金属有机化合物\(第5em段)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

三聚甲基水[2-(4-甲基嘧啶-2-基磺胺基)乙酰基-κO(运行)]锡(IV)

聊城大学东城学院,山东252059,中华人民共和国,b条聊城大学化学化工学院,聊城252059,中华人民共和国c(c)中华人民共和国临阴市郯城中学,276000
*通信电子邮件:张俊宏@lcu.edu.cn

(2013年4月28日收到; 2013年5月8日接受; 2013年5月15日在线)

在标题化合物中,[Sn(CH)(C)7H(H)7N个2O(运行)2S) (H)2O) ],锡四、原子具有扭曲的三角-双锥配位几何结构,2-(4-甲基嘧啶-2-硫基)乙酸配体的一个羧基O原子和一个水分子的O原子位于轴向位置,三个甲基位于赤道位置。在晶体中,分子相互连接通过O-H…O和O-H…N氢键,形成沿[010]传播的双链。

相关文献

相关结构见:张等。(2007[张,J.-H.,马,C.-L.和张,R.-F.(2007)。《结晶学报》E63,m2161。]); 等。(2011[朱强、张瑞荣(2011).《晶体学报》E67,m1834.]).

【方案一】

实验

水晶数据
  • [锡(CH)(C)7H(H)7N个2O(运行)2S) (H)2O) ]

  • M(M)第页= 365.01

  • 单诊所,P(P)21/c(c)

  • = 7.7658 (4) Å

  • b条= 11.0901 (4) Å

  • c(c)= 18.8261 (8) Å

  • β= 113.575 (4)°

  • V(V)= 1486.05 (11) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=15.00毫米−1

  • T型=293千

  • 0.05×0.04×0.04毫米

数据收集
  • Xcalibur(Eos,Gemini)衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(SADABS公司; Bruker,2007年[Bruker(2007)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。])T型最小值= 0.521,T型最大值= 0.585

  • 8393次测量反射

  • 2666个独立反射

  • 2151次反射>2个σ()

  • 整数= 0.059

精细化
  • [F类2> 2σ(F类2)] = 0.047

  • 水风险(F类2) = 0.132

  • S公司= 1.05

  • 2664次反射

  • 159个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=1.52埃−3

  • Δρ最小值=-0.78埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-小时A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-小时A类
臭氧-H3D类2010年1月 0.85 2.03 2.798 (6) 149
臭氧-H3F类●N1ii(ii) 0.85 2.14 2.884(7) 146
对称代码:(i)[-x+2,y+{\script{1\over2}},-z+{\sscript{3\over2{}]; (ii)x个,+1,z(z).

数据收集:智能(布鲁克,2007年[Bruker(2007)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2007年[Bruker(2007)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

支持信息


注释顶部

标题化合物是4-甲基嘧啶-2-巯基乙酸的三甲基锡酯,图1。锡原子Sn1的几何形状是一个略微扭曲的三角双锥,轴向被配体的原子O2和水分子的原子O3包围。轴向角O2-Sn1-O3为176.66(16)Ω,接近线性排列。甲基的三个碳原子位于赤道面上,三角C-Sn-C角之和为358.1°,说明三个甲基C原子与锡原子几乎共面。2.144(4)Au和2.488(5)Au的Sn-O距离比共价键锡和氧的长度(张等。,2007),但与其他三有机锡聚合物结构报告的相同距离相似(Zhu等。, 2011).

在晶体中,分子通过O-H··O和O-H··N氢键连接,形成沿[010]传播的双链;见表1和图2。

相关文献顶部

相关结构见:张等。(2007); 等。(2011).

实验顶部

该反应在氮气气氛下进行。将4-甲基嘧啶-2-巯基乙酸(1 mmol)和乙醇钠(1 mmol/)添加到Schlenk烧瓶中乙醇(30 ml)的搅拌溶液中并搅拌30 min。然后将三甲基氯化锡(1 mmmol)添加到反应器中,并在353 K下将反应混合物搅拌12 h。将所得澄清溶液在真空下蒸发。将产物从二氯甲烷结晶得到标题化合物的无色块状晶体[产率80%;M.p.430 K]。分析。C的计算值(%)10H(H)18N个2O(运行)SSn(Mr=365.01):C,32.90;H、 4.97节;N、 7.67节;发现(%):C,32.87;H、 4.94节;N、 7.71。

精细化顶部

水分子H原子被放置在计算位置,并被视为骑行原子:O-H=0.85 Au单位国际标准化组织(H) =1.5单位等式(O) 。C结合的H原子也被放置在计算位置,并被视为骑原子:对于CH和CH,C-H=0.93和0.96 AuH原子分别与单位国际标准化组织(H) =1.5单位等式(C-甲基)和=1.2单位等式(C) 对于其他H原子。精炼两个反射被省略为(I光突发事件-我计算)/ΣW>10。

