ashr:使用经验贝叶斯的自适应收缩方法

R包“ashr”实现了经验贝叶斯大规模假设检验与错误发现方法基于中提出的方法的速率(FDR)估计M.Stephens,2016年,“虚假发现率:新政”,<doi:10.1093/biostatistics/kxw041>. 可以应用这些方法每当两组汇总统计数据-估计影响和标准错误可用,就像可以应用“qvalue”一样到之前计算的p值。两个主要接口是provided:ash(),更人性化;和ash.workhorse(),它有更多的选项,面向高级用户。这个ash()和ash.workhorse()还提供了灵活的建模能够适应各种可能性的接口(例如。,正态、泊松)和混合先验(例如,均匀、正态)。

版本: 2.2-63
取决于: R(≥3.1.0)
进口: 矩阵、统计、图形、,卢比(≥ 0.10.5),树干规范,混合sqp,正方形,埃特伦特,逆伽马射线
链接到: 卢比
建议: 测试,针织物,rmarkdown公司,ggplot2,REBayes公司
出版: 2023-08-21
作者: 马修·斯蒂芬斯,彼得·卡博内托[aut,cre],代朝星[ctb],大卫·杰拉德,吕梦音[aut],孙磊[aut],Jason Willwerscheid[aut],南晓[aut],Mazon Zeng(曾荫权)
维护人员: 彼得·卡博内托(Peter Carbonetto)
错误报告: https://github.com/stephens999/ashr/issues
许可证: GPL(≥3)
网址: https://github.com/stephens999/ashr
需要编译:
材料: 新闻
在视图中: 贝叶斯主义者
CRAN检查: ashr结果

文件:

参考手册: ashr.pdf格式
渐晕图: 自适应收缩示意图

下载内容:

包源: 灰分2.2-63.tar.gz
Windows二进制文件: r-发展:灰烬-2.2-63.zip,r版本:灰烬-2.2-63.zip,r-oldrel:灰烬-2.2-63.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):阿什r_2.2-63.tgz,r-oldrel(arm64):灰烬2.2-63.tgz,r-release(x86_64):灰烬2.2-63.tgz
旧来源: ashr存档

反向依赖关系:

反向取决于: 捣碎机
反向进口: 细胞内核,清理机,差异绑定,梦想家,电子束纳米,fast主题,ldsep(低密度sep),柠檬醛2,混合两次,QTLE实验
反向建议: 绑定SiteFinder,DESeq2公司,闪光装置,ncvreg公司,顶级糖果
反向增强: 帕拉索

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=ashr链接到此页面。