日之后没有新条目。
  7. 我们将只提供FASTA目录中的nr、nt、swissprot和pdbaa文件(/爆破/db/FASTA/).

请调整脚本或过程以适应更改!

如果您有任何问题或疑虑,请联系我们.

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