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,2007);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2007);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2007);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题络合物的分子结构,带有原子标记。位移椭球是在50%的概率水平上绘制的。
[图2] 图2。标题化合物晶体包装轴线的局部视图。氢键显示为虚线;详见表1。
水三甲基[2-(4-甲基嘧啶-2-基磺胺基)乙酰基-κO(运行)]锡(IV)顶部
水晶数据 顶部
[锡(CH)(C)7H(H)7N个2O(运行)2S) (H)2O) ]F类(000) = 728
M(M)第页= 365.01D类x个=1.631毫克
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射,λ= 1.54184 Å
大厅符号:-P 2ybc2652次反射的细胞参数
= 7.7658 (4) Åθ= 4.0–70.5°
b条= 11.0901 (4) ŵ=15.00毫米1
c(c)=18.8261(8)ÅT型=293千
β= 113.575 (4)°块,无色
V(V)= 1486.05 (11) Å0.05×0.04×0.04毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
Xcalibur(Eos,双子座)[检查!BRUKER软件?]
衍射仪
2666个独立反射
辐射源:增强(Cu)X射线源2151次反射> 2σ()
石墨单色仪整数= 0.059
探测器分辨率:16.2563像素mm-1θ最大值= 67.3°,θ最小值= 4.7°
φ和ω扫描小时=69
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2007年)
k个=1313
T型最小值= 0.521,T型最大值= 0.585=2221
8393次测量反射
精细化 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:完整氢站点位置:从邻近站点推断
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.047受约束的氢原子参数
水风险(F类2) = 0.132 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0753P(P))2]
哪里P(P)= (F类o个2+2个F类c(c)2)/3
S公司= 1.05(Δ/σ)最大值= 0.001
2664次反射Δρ最大值=1.52埃
159个参数Δρ最小值=0.78埃
0个约束消光校正:SHELXL97型(谢尔德里克,2008),Fc*=kFc[1+0.001xFc2λ/罪(2θ)]-1/4
主原子位置定位:结构-变量直接方法消光系数:0.00176(18)
水晶数据 顶部
[Sn(CH)(C)7H(H)7N个2O(运行)2S) (H)2O) ]V(V)= 1486.05 (11) Å
M(M)第页= 365.01Z轴= 4
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射
= 7.7658 (4) ŵ=15.00毫米1
b条=11.0901(4)ÅT型=293千
c(c)= 18.8261 (8) Å0.05×0.04×0.04毫米
β= 113.575 (4)°
数据收集 顶部
Xcalibur(Eos,双子座)[检查!BRUKER软件?]
衍射仪
2666个独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2007年)
2151次反射> 2σ()
T型最小值= 0.521,T型最大值= 0.585整数= 0.059
8393次测量反射
精细化 顶部
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0470个约束
水风险(F类2) = 0.132受约束的氢原子参数
S公司= 1.05Δρ最大值=1.52埃
2664次反射Δρ最小值=0.78埃
159个参数
特殊细节 顶部

