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BioBrowser-大分子结构的可视化和访问

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系列丛书的一部分: 数学与可视化((数学视觉))

总结

基于一个跨学科研究项目的结果,本文提出了将有关大分子(蛋白质、DNA、RNA)不同部分/结构功能的知识直接嵌入到该分子的3D模型中。因此,在访问特定领域的知识时,3D可视化成为一个重要的用户界面组件,类似于使用户能够访问各种信息的web浏览器。

在原型实现中-命名为生物浏览器-与生物研究相关的各种信息由数据库使用细粒度访问控制进行管理。这还支持基于用户权限限制对部分材料的访问。该数据库由SOAP web服务提供,因此(当然,在通过登录过程识别自己之后)可以通过使用分子的3D模型远程查询、更改或添加一些信息。所有这些作用都是在分子的子结构上进行的。这些可以通过简单的查询语言选择,也可以通过鼠标在3D模型中选择它们。

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Offen,L.,Fellner,D.(2008年)。生物浏览器-可视化和访问大分子结构。摘自:Linsen,L.,Hagen,H.,Hamann,B.(主编)《医学和生命科学中的可视化》。数学与可视化。施普林格,柏林,海德堡。https://doi.org/10.1007/978-3-540-72630-2-15

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