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2018.10.30更新至3.9。 添加了`--dun_trim_sequence`选项以重建并修复了GFF.py 2018.10.15更新至3.8版。 修复`sam_to_gff3.py`缩进 2018.10.12更新至3.7版。 现在重建将接受kmer大小“-k”大于200。 2018.05.21更新至3.5版。 修复了可访问性错误。 2018.05.14更新至3.4版。 修复了在`find_bulles()`中不添加权重的错误。 2018.04.16更新至3.2版。 固定了解开均聚物的边缘情况。 2018.03.09更新至3.1版。 将所有GMAP替换为minimap2!! 算法的其余部分保持不变,但最终的强制2(来自强制.fa)的选择现在可能有所不同。 将中肯->中肯2选择严格性增加到>=98%cov和>=98%identity。 2017.10.23更新至2.1版。 固定测试。 2017.07.24更新至2.0版。 主要变化是增加了预聚类选项,以加快家庭查找。 2017.06.21更新至1.9版。 修复了多个最优解决方案的LP解算器错误。 添加了`--output_prefix`以附加到consort2 ID。 2017.03.06更新至1.7版。 自动删除GMAP DB以减少空间使用。 递归处理大输入(联合收割机/联合收割器后)。 2017.01.11更新至1.6版。 修复了测试中的更改。 2016.11.22更新至1.5版。 在循环检测中增加了自动k-mer大小增量(高达k=200)。 2016.10.20更新至1.4版。 增加了检测周期的功能,并尝试将k-mer更新为更大的大小以适应这种情况。 还发现气泡检测中的一个错误导致了错误。 两者都是固定的。 2016.03.30更新至1.3版。 “splice_graph.contract_sinks”中的重要错误修复了以前意外地与具有多个传出边的前身收缩汇的问题,这会导致在存在大量具有可选3”端的异构体的情况下进行不正确的重建。 2016.03.21更新至1.2版。 修复了更多与边缘案例(尤其是由不明显的图形循环引起的)相关的小错误。 2016.03.02更新至1.1版。 发现了几个边境案件导致程序崩溃的案例。 固定的。