月份：2017年10月

2018年NCBI参考序列的变化特征变化

自2018年3月起，RefSeq基因组组装记录中不再包含SNP变异特征——带有NC_、NT_、NW_和AC_加入前缀的染色体和连续记录。此更改同时影响ASN.1和平面文件记录。由于变异体的数量已经很大，而且还在不断增加，因此从这些大型基因组记录中删除SNP特征将大大减少RefSeq FTP文件的大小，并使下载和处理变得更容易。我们将继续在以NG_为前缀的基因组记录、转录物（NM_、NR_、XM_、XR_）和蛋白质（NP_、XP_、YP_）序列中包含SNP。

提醒：截至2017年9月，NCBI已经停止接受dbSNP和dbVar中非人类SNP的提交.RefSeq平面文件将于2017年11月停止提供非人类变体数据。

订阅参考消息公告列表服务有关RefSeq的定期更新。

BLAST+2.7.1现已上市

在新版（2.7.1）中BLAST+可执行文件blastdbcmd可以更快地查找分类名称（例如，科学名称或通用名称）。我们还进行了一些低级改进，使BLAST能够更高效地执行多线程，特别是当可用内存不足时。

注意：一些LINUX和MacOSX用户可能会发现，他们需要增加进程允许的打开文件描述符的数量。可以使用“ulimit-n”（在bash下）轻松更改允许打开的文件描述符的数量。我们建议将限制设置为至少1024。

请参阅BLAST+发行说明了解更多信息。

IgBLAST 1.8.0版本

新版本的IgBLAST现已在上提供文件传输协议，以及上的新手册github。此版本有以下改进：

igblastn可执行文件现在可以更有效地多线程处理大型查询集。默认线程数现在是四个，但可以使用-num_threads选项进行更改。
igblastn可执行文件现在可以将SRA登录作为查询输入。搜索在本地计算机上运行，但查询是从NCBI的SRA存储库中检索的。请使用-SRA而不是-query选项来启用。
发现D和J基因的默认核苷酸错配惩罚值较低（分别从-4到-2和从-3到-2）。这提高了为中度突变序列找到最佳D和J基因命中的准确性。

我们的网络IgBLAST页面还使用了新的默认核苷酸错配惩罚值（即-2，用于查找D和J基因）。

IgBLAST有助于分析免疫球蛋白和T细胞受体可变结构域序列。

新流感病毒提交向导使流感序列提交更容易

NCBI现在提供了一个流感序列提交向导，使提交更容易，并将更快地为您提供登录号。要开始，请登录NCBI，转到提交门户并从GenBank部分选择“核糖体RNA（rRNA）、rRNA-ITS或流感序列”的链接。

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11月1日网络研讨会：介绍基因组数据查看器（GDV）

2017年11月1日，星期三，我们将举办一场关于GDV的网络研讨会，GDV是NCBI的全功能基因组浏览器。在本次网络研讨会中，您将学习如何探索和分析真核RefSeq基因组组装的序列和注释。我们将向您展示如何：

在整个组件中搜索基因、产品和其他标记，或跳到特定位置或范围
显示七个预选轨迹集中的任意一个，突出显示装配的各个方面，或者从您的NCBI帐户创建并加载您自己的自定义轨迹集。
加载并显示NCBI的GEO或SRA提交的路线数据。
上传您自己的注释和变量数据
在浏览器中的部件上显示BLAST或Primer-BLAST结果。

日期和时间：2017年11月1日星期三美国东部夏令时12:00-12:30

之后注册，您将收到一封确认电子邮件，其中包含有关参加网络研讨会的信息。现场演示结束后，网络研讨会将上传至NCBI YouTube频道。您可以在上了解未来的网络研讨会网络研讨会和课程页面.

NCBI的Genome Data Viewer（GDV）取代Map Viewer

这个基因组数据查看器（GDV)现在是NCBI的主要基因组浏览器，取代了我们原来的基因组浏览器Map Viewer。GDV是一个现代基因组浏览器，与Map Viewer相比有了重要改进。这些包括序列级细节和自动更新过程，以跟上基因组测序、组装和注释的快速步伐。

APOBE3CB_GDV公司_ — Genome Data Viewer主页（顶部面板）和浏览器视图（底部面板）

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GenBank 222.0版通过FTP、Entrez和BLAST提供

GenBank 222.0版（2017年10月14日）有203953682条传统记录（包括非散装TSA），包含244914705468个碱基对的序列数据。此外，有508825331条WGS记录包含2318156361999个序列数据碱基对，192754804条TSA记录包含172909268535个序列数据碱对，9479460条TLS记录包含2993818315个序列数据基对。

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