蒙特卡罗模拟表面诱导晶格模型蛋白质构象变化

维多利亚·卡斯特尔斯、杨少雄和保罗·R·范·塔塞尔
物理学。版本E65,031912–2002年3月5日出版

摘要

我们对吸附到固体表面的27段晶格模型蛋白质的热、结构和动力学特性进行了蒙特卡罗模拟。该蛋白质由以下序列组成A类B类其顺序和拓扑接触能量值被选择,以便(××立方)折叠状态发生在没有吸附表面的情况下[E.I.Shakhnovich和M.Gutin,Proc.Natl.Acad.Sci.USA90, 7195 (1993)]. 表面由一个位点平面组成,这些位点可以(i)与所有接触的蛋白质片段平等地相互作用(一个相同的亲和表面),或者(ii)与类型更强烈地相互作用A类接触段(一个A类亲和表面)。对于这两个表面,我们发现一个最初折叠的蛋白质的构象变化是从一个连续过渡到一个所有片段都与表面接触的结构开始的。然后部分再折叠到低能状态;这一步骤是连续的,导致等亲和力表面的完全表面接触,并被激活,导致表面接触的显著损失A类亲和曲面。我们还观察到平均表面接触程度较小(较大)(A类)亲和表面随着温度的升高而升高。

  • 收到日期:2000年12月26日

内政部:https://doi.org/10.103/PhysRevE.65.031912

©2002美国物理学会

作者和附属机构

维多利亚·卡斯特尔斯,杨绍雄、和保罗·范·塔塞尔

  • 密歇根州底特律市安东尼韦恩大道5050号韦恩州立大学化学工程与材料科学系48202

参考(需要订阅)

单击以展开
问题

第65卷,第。2002年3月3日

重用权限(&M)
Access选项
翻译和文案辅助广告的作者出版服务

需要授权


×
×

图像

×

注册以接收来自的定期电子邮件警报物理审查E

登录

取消
×

搜索


文章查找

粘贴引文或DOI

输入引文
×