月份：2018年2月

PubMed的EDirect将于3月5日开始

PubMed的EDirect将于3月5日开始

从2018年3月5日星期一开始，国家医学图书馆（NLM）将介绍PubMed的EDirect，《内幕人士访问NLM数据指南》的一部分。

这个新扩展的互动研讨会系列将向新用户介绍使用EDirect以您需要的格式准确访问PubMed数据的基本知识。在五个90分钟的课程中（加上可选的“办公时间”），学生将学习如何使用EDirect命令访问PubMed，设计自定义输出格式，创建基本数据管道以快速高效地获取数据，并制定简单的策略来解决现实世界中PubMed-数据收集的挑战。EDirect需要访问Unix环境，但我们将在课程开始前发送Windows和Mac计算机的简单安装说明。无需事先掌握Unix知识；欢迎新手用户！继续阅读“PubMed的EDirect将于3月5日开始” →

3月7日NCBI会议纪要：NCBI书架上免费提供教科书

3月7日NCBI会议纪要：NCBI书架上免费提供教科书

下一个NCBI分钟重点介绍了NCBI书架上可用的一些高度使用的经典教科书（免费！），指出了最近添加的一些新教科书，介绍了为什么一些出版商和作者认为这是提高读者群的宝贵资源，以及如何通过在NCBI书架上添加新的和更新的现有教科书加入进来。

日期和时间：2018年3月7日，星期三，美国东部时间下午12:00–12:30

之后注册，您将收到一封确认电子邮件，其中包含有关参加网络研讨会的信息。现场演示几天后，您可以在NCBI YouTube频道。您可以在网络研讨会和课程页面.

自1999年以来，NCBI与出版商和作者合作，为读者提供了一种额外的方式来访问他们的产品。NCBI书架位于美国国家医学图书馆，用户可以自由访问书籍、报告和文档。经典教科书是一些最受欢迎和使用最频繁的条目，每个月都有成千上万的人在使用他们最喜欢的书！

NCBI真核基因组注释管道预测的rRNA、snRNA和snoRNA模型

这个NCBI真核基因组注释管道现在包括对更多非编码RNA的预测。从开始软件版本8.0、rRNAs、snRNAs和snoRNAs通过使用HMM模型搜索真核生物基因组预测无线射频AM以下是在玉米注释版本102中预测的rRNA盒的例子。这些新的小RNA类型是除了miRNAs和tRNAs之外的另一种类型，这些miRNA和tRNAs早已被管道注释。

组装B73 RefGen_v4的玉米支架NW_017972167.1上的rRNA盒
图1：组装B73 RefGen_v4的玉米支架NW_017972167.1上的rRNA盒。顶部轨迹显示Annotation Release 102中带注释的18S、5.8S和28S rRNA亚单位。这三个基因在之前的注释中缺失，并替换了错误的非编码基因预测（参见注释版本101，中间轨道）。底部轨迹显示由RepeatMasker标识的重复。rRNA重复序列的边界与预测的18S和28S rRNA基因精确匹配。

看看我们是什么正在注释在真核重组测序基因组注释状态页面上。

Map Viewer退役：新的FTP目录路径

Map Viewer退役：新的FTP目录路径

去年10月，我们宣布将NCBI的地图查看器替换为基因组数据查看器（GDV）。下面是有关如何访问旧版Map Viewer FTP内容的更多详细信息，以及一些帮助您过渡到GDV的信息。

正如我们去年秋天宣布的那样，我们不再更新地图查看器FTP目录。为了避免混淆目录名的含义，我们将更改Map Viewer FTP区域中物种目录下的CURRENT和PREVIOUS目录，使其不再指向数据。然而，FTP站点上仍然可以获得现有数据。

继续阅读“Map Viewer退役：新FTP目录路径” →

具有沿袭、类型和主机信息的新分类法文件

具有沿袭、类型和主机信息的新分类法文件

NCBI现在正在生成一组新的分类文件，其中包括分类单元的分类谱系、类型菌株和材料的信息以及宿主信息。这些文件对维护NCBI数据本地安装的人员特别有用。

您可以下载新的存档(新税转储.tar.gz)来自FTP站点上的分类目录(ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/taxonomy/new_taxdump/). 新文件是typematerial.dmp、typeoftype.dmp、rankedlineage.dmp、fullnamelinead.dmp、，
taxidlineage.dmp和host.dmp。请参阅自述文件获取文件内容的详细信息。