几何图形键距离、角度等已使用四舍五入分数坐标计算。所有su都是根据(全)方差协方差矩阵的方差估计的。在估计距离、角度和扭转角时考虑了单元esd

精细化.F的细化2对抗所有反射。加权R因子wR和拟合优度S基于F2,传统的R系数R基于F,对于负F,F设置为零2F的阈值表达式2>2西格玛(F2)仅用于计算R系数(gt)等,与选择反射进行细化无关。基于F的R系数2从统计上看,是基于F的因子的两倍,而基于ALL数据的R因子将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)单位国际标准化组织*/单位等式
锡10.88830 (6)1.02871 (3)0.61937 (2)0.0477 (2)
S1(第一阶段)0.8813(3)0.51496 (13)0.57463 (11)0.0572 (6)
O1公司1.0216 (7)0.7546 (4)0.6551 (2)0.0631(14)
氧气0.8531 (6)0.8672 (4)0.5524 (2)0.0559 (14)
臭氧0.9257 (8)1.2230 (4)0.6901 (3)0.082 (2)
N1型0.6645 (8)0.4207 (4)0.6350 (3)0.0534 (18)
氮气0.5982 (8)0.6263 (5)0.5937 (3)0.0566 (17)
C1类0.7227 (12)1.1295 (7)0.5191 (4)0.075 (3)
指挥与控制1.1824 (10)1.0401 (6)0.6541(5)0.071 (3)
C3类0.7556 (13)0.9649 (7)0.6896 (5)0.074 (3)
补体第四成份0.9201 (9)0.7672(5)0.5856 (4)0.049 (2)
C5型0.8680 (10)0.6603 (5)0.5312 (3)0.054 (2)
C6级0.6941(9)0.5235 (5)0.6040 (4)0.0457 (19)
抄送80.4562 (10)0.6241 (8)0.6160 (4)0.068 (3)
C9级0.4131 (11)0.5250 (8)0.6490 (5)0.071 (3)
C10号机组0.5225 (10)0.4220 (6)0.6579 (4)0.060 (2)
第12项0.4868 (13)0.3083 (7)0.6930 (5)0.091 (4)
甲型H1A0.617601.081700.486600.1130*
H1B型0.797701.150700.491000.1130*
H1C型0.678001.201500.534400.1130*
硫化氢1.237501.078400.703900.1070*
过氧化氢1.209701.086700.616900.1070*
过氧化氢1.233600.960500.657300.1070*
H3A型0.725400.881100.678800.1110*
H3B型0.642401.009900.679000.1110*
高度3厘米0.838300.974400.743200.1110*
H3D(高密度)0.968401.209500.738600.1230*
h3英尺0.819201.257200.675700.1230*
H5A型0.949700.660000.503400.0650*
H5B型0.740500.672000.493200.0650*
H8型0.382900.693000.608900.0820*
H9型0.314300.526300.665000.0850*
H12A型0.474700.241800.658600.1360*
H12B型0.372900.316600.701100.1360*
H12C型0.589800.293600.741700.1360*
原子位移参数(2) 顶部
单位11单位22单位33单位12单位13单位23
传感器10.0622 (3)0.0338 (3)0.0444 (3)0.0027 (2)0.0186 (2)0.0027 (2)
S1(第一阶段)0.0757(11)0.0341 (7)0.0735 (11)0.0025 (7)0.0420 (9)0.0056(7)
O1公司0.082 (3)0.050 (2)0.047 (2)0.007(2)0.015 (2)0.0018 (19)
氧气0.074 (3)0.038 (2)0.051 (2)0.004 (2)0.020 (2)0.0014 (18)
臭氧0.121 (5)0.046 (3)0.067 (3)0.009 (3)0.024 (3)0.009 (2)
N1型0.072 (4)0.035 (2)0.054 (3)0.010 (2)0.026 (3)0.004 (2)
氮气0.059 (3)0.048 (3)0.064 (3)0.005(2)0.026 (3)0.010 (2)
C1类0.103 (6)0.057 (4)0.053 (4)0.006 (4)0.018 (4)0.005(3)
指挥与控制0.052 (4)0.056 (4)0.091 (6)0.013 (3)0.013 (4)0.010 (4)
C3类0.098 (6)0.065 (5)0.079 (5)0.005 (4)0.057(5)0.010 (4)
补体第四成份0.063 (4)0.041 (3)0.051(4)0.018 (3)0.030 (3)0.011 (3)
C5型0.081 (5)0.036 (3)0.053 (3)0.012 (3)0.035 (3)0.004 (3)
C6级0.054 (4)0.034 (3)0.047 (3)0.009 (2)0.018 (3)0.006 (2)
抄送80.054 (4)0.076 (5)0.071 (5)0.014 (4)0.022 (4)0.018 (4)
C9级0.053 (4)0.093 (6)0.065 (5)0.001 (4)0.023 (4)0.002 (4)
C10号机组0.069 (4)0.058(4)0.049 (3)0.022 (3)0.021(3)0.003 (3)
第12项0.131 (8)0.067 (5)0.088 (6)0.033 (5)0.059 (6)0.004 (4)
几何参数(Å,º) 顶部
Sn1-O22.144 (4)C10-C12号机组1.500 (11)
Sn1-O32.488 (5)C1-H1A0.9600
锡1-C12.127 (7)C1-H1B型0.9600
锡1-C22.113 (9)C1-H1C型0.9600
锡1-C32.098 (10)C2-H2A型0.9600
S1-C5号机组1.792 (6)C2-H2B型0.9600
S1-C6号机组1.752 (8)C2-H2C型0.9600
O1-C41.236 (8)C3至H3A0.9600
氧气-C41.277 (7)C3-H3B型0.9600
臭氧-H3D0.8500C3-H3C型0.9600
臭氧-H3F0.8500C5-H5A型0.9700
N1-C6型1.342 (8)C5-H5B型0.9700
N1-C10型1.335 (10)C8-H8型0.9300
N2-C8气体1.328 (10)C9-H90.9300
N2-C6气体1.333 (8)C12-H12A型0.9600
C4-C5型1.512 (8)C12-H12B型0.9600
C8-C9型1.368 (12)C12-H12C型0.9600
C9-C10型1.393 (12)
O2-Sn1-O3176.66 (16)锡1-C1-H1C109
氧气-Sn1-C191.6 (2)H1A-C1-H1B型109
O2-Sn1-C295.7 (2)H1A-C1-H1C型109
O2-Sn1-C396.3(2)H1B-C1-H1C型109
O3-Sn1-C185.4 (2)锡1-C2-H2A109
O3-Sn1-C284.4 (2)锡1-C2-H2B109
O3-Sn1-C386.4 (3)锡1-C2-H2C109
C1-Sn1-C2型116.0 (3)H2A-C2-H2B型109
C1-Sn1-C3117.5 (4)H2A-C2-H2C型110
C2-Sn1-C3124.6 (3)H2B-C2-H2C型110
C5-S1-C6101.1 (3)锡1-C3-H3A109
Sn1-O2-C4120.4 (4)锡1-C3-H3B109
锡-O3-H3F109锡1-C3-H3C110
H3D-O3-H3F109H3A-C3-H3B型109
锡-O3-H3D110H3A-C3-H3C型109
C6-N1-C10116.0 (6)H3B-C3-H3C型109
C6-N2-C8型115.1 (6)S1-C5-H5A型108
O1-C4-C5型120.9 (5)S1-C5-H5B型108
O1-C4-O2125.4 (6)C4-C5-H5A型108
氧气-C4-C5113.8 (5)C4-C5-H5B型108
S1-C5-C4型116.4 (4)H5A-C5-H5B型107
S1-C6-N1型113.5 (5)N2-C8-H8型119
S1-C6-N2型119.1 (5)C9-C8-H8119
N1-C6-N2型127.4 (7)C8-C9-H9型121
N2-C8-C9型122.9 (8)C10-C9-H9型121
C8-C9-C10型117.7 (8)C10-C12-H12A型109
N1-C10-C9120.9 (7)C10-C12-H12B型109
N1-C10-C12型117.1 (7)C10-C12-H12C109
C9-C10-C12122.1 (8)H12A-C12-H12B型109
锡1-C1-H1A109H12A-C12-H12C型109
锡1-C1-H1B109H12B-C12-H12C109
C1-Sn1-O2-C4176.2 (6)C6-N1-C10-C90.4 (10)
C2-Sn1-O2-C467.5 (6)C6-N1-C10-C12179.8 (6)
C3-Sn1-O2-C458.3 (6)C8-N2-C6-S1型178.6 (5)
C6-S1-C5-C4型69.3 (6)C8-N2-C6-N1型1.1 (10)
C5-S1-C6-N1176.1 (5)C6-N2-C8-C91.6 (10)
C5-S1-C6-N23.6 (6)O1-C4-C5-S1型22.7(10)
锡-O2-C4-O16.7 (10)氧气-C4-C5-S1158.6 (5)
锡-O2-C4-C5174.7 (5)N2-C8-C9-C101.2 (12)
C10-N1-C6-S1179.6 (5)C8-C9-C10-N10.1 (11)
C10-N1-C6-N20.1(10)C8-C9-C10-C12号机组179.7 (7)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
臭氧-H3D类···O1公司0.852.032.798 (6)149
臭氧-H3F类···N1型ii(ii)0.852.142.884 (7)146
对称代码:(i)x个+2,+1/2,z(z)+3/2; (ii)x个,+1,z(z).

