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R.Apweiler、A.Bairoch、C.H.Wu、W.C.Barker、B.Boeckmann、S.Ferro、E.Gasteiger、H.Huang、R.Lopez、M.Magrane、M.J.Martin、D.A.Natale、C.O'Donovan、N.Redaschi和L.S.Yeh。 UniProt:通用蛋白质知识库。 《核酸研究》,32:115-1192004年。 网址:http://www.uniprot.org . B.Boeckmann、A.Bairoch、R.Apweiler、M.-C.Blatter、A.Estreicher、E.Gasteiger、M.J.Martin、K.Michoud、C.O'Donovan、I.Phan、S.Pilbout和M.Schneider。 SWISS-PROT专业知识库及其2003年的补充TrEMBL。 《核酸研究》,31:365-3702003年。 http://www.expasy.ch/cgi-bin/sprot-search-ful . B.Boeckmann、M.-C.Blatter、L.Famiglietti、U.Hinz、L.Lane、B.Roechart和A.Bairoch。 蛋白质多样性和功能多样性:Swiss-Prot在其生物学背景下的注释。 Comptes Rendus Biologies,328:882–8992005年。 H.J.伯恩斯坦。 RasMol的最新变化,重组变体。 《生物化学科学趋势》,25:453-4552000年。 网址:www.rasmol.org/ . K.Bryson、L.j.McGuffin、R.L.Marsdenl、j.j.Ward、j.S.Sodhi和D.T.Jones。 伦敦大学学院的蛋白质结构预测服务器。 核酸研究,33:W36–W38,2005年。 D.L.Bergmann、L.Laaksonen和A.Laaksonen。 液体混合物中溶剂化结构的可视化。 J摩尔图模型,15:301–3061997。 M.Carson和C.E.Bugg。 蛋白质带状模型的算法。 《分子图形学杂志》,第121-122页,1986年。 S.N.Crivelli、E.Eskow、B.Bader、V.Lamberti、R.Byrd、R.Schnabel和T.Head-Gordon。 蛋白质结构预测的物理方法。 《生物物理杂志》,82:36–492002年。 M.L.康诺利。 蛋白质和核酸的溶剂可及表面。 《科学》,221:709–7131983年。 Tolga Can、Yujun Wang、Yuan Fang Wang和Jianwen Su.FPV:使用Java 3D快速蛋白质可视化 TM(TM) 《2003年ACM应用计算研讨会论文集》,第88-95页。 ACM出版社,2003年。 http://www.ceng.metu.edu.tr/ ~tcan/fpv/ . W.L.德拉诺。 PyMOL分子图形系统。 DeLano Scientific,美国加利福尼亚州圣卡洛斯,2002年。 http://www.pymol.org . S.哈夫曼。 带折痕边的Catmull/Clark曲面的交互式渲染。 视觉计算机,18:286–2982002。 H.Huang、Z.Z.Hu、B.E.Suzek和C.H.Wu。 PIR集成了蛋白质数据库和数据检索系统。 数据科学,3:163–1742004。 安德烈亚斯·哈尔姆(Andreas Halm)、拉尔斯·奥芬(Lars Offen)和迪特尔·费尔纳(Dieter Fellner)。 交互速率下复杂分子带状结构的可视化。 《信息可视化会议记录》,第八届国际会议(IV’04),第737-744页。 IEEE计算机学会,2004年。 安德烈亚斯·哈尔姆(Andreas Halm)、拉尔斯·奥芬(Lars Offen)和迪特尔·费尔纳(Dieter Fellner)。 生物浏览器:快速蛋白质可视化的框架。 在Ken Brodlie、David Duke和Ken Joy,编辑,Eurographics/IEEE VGTC可视化研讨会,第287-294页,英国利兹,2005年。 欧洲制图协会。 C.W.V.霍格。 Cn3D:新一代三维分子结构查看器。 《生物化学科学趋势》,22:314-3161997年。 ftp://ftp.ncbi.nih.gov/cn3d/ . Jmol(焦耳)。 http://www.jmol.org . T.Klein和T.Ertl。 使用离散粒子模型说明磁场线。 2004年视觉、建模和可视化研讨会论文集(VMV’04),第387-394页,2004年。 [KHM+03]奥利弗·克莱洛斯(Oliver Kreylos)、伯恩德·哈曼(Bernd Hamann)、纳尔逊·马克斯(Nelson L.Max)、西尔维亚·克里维利(Silvia N.Crivelli)和E.Wes Bethel。 交互式蛋白质操作。 2003年第14届IEEE可视化会议论文集。 拉克逊南。 用于分析和显示分子动力学轨迹的图形程序。 摩尔图杂志,10:33-341992年。 B.Lee和F.M.Richards。 蛋白质结构的解释:静态可及性的估计。 分子生物学杂志。, 55:379–400, 1971. S.M.Larson、C.D.Snow、M.R.Shirts和V.S.Pande。 计算基因组学:理论与应用,第章 折叠@主页 和 基因组@主页 :使用分布式计算解决计算生物学中以前难以解决的问题。 地平线出版社,2004年。 L.J.McGuffin、K.Bryson和D.T.Jones。 PSIPRED蛋白质结构预测服务器。 生物信息学应用注释,16:404–4052000。 [PGH+04]E.F.Pettersen、T.D.Goddard、C.C.Huang、G.S.Couch、D.M.Greenblatt、E.C.Meng和T.E.Ferrin。UCSF Chimera——探索性研究和分析的可视化系统。 《化学合成杂志》,25:1605-16122004。 http://www.cgl.ucsf.edu/chimera网站/ . J.S.理查森。 蛋白质结构的解剖学和分类学。 高级蛋白质化学。, 第167-339页,1981年。 J.L.Sussman、D.Lin、J.Jiang、N.O.Manning、J.Prilusky、O.Ritter和E.E.Abola。 蛋白质数据库(PDB):生物大分子三维结构信息数据库。 结晶学报。, D 54:1078-10841998年。 http://www.pdb.org . H.Steen和M.Mann。 肽测序的abc(和xyz)。 《自然评论分子细胞生物学》,5:699-7112004。 R.Sayle和E.J.Milner-White。 RasMol:面向所有人的生物分子图形。 生物化学趋势。 科学。, 20:374, 1995. 网址:http://www.rasmol.org/ . 米歇尔·桑纳和亚瑟·奥尔森。 简化曲面:计算分子曲面的有效方法。 生物聚合物,38:305-3201996年。 W3C公司。 SOAP 1.2版第0部分:底漆。 Y.Zhang和J.Skolnick。 使用当前的pdb库可以解决蛋白质结构预测问题。 程序。 国家。 阿卡德。 科学。, 102:1029–1034, 2005.
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内政部 : https://doi.org/10.1007/978-3-540-72630-2_15 发布者名称 : 施普林格、柏林、海德堡 打印ISBN : 978-3-540-72629-6 在线ISBN : 978-3-540-72630-2 电子书包 : 数学与统计学 数学与统计学(R0)