没有新内容的原始分类法文件归档将以其原始名称保持可用，税务转储.tar.gz以下部分显示了猴子物种的条目洛米颈古猿从新排名的血统和类型材料文件。继续阅读具有沿袭、类型和主机信息的新分类法文件 →

2月14日NCBI分钟：如何快速从NCBI检索序列

2月14日NCBI分钟：如何快速从NCBI检索序列

2018年2月14日星期三，NCBI将举办一场网络研讨会，向您展示如何快速从NCBI检索任何格式的序列。

日期和时间：2018年2月14日星期三12:00 PM–12:30 PM EST

是否需要快速获取FASTA或NCBI中其他格式的蛋白质或核苷酸序列？本《NCBI分钟》将向您展示如何使用核苷酸和蛋白质网页、NCBI URL以及最灵活的方式，通过访问E-Utilities API的命令行EDirect客户端来实现这一点。

之后注册，您将收到一封确认电子邮件，其中包含有关参加网络研讨会的信息。现场演示几天后，您可以在NCBI YouTube频道。您可以在网络研讨会和课程页面.

2018年3月12日至14日，北卡罗来纳州研究三角黑客马拉松

2018年3月12日至14日，北卡罗来纳州研究三角黑客马拉松

这个北卡罗来纳大学生物信息学和计算生物学课程NCBI将于2018年3月12日至14日在北卡罗来纳大学教堂山分校举办数据科学黑客马拉松。除了文本、图像和序列处理外，黑客马拉松期间处理的项目还将涉及一般生物信息学和基因组分析。

这项活动是为研究人员举办的，包括学生和博士后，他们已经参与使用大型数据集或开发用于高通量实验分析的管道。一些项目可能涉及其他非科学开发人员、数学家或图书馆员。

要参加活动，您必须应用并能够前往位于教堂山的北卡罗来纳大学校园（详见下文）。 应用程序到期日2017年2月12日星期一，美国东部时间晚上11:59。

继续阅读“2018年3月12日至14日，北卡罗来纳州研究三角黑客马拉松” →

NLM网络研讨会：访问NLM数据的内幕人士指南：欢迎使用PubMed的电子工具（美国东部时间2月13日星期二下午1点）

NLM网络研讨会：访问NLM数据的内幕人士指南：欢迎使用PubMed的电子工具（美国东部时间2月13日星期二下午1点）

想用PubMed做更多事情吗？

想要以您想要的格式提取您需要的PubMed数据吗？

梦想创建自己的PubMed工具或界面，但不知道从哪里开始？

请于美国东部时间2月13日星期二下午1点加入我们，参加一个为期一小时的介绍性网络研讨会，该研讨会旨在向您传授更强大、更灵活的访问NLM数据的方法，从PubMed和其他NCBI数据库的应用程序编程接口（API）开始。本演示文稿是《内幕人士指南》的一部分，该系列的目标读者是那些有通过传统Web界面使用PubMed经验的图书馆员和其他信息专家，但现在想深入挖掘。继续阅读“NLM网络研讨会：访问NLM数据的内幕人士指南：欢迎使用PubMed的电子工具（美国东部时间2月13日星期二下午1点）” →

2月7日网络研讨会“如何在您的机构举办NCBI式黑客马拉松”

2月7日网络研讨会“如何在您的机构举办NCBI式黑客马拉松”

2018年2月7日，星期三，NCBI将举办一场网络研讨会，向您展示如何在自己的机构计划和举办NCBI风格的黑客马拉松。

日期和时间：2018年2月7日星期三12:00 PM–1:00 PM EST

在此处注册:http://bit.ly/2zYU7Kp

NCBI在美国各地举办了为期2-3天的黑客马拉松比赛。在这些活动中，参与者在小型协作小组中就工作流、脚本或应用程序进行工作，以创建生物信息学解决方案来解决文本挖掘、next-gen序列分析、医学信息学等领域的问题。Hackathon项目的代码可在公共NCBI Hackathon GitHub站点.

之后注册，您将收到一封确认电子邮件，其中包含有关参加网络研讨会的信息。现场演示几天后，您可以在NCBI YouTube频道。您可以在网络研讨会和课程页面.