实验细节

水晶数据
化学配方[锡(CH)(C)7H(H)7N个2O(运行)2S) (H)2O) ]
M(M)第页365.01
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/c(c)
温度(K)293
,b条,c(c)(Å)7.7658 (4), 11.0901 (4), 18.8261 (8)
β(°)113.575 (4)
V(V))1486.05 (11)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)15
晶体尺寸(mm)0.05 × 0.04 × 0.04
数据收集
衍射仪Xcalibur(Eos,双子座)[检查!BRUKER软件?]
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2007年)
T型最小值,T型最大值0.521, 0.585
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
8393, 2666, 2151
整数0.059
(罪θ/λ)最大值1)0.598
精细化
[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.047、0.132、1.05
反射次数2664
参数数量159
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))1.52,0.78

计算机程序:智能(布鲁克,2007),圣保罗(布鲁克,2007),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
O3-H3D···O10.852.032.798 (6)149
O3-H3F···N1ii(ii)0.852.142.884 (7)146
对称代码:(i)x个+2,+1/2,z(z)+3/2; (ii)x个,+1,z(z).
 

致谢

作者感谢聊城大学基金(xo9013)、聊城大学晶体材料国家重点实验室(SF2012068)、山东省教育厅项目(J12LD13)和聊城大学青年科学基金(31805)的资助。

工具书类

第一次引用Bruker(2007)。智能,圣保罗SADABS公司.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Zhang,J.-H.,Ma,C.-L.和Zhang、R.-F.(2007)。《水晶学报》。E类63,m2161科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Zhu,Q.和Zhang,R.(2011)。《水晶学报》。E类67,m1834科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者

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