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2020年2月 基于模型的染色质可及性和基因表达单细胞数据联合分析方法
林志祥,马赫迪·扎马尼霍米,蒂莫西·戴利,闪亮的马,王永雄
统计师。科学。 35(1): 2-13 (2020年2月)。 内政部:10.1214/19-STS714

摘要

非监督方法,包括聚类方法,对于单细胞基因组数据的分析至关重要。基于模型的聚类方法在单细胞基因组学领域尚未得到充分研究,并且具有量化聚类结果不确定性的优点。在这里,我们开发了一种基于模型的方法,用于单细胞染色质可及性和基因表达数据的综合分析。我们表明,结合这两种类型的数据,我们可以更好地分离潜在的细胞类型。还开发了一种高效的马尔可夫链蒙特卡罗算法。

引用

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林志祥。 马赫迪·扎马尼霍米(Mahdi Zamanighomi)。 蒂莫西·戴利。 闪亮的马。 王永红(Wing Hung Wong)。 “基于模型的染色质可及性和基因表达单细胞数据联合分析方法。” 统计师。科学。 35 (1) 2 - 13, 2020年2月。 https://doi.org/10.1214/19-STS714

问询处

发布日期:2020年2月
欧几里德项目首次推出:2020年3月3日

数学科学网:MR4071354型
数字对象标识符:10.1214/19-STS714

关键词:贝叶斯建模,耦合聚类,MCMC公司,单细胞基因组学

版权所有©2020数学统计研究所

第35卷•第1期•2020年2月
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