摘要
背景
结果
结论
背景
结果
在线数据库和已发布的数据存储库
集群的解释
示例
讨论
方法
工具书类
Cherry JM、Adler C、Ball C、Chervitz SA、Dwight SS、Hester ET、Jia Y、Juvik G、Roe T、Schroeder M、, 等 .: SGD:酵母基因组数据库。 核酸研究 1998, 26: 73–79.10.1093/nar/26.1.73 Mewes HW、Frishman D、Gruber C、Geier B、Haase D、Kaps A、Lemcke K、Mannhaupt G、Pfeiffer F、Schuller C、, 等 .: MIPS:基因组和蛋白质序列数据库。 核酸研究 2000, 28: 37–40.10.1093/nar/28.1.37 Costanzo MC、Crawford ME、Hirschman JE、Kranz JE、Olsen P、Robertson LS、Skrzypek MS、Braun BR、Hopkins KL、Kondu P、, 等 .: YPD、PombePD和WormPD:生物知识库的模型生物体积,蛋白质信息的集成资源。 核酸研究 2001, 29: 75–79.10.1093/nar/29.1.75 Greenbaum D、Luscombe NM、Jansen R、Qian J、Gerstein M: 相互关联不同类型的基因组数据,从蛋白质组到分泌组:“了解功能。 基因组研究 2001, 11: 1463–1468. 10.1101/gr.207401 Wu LF、Hughes TR、Davierwala AP、Robinson MD、Stoughton R、Altschuler SJ: 使用重叠转录簇对酿酒酵母基因功能进行大规模预测。 自然基因 2002, 31: 255–265. 1038/ng906年10月10日 Blaschke C、Oliveros JC、Valencia A: 挖掘与表达式数组关联的函数信息。 功能整合基因组学 2001, 1: 256–268. 2007年10月14日/101420000036 Bouton CM,Pevsner J: DRAGON视图:注释微阵列数据的信息可视化。 生物信息学 2002, 18日: 323–324. 10.1093/生物信息学/18.2.323 Hughes TR、Marton MJ、Jones AR、Roberts CJ、Stoughton R、Armour CD、Bennett HA、Coffey E、Dai H、He YD、, 等 .: 通过表达式概要进行功能发现。 单元格 2000, 102: 109–126. Kumar A、Cheung KH、Ross-Macdonald P、Coelho PS、Miller P、Snyder M: 三重:酿酒酵母基因功能数据库。 核酸研究 2000, 28: 81–84.10.1093/nar/28.181 基因本体联盟: 创建基因本体资源:设计与实现。 基因组研究 2001, 11: 1425–1433. 10.1101/gr.180801 Schultz J、Milpetz F、Bork P、Ponting CP: SMART是一种简单的模块化体系结构研究工具:信令域识别。 美国国家科学院程序 1998年, 95: 5857–5864. 10.1073/pnas.95.11.5857 贝特曼A、伯尼E、塞鲁蒂L、杜宾R、埃特维勒L、埃迪SR、格里菲斯-琼斯S、豪-吉隆坡、马歇尔M、桑纳默EL: Pfam蛋白质家族数据库。 核酸研究 2002, 30: 276–280. 10.1093/nar/30.1.276 Tong AH、Evangelista M、Parsons AB、Xu H、Bader GD、Page N、Robinson M、Raghibizadeh S、Hogue CW、Bussey H、, 等 .: 酵母缺失突变体有序阵列的系统遗传分析。 科学类 2001, 294: 2364–2368. 10.1126/科学.1065810 Uetz P、Giot L、Cagney G、Mansfield TA、Judson RS、Knight JR、Lockshon D、Narayan V、Srinivasan M、Pochart P、, 等 .: 酿酒酵母蛋白质相互作用的综合分析。 自然 2000, 403: 623–627. 10.1038/35001009 Ito T、Chiba T、Ozawa R、Yoshida M、Hattori M、Sakaki Y: 综合双杂交分析探索酵母蛋白相互作用组。 美国国家科学院程序 2001, 98: 4569–4574. 10.1073/pnas.061034498 Gavin AC、Bosche M、Krause R、Grandi P、Marzioch M、Bauer A、Schultz J、Rick JM、Michon AM、Cruciat CM、, 等 .: 通过蛋白质复合物的系统分析对酵母蛋白质组进行功能组织。 自然 2002, 415: 141–147. 10.1038/415141a Ho Y、Gruhler A、Heilbut A、Bader GD、Moore L、Adams SL、Millar A、Taylor P、Bennett K、Boutilier K、, 等 .: 用质谱法系统鉴定酿酒酵母中的蛋白质复合物。 自然 2002, 415: 180–183. 10.1038/415180a Kumar A、Agarwal S、Heyman JA、Matson S、Heidtman M、Piccirillo S、Umansky L、Drawid A、Jansen R、Liu Y、, 等 .: 酵母蛋白质组的亚细胞定位。 基因开发 2002, 16: 707–719页。 10.1101/gad.970902 Ross-Macdonald P、Coelho PS、Roemer T、Agarwal S、Kumar A、Jansen R、Cheung KH、Sheehan A、Symoniatis D、Umansky L、, 等 .: 通过转座子标签和基因断裂对酵母基因组进行大规模分析。 自然 1999, 402: 413–418. 10.1038/46558 Giaever G、Chu AM、Ni L、Connelly C、Riles L、Veronneau S、Dow S、Lucau-Danila A、Anderson K、Andre B、, 等 .: 酿酒酵母基因组的功能分析。 自然 2002, 418: 387–391. 10.1038/自然00935 Tavazoie S、Hughes JD、Campbell MJ、Church RJ、总经理: 遗传网络结构的系统测定。 自然基因 1999, 22: 281–285. 10.1038/10343 Hubert L、Arabie P: 比较分区。 分类杂志 1985, 2: 193–218. Ge H、Liu Z、Church总经理、Vidal M: 酿酒酵母转录组和相互作用组映射数据之间的相关性。 自然基因 2001, 29: 482–486. 10.1038/ng776 Kemmeren P、van Berkum NL、Vilo J、Bijma T、Donders R、Brazma A、Holstege足球俱乐部: 通过基因组尺度数据的综合分析验证蛋白质相互作用和功能注释。 摩尔细胞 2002, 9: 1133–1143. 本杰米尼Y,霍奇伯格Y: 控制错误发现率:一种实用且强大的多重测试方法。 英国皇家统计学会杂志B辑 1995年, 57: 289–300. Cho RJ、Huang M、Campbell MJ、Dong H、Steinmetz L、Sapinoso L、Hampton G、Elledge SJ、Davis RW、Lockhart DJ: 人类细胞周期中的转录调控和功能。 自然基因 2001, 27: 48–54. Kim SK、Lund J、Kiraly M、Duke K、Jiang M、Stuart JM、Eizinger A、Wylie BN、Davidson GS: 秀丽隐杆线虫基因表达图谱。 科学类 2001, 293: 2087–2092. 10.1126/科学.1061603 Marcotte EM、Pellegrini M、Thompson MJ、Yeates TO、Eisenberg D: 蛋白质功能全基因组预测的组合算法。 自然 1999, 402: 83–86. 10.1038/47048