aroma.afmetrix:大型Affmetrix微阵列数据集分析

跨平台R框架,方便处理任意数量的Affymetrix微阵列样本,而无需考虑计算机系统。限制可处理芯片数量的唯一参数是可用磁盘空间量。Aroma框架已成功用于处理成千上万阵列的研究。自2006年以来,该软件包一直在积极使用。

版本: 3.2.2
取决于: R(≥3.2.0),R.utils公司(≥ 2.9.0),aroma.core公司(≥ 3.2.0)
进口: 方法,R.方法S3(≥ 1.7.1),R.oo公司(≥ 1.23.0),R.cache公司(≥0.14.0),R.装置(≥ 2.16.1),R.文件集(≥ 2.13.0),阿罗玛阿帕德(≥ 0.6.0),MASS(质量)、花键、,矩阵统计(≥ 0.55.0),列表环境,未来
建议: 数据库接口(≥ 1.0.0),g平滑(≥ 0.1.7),R彩色啤酒(≥ 1.1-2),博科生物(≥ 2.28.0),生物遗传学(≥ 0.14.0),affxparser软件(≥1.40.0),阿菲(≥ 1.46.0),affyPLM公司(≥ 1.44.0),aroma.light公司(≥2.4.0),全球气候变化评估(≥ 2.40.0),利马(≥ 3.24.1),寡聚物(≥1.32.0),寡头类(≥ 1.30.0),pdInfoBuilder(≥ 1.32.0),预处理核心(≥1.28.0),Affymetrix数据测试文件,dChipIO公司(≥ 0.1.1)
出版: 2024-02-18
作者: 亨利克·本特森[aut,cre,cph],詹姆斯·布拉德,卡斯珀·汉森,皮埃尔·诺伊亚尔,伊丽莎白·普多姆,马克·罗宾逊[ctb],肯·辛普森
维护人员: 亨利克·本特森(Henrik Bengtsson)
错误报告: https://github.com/HenrikBengtsson/aroma.afymetrix/issues网站
许可证: LGPL-2.1型|LGPL-3型【扩展自:LGPL(≥2.1)】
网址: https://www.aroma-project.org/,https://github.com/HenrikBengtsson/aroma.afymetrix网站
需要编译:
引用: aroma.afmetrix引用信息
材料: 新闻
CRAN检查: aroma.afmetrix结果

文档:

参考手册: aroma.af-mettrix.pdf

下载内容:

包源: aroma.aff甲基_3.2.2.tar.gz
Windows二进制文件: r-预发布:aroma.afmethrix_3.2.2.zip压缩包,r版本:aroma.afmethrix_3.2.2.zip压缩包,r-oldrel:aroma.affymetrifx_3.2.2.zip
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):aroma.af-mettrix_3.2.2.tgz,r-release(arm64):aroma.af-mettrix_3.2.2.tgz,r-oldrel(arm64):aroma.af-mettrix_3.2.2.tgz,r-prerel(x86_64):aroma.af-mettrix_3.2.2.tgz,r-release(x86_64):aroma.af-mettrix_3.2.2.tgz
旧来源: aroma.afmetrix存档

反向依赖关系:

反向取决于: 痤疮,
反向进口: PECA公司

链接:

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