月份:2017年9月

10月4日NCBI会议记录:创建、链接和共享您的书目(PubMed&ORCID)

10月4日NCBI会议记录:创建、链接和共享您的书目(PubMed&ORCID)

2017年10月4日,NCBI工作人员将举办一场关于作者消歧和使用ORCID ID优势的网络研讨会。

消除常见作者姓名的歧义在任何领域都很难,但如果PubMed引用了您已发表的研究,我们可以帮助您查找引用,创建书目,并与他人共享您的出版物列表。

在本次网络研讨会中,我们还将讨论快速注册一个免费的、唯一的标识符的优点,即使您的名字发生了变化,该标识符也将保持不变。

日期和时间:2017年10月4日星期三12:00 PM–12:30 PM EDT

之后注册,您将收到一封确认电子邮件,其中包含有关参加网络研讨会的信息。现场演示结束后,网络研讨会将上传至NCBI YouTube频道。您可以在网络研讨会和课程页面.

Magic BLAST 1.3.0发布了新功能和改进

Magic-BLAST的最新版本(v.1.3.0)提供了改进的灵敏度和更快的运行时间,以及许多其他新功能和改进。这些功能包括将对齐截止分数设置为读取长度的函数、最大编辑距离选项和SRA文件的可选本地缓存。有关这些改进和其他改进的更多信息,请参阅发行说明。您可以从下载新的可执行文件NCBI FTP现场。

Magic-BLAST是一种针对整个基因组或转录组绘制下一代大规模RNA或DNA序列的工具。阅读更多信息在这里.

14个新的NCBI RefSeq基因组注释可用

八月NCBI真核基因组注释管道在中发布了新注释参考序列针对以下生物体:

  • 菠菜
  • 番木瓜(番木瓜)
  • 内华达州Zootermopsis nevadensis(白蚁)
  • 多刺棘豆
  • 念珠菌(跳蚤)
  • 向日葵
  • 棘鱼(角冠海星)
  • 桃蚜
  • 苦瓜
  • 菜粉蝶(白菜)
  • 褐飞虱
  • 暗果蝇
  • 犬狼疮(犬)
  • 鲎(大西洋马蹄蟹)

查看有关的更多详细信息真核RefSeq基因组注释状态页面.

RefSeq 84版可用

RefSeq 84版可用

参考序列现在可以通过以下途径在线访问84版文件传输协议以及通过NCBI的编程实用程序。

该完整版本包含截至2017年9月11日可用的基因组、转录和蛋白质数据,包含140627690条记录,包括95563598个蛋白质、20356598个RNA和72965个生物体的序列。

该版本在几个目录中作为完整的数据集提供,并按逻辑分组进行划分。参见RefSeq发行说明了解更多信息。

逐步取消对非人类生物的支持

截至2017年9月1日数据库SNP数据库变量数据库具有停止接受非人类生物的提交。非人类变异的提交现在将被欧洲变体档案,我们在国际核苷酸序列数据库中的合作伙伴之一(INSDC公司).

NCBI发布新设计的dbSNP RefSNP Report–Alpha版本

NCBI发布新设计的dbSNP RefSNP报告–Alpha版本

美国国立生物技术信息中心数据库SNP很高兴宣布一个新设计的Reference SNP(RefSNP,rs)Report网页,为访问单个RefSNP记录提供增强的性能和演示。此Alpha版本的报告允许从重新设计的dbSNP构建系统.

新的RefSNP报告(alpha版本)。您可以看到博客文章中描述的所有部分,如摘要部分和侧栏菜单。
图1。rs268的dbSNP RefSNP Report Alpha。

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糖生物学概要,第三版和新糖网站现已在NCBI上提供

糖生物学概要,第三版和新糖网站现已在NCBI上提供

糖生物学是研究聚糖(所有活细胞合成的糖链)的结构、生物合成、生物学和进化的科学,是自然科学中一个迅速发展的领域,与基础研究、生物医学和生物技术的许多领域都有着广泛的关系。

NCBI有两种新的糖生物学资源:该领域权威性工作的第三版,糖生物学基础,和一个新的NCBI聚糖网站其中包括一些有用的外部资源以及聚糖符号命名法(SNFG).

糖生物学要点

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YouTube上的两个新视频:SRA RunSelector和NCBI黑客马拉松

YouTube上的两个新视频:SRA RunSelector和NCBI黑客马拉松

我们上传了最近两次的录音NCBI分钟网络研讨会NCBI YouTube频道.

第一,“使用SRA RunSelector查找NGS数据集“,向您展示了如何使用提交数据集的元数据详细信息筛选SRA数据库。

 

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