月份:2018年1月

YouTube上的新视频:NCBI资源、QuickBlastP、E-Utils API密钥更新以及API密钥的高级使用

需要了解NCBI提供的内容吗?或者只是觉得你没有充分利用NCBI资源?在NCBI YouTube频道上查看NCBI最新录制的NCBI分钟网络研讨会。

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RefSeq 86版现已公开

RefSeq 86版现已公开

参考序列86版现在可以在线访问,通过FTP文件以及通过NCBI的编程实用程序。截至2018年1月8日,此完整版本包含基因组、转录和蛋白质数据,包含149493466条记录,包括102133844个蛋白质、21370778个RNA和75218个生物体的序列。该版本在几个目录中作为完整的数据集提供,并按逻辑分组进行划分。

以下是两个重要注意事项:;请参阅RefSeq发行说明了解更多信息。

非人类SNP数据丢失

从2017年12月开始,在每日FTP文件和本次完整版本(2018年1月)中,从所有RefSeq FTP文件中删除了非人类SNP。

HPRD功能已删除

我们从人类转录本和蛋白质RefSeq记录中删除了一组最初从HPRD导入的特征。

2018年核酸研究数据库期刊5篇NCBI文章

2018年核酸研究数据库期刊5篇NCBI文章

这个2018年核酸研究数据库问题介绍了NCBI工作人员的几篇论文,涵盖了数据库的现状和未来,包括CCDS、ClinVar、GenBank和RefSeq。这些论文也可以在公共医学。要阅读文章,请单击下面列出的PMID编号。

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GenBank 223.0版通过FTP、Entrez和BLAST提供

GenBank 223.0版通过FTP、Entrez和BLAST提供

GenBank第223.0版(2017年12月15日)有206293625条传统记录(包括非散装TSA),包含249722163594个碱基对的序列数据。此外,共有551063065条WGS记录包含2466098053327个序列数据碱基对,201559502条TSA记录包含181394660188个序列数据碱对,12695198条TLS记录包含4458042616个序列数据基对。

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RefSeq中17个新的NCBI注释,用于猫、玉米、小丑鱼等

RefSeq中17个新的NCBI注释,用于猫、玉米、小丑鱼等

11月和12月NCBI真核基因组注释管道在中发布了新注释参考序列针对以下生物体:

  • 公子小丑(小丑海葵)
  • 雕塑拟步甲(树皮蝎子)
  • 地中海实蝇(地中海果蝇)
  • 大南瓜(冬季南瓜)
  • 南瓜(弯颈南瓜)
  • 果蝇(飞)
  • 果蝇(飞)
  • 家猫(家猫)
  • 马铃薯叶甲(科罗拉多马铃薯甲虫)
  • 马来斑马(斑马mbuna)
  • 欧洲木犀 钾盐(野橄榄)
  • Onthophagus公司金牛(甲虫)
  • 毛白羽苔藓(乌干达红Colobus)
  • 背阔线虫(黄尾琥珀杰克)
  • 斜纹夜蛾(蛾)
  • 斑剑鱼(南方海蜇)
  • Zea mays公司(玉米)

查看有关的更多详细信息真核RefSeq基因组注释状态页面.