摘要
识别网络中的差异已成为许多生物应用中的典型问题。现有方法试图通过直接比较两个网络的估计结构或测试两个总体中协方差或逆协方差矩阵相同的零假设来实现这一目标。然而,估算方法并没有提供不确定性度量,例如,第页-值,而现有的测试方法可能会导致误导性结果,如本文所示。为了解决这些缺点,我们建议定性的检验连通性的假设测试框架结构在这两个网络中是相同的。如果目标是识别差异连接的节点或边,那么我们的框架尤其合适。现有的方法无法测试这些假设并提供相应的不确定性度量。理论上,我们表明,在适当的条件下,我们的建议在检验定性假设时正确地控制了I类错误率。从经验上讲,我们使用癌症基因组学中的模拟研究和应用来证明我们的建议的性能。
资金筹措表
这项工作得到了美国国立卫生研究院拨款R01GM114029和R01GM133848以及美国国家科学基金会拨款DMS-1561814的部分支持。
引用
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赵森。
阿里·肖杰(Ali Shojaie)。
“网络差异连接分析。”
附录申请。斯达。
16
(4)
2166 - 2182,
2022年12月。
https://doi.org/10.1214/21-AOAAS1581
问询处
收到日期:2019年12月1日;修订日期:2021年3月1日;发布日期:2022年12月
欧几里德项目首次提供:2022年9月26日
数字对象标识符:10.1214/21-AOAS1581
关键词:生物网络,差异连接,高维数据,拉索,显著性检